Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Graines différentes pour V et J : usage

#4226 · opened Mar 26, 2020 by Mathieu Giraud bio-analyze-more bio-germlines cpp-aho cpp-heuristic
- 0
updated Apr 23, 2020
Retirer les séquences de faible complexité des germlines ?

#4188 · opened Feb 18, 2020 by Mathieu Giraud !-reflexion bio-e-value cpp-heuristic
- 3
updated Jun 22, 2020
Séquences non recombinées mais KmerSegmentées à tort ?

#4056 · opened Nov 21, 2019 by Mathieu Giraud bio-e-value cpp-heuristic
- 2
updated Nov 23, 2019
On trouve un clone sur très peu d'identité.

#3981 · opened Sep 16, 2019 by Thonier Florian BRU-Bruxelles bio-e-value cpp cpp-filter-fine cpp-finesegmenter cpp-heuristic
- 2
updated Sep 16, 2019
Utilisation de getS() ou de la graîne avec Aho-Corasick

#3727 · opened Feb 12, 2019 by Mikaël Salson Heuristique 2.0 cpp cpp-aho cpp-heuristic dev-refactor
- 4
updated Feb 28, 2019
AFFECT_UNKNOWN à la fin des affectations avec Aho et probas

#3726 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud bio-e-value cpp-heuristic math-stats
- 0
updated Feb 12, 2019
Germline unexpected : comment remonter à la bonne germline ?

#3584 · opened Oct 23, 2018 by Mikaël Salson Heuristique 2.0 !-hard !-reflexion cpp cpp-heuristic
- 2
updated Apr 29, 2020
Agrandir la taille des graines pour limiter les faux positifs

#3388 · opened Jul 16, 2018 by Mikaël Salson Algo -- Important *-go cpp cpp-heuristic
- 1
updated Nov 23, 2019
Indexer séparément, mais à la suite, les up/down-stream

#3386 · opened Jul 16, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion bio-germlines-pseudo cpp cpp-heuristic
- 0
updated Jul 16, 2018
Liste des `SEG_METHOD_*`

#3385 · opened Jul 16, 2018 by Mathieu Giraud cpp cpp-heuristic
- 0
updated Feb 15, 2019
SEG_METHOD_123: Détecter les recombinaisons à trois, même si elles sont vues comme VJ normal

#3376 · opened Jul 13, 2018 by Mathieu Giraud !-hard cpp-heuristic
- 2
updated Jul 16, 2018
Une séquence passe en unexpected au lieu d'IGH

#3370 · opened Jul 12, 2018 by Mikaël Salson !-reflexion bio-germlines-pseudo cpp cpp-heuristic dev-tests-curated-vdj
- 1
updated Jul 13, 2018
Détection de séquences VJ particulières

#3357 · opened Jul 11, 2018 by Mikaël Salson bio-primers client-warning cpp cpp-heuristic
- 1
updated Aug 30, 2018
UNSEG only J curieux sur une affectation particulière

#3146 · opened Apr 06, 2018 by Mathieu Giraud cpp cpp-heuristic
- 1
updated Jul 12, 2018
SEG_METHOD_ONE et revcomp

#2996 · opened Jan 18, 2018 by Mathieu Giraud cpp-heuristic
- 1
updated Jul 13, 2018
SEG_METHOD_543C : ne pas prendre en compte C dans la p-valeur du J

#2993 · opened Jan 18, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important *-go cpp-heuristic
- 0
updated Jul 16, 2018
Shorter / shifted w : autoriser de plus grands shifts, mais jusqu'à où ?

#2987 · opened Jan 17, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important !-reflexion cpp-heuristic
- 1
updated Jun 27, 2018
Améliorer la fonction de hash

#2985 · opened Jan 17, 2018 by Mathieu Giraud cpp cpp-heuristic
- 2
updated Feb 21, 2020
Classes pour les méthodes de segmentation

#2968 · opened Dec 22, 2017 by Mathieu Giraud Algo -- Important !-hard *-go cpp cpp-heuristic dev-refactor
- 3
updated Jul 16, 2018
Documenter germline.h / homo-sapiens.g et les méthodes de recombinaison

#2920 · opened Nov 30, 2017 by Mathieu Giraud com-paper cpp cpp-heuristic doc repseq-formats
- 0
updated Nov 30, 2017

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