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WIP: remove (in)complete filtering mechanism that was used with -i.

Mathieu Giraud requested to merge feature/clean-i into dev

Pour terminer #2153, il faut nettoyer le code. Ce qui existait avant est que les germlines étaient chargées dans un ordre bien défini : complètes, xxx, incomplètes. Je me demande si cela n'est pas là pour des raisons historiques (normalement l'ordre ne joue plus, uniquement la e-value).

94fa2a42 nettoie tout cela, mais il y a pour l'instant au moins un test qui ne passe pas. À regarder un jour.

@mikael-s

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