Automatiser création pseudo-germlines, en particulier Dd2-Dd3, get-germline incomplet
Je ne sais pas pourquoi la deadline est aujourd'hui. Le but serait déjà d'avoir les fichiers suivants, une séquence par fichier :
- TRDD2.fa
- TRDD3.fa
- IGKKDE.fa
- IGKINTRON.fa Pour la combinaison (TRDV + TRDD2), cela devrait se faire directement par germlines.data / parser C++.
08182493 : Dd2 et Dd3 Il reste KDE et INTRON, on les récupère où ?
C'est Aurélie qui nous les avait envoyé. On les met sur vidjil.org ?
Ok, vidjil.org/germline (donc pour l'instant sur bioinfo...).
Avant de le fixer dans le marbre (peut-être en le rentrant en dur dans le git vidjil, dans germline), on refera des tests voir si les séquences sont bonnes / trop courtes / trop longues.
J'attends donc juste que vdj/web soit déployé sur bioinfo pour le mettre dans le script :)
Bon, je les ai mis à la main sur rbx. 0ad7c6bd
à faire plus tard : vérifier les séquences, les mettre directement dans le git vidjil
c'est bon actuellement