Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Pouvoir invalider "manuellement" quelques k-mers

#4748 · created Apr 06, 2021 by Mathieu Giraud Algo 2022.04 cpp-heuristic
- 1
- 3
updated Feb 17, 2022
Plus de STRAND avec nouvelles germlines dans des cas qui devraient être too few V/J

#4730 · created Mar 22, 2021 by Mathieu Giraud cpp-heuristic
- 2
updated Apr 01, 2021
Nouvelles germlines, séquence hors locus passant de too_few en only_V

#4728 · created Mar 22, 2021 by Mathieu Giraud cpp cpp-heuristic
- 2
updated Apr 01, 2021
SEG_METHOD_ONE_CENTERED, sans minimiseur

#4687 · created Feb 10, 2021 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-heuristic
- 2
updated Apr 27, 2021
Nouvelles germlines, clustérisation S22 et fenêtre décalée : k-mer commun entre V et D

#4665 · created Jan 26, 2021 by Mathieu Giraud bio-germlines cpp-heuristic
- 19
updated Feb 11, 2022
Avoir un outil pour manipuler/comparer les .affects

#4664 · created Jan 26, 2021 by Mathieu Giraud cpp cpp-heuristic priority-1-low
- 1
updated Jan 26, 2021
Graines différentes pour V et J : usage

#4226 · created Mar 26, 2020 by Mathieu Giraud bio-analyze-more bio-germlines cpp-aho cpp-heuristic
- 0
updated Apr 23, 2020
Retirer les séquences de faible complexité des germlines ?

#4188 · created Feb 18, 2020 by Mathieu Giraud Algo 2022.04 !-reflexion bio-e-value cpp-heuristic
- 9
updated Feb 17, 2022
Séquences non recombinées mais KmerSegmentées à tort ?

#4056 · created Nov 21, 2019 by Mathieu Giraud bio-e-value cpp-heuristic
- 2
updated Nov 23, 2019
On trouve un clone sur très peu d'identité.

#3981 · created Sep 16, 2019 by Thonier Florian BRU-Bruxelles bio-e-value cpp cpp-filter-fine cpp-finesegmenter cpp-heuristic
- 2
updated Sep 16, 2019
Utilisation de getS() ou de la graîne avec Aho-Corasick

#3727 · created Feb 12, 2019 by Mikaël Salson Heuristique 2.0 cpp cpp-aho cpp-heuristic dev-refactor
- 4
updated Feb 28, 2019
AFFECT_UNKNOWN à la fin des affectations avec Aho et probas

#3726 · created Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud bio-e-value cpp-heuristic math-stats
- 0
updated Feb 12, 2019
Germline unexpected : comment remonter à la bonne germline ?

#3584 · created Oct 23, 2018 by Mikaël Salson Heuristique 2.0 !-hard !-reflexion cpp cpp-heuristic
- 3
updated Feb 19, 2021
Agrandir la taille des graines pour limiter les faux positifs

#3388 · created Jul 16, 2018 by Mikaël Salson Algo -- Important *-go cpp cpp-heuristic
- 1
updated Nov 23, 2019
Indexer séparément, mais à la suite, les up/down-stream

#3386 · created Jul 16, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion bio-germlines-pseudo cpp cpp-heuristic
- 0
updated Jul 16, 2018
Liste des `SEG_METHOD_*`

#3385 · created Jul 16, 2018 by Mathieu Giraud cpp cpp-heuristic
- 0
updated Feb 10, 2021
SEG_METHOD_123: Détecter les recombinaisons à trois, même si elles sont vues comme VJ normal

#3376 · created Jul 13, 2018 by Mathieu Giraud !-hard cpp-heuristic
- 2
updated Jul 16, 2018
Une séquence passe en unexpected au lieu d'IGH

#3370 · created Jul 12, 2018 by Mikaël Salson !-reflexion bio-germlines-pseudo cpp cpp-heuristic dev-tests-curated-vdj
- 1
updated Jul 13, 2018
Détection de séquences VJ particulières

#3357 · created Jul 11, 2018 by Mikaël Salson bio-primers client-warning cpp cpp-heuristic
- 1
updated Aug 30, 2018
UNSEG only J curieux sur une affectation particulière

#3146 · created Apr 06, 2018 by Mathieu Giraud cpp cpp-heuristic
- 1
updated Jul 12, 2018

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