Sortir un alignement multiple de reads d'un clone
(similaire mais différent de #1972)
En répondant à #3290 je me rends compte qu'il serait possible de sortir automatiquement (mais à la demande, en cliquant quelque part) un alignement multiple d'un échantillon aléatoire de reads d'un clone.
Il suffit de lancer vidjil-algo
avec l'option -FaW
sur le germline du clone considéré (c'est donc assez rapide) puis de lancer un alignement multiple. Ce lancement peut se faire de manière asynchrone de la même manière que se fait l'analyse (mystérieuse) de la contamination (cf. #1744).
C'est une première étape qui permettrait ensuite #1972. Cette étape permettrait déjà aux utilisatrices et utilisateurs de vérifier des données que lesquelles des doutes existent.