Issues · vidjil / vidjil · GitLab

vidjil-algo: warning quand une désignation a un mauvais score

#4654 · created Jan 19, 2021 by Mathieu Giraud client-warning cpp-finesegmenter math-stats
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updated Jan 19, 2021
Avoir un warning quand le nombre de différences est faible par rapport au nombre d'hypermutations

#4412 · created Jul 22, 2020 by Mikaël Salson NAN - Nantes bio-CLL client-warning cpp cpp-finesegmenter patho-LLC
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updated Jul 22, 2020
--analysis-filter également sur J ?

#4296 · created May 20, 2020 by Mathieu Giraud cpp-filter-fine cpp-finesegmenter cpp-speed priority-1-low
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updated May 20, 2020
À quoi sert la relance du KmerMultiSegmenter avec -c clones ?

#4108 · created Dec 16, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-finesegmenter dev-refactor
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updated Dec 16, 2019
On trouve un clone sur très peu d'identité.

#3981 · created Sep 16, 2019 by Thonier Florian BRU-Bruxelles bio-e-value cpp cpp-filter-fine cpp-finesegmenter cpp-heuristic
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updated Sep 16, 2019
FineSegmenter donne Unexpected +TRBV/+TRBJ+down au lieu de VJ

#3780 · created Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud LIL-Immuno bio-e-value bio-germlines-unexpected cpp cpp-finesegmenter
- 7
updated Mar 06, 2019
FineSegmenter et séquences revcomp ?

#3736 · created Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-finesegmenter dev-refactor priority-1-low
- 1
updated May 28, 2020
Gaps affine pour deletion_end pour de très grandes délétions

#3275 · created Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud *-go bio-large-deletion cpp cpp-costs cpp-finesegmenter
- 12
updated Apr 01, 2021
Similarité Vh en natif

#3131 · created Apr 05, 2018 by Mathieu Giraud cpp cpp-dynprog cpp-finesegmenter feature repseq-IMGT
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updated Apr 05, 2018
SEG_METHOD_543C : FineSegmenter, identifier le C

#2994 · created Jan 18, 2018 by Mathieu Giraud *-go cpp-finesegmenter next-audio
- 1
updated Feb 18, 2022
Recombinaison atypique : grande insertion dans le V

#2909 · created Nov 29, 2017 by Mathieu Giraud cpp cpp-finesegmenter cpp-heuristic dev-tests-curated-vdj dev-tests-should-get
- 6
updated Jan 19, 2018
Avoir une probabilité, pour chaque nucléotide, d'être dans un V, un D ou un J

#2860 · created Nov 22, 2017 by Mikaël Salson !-reflexion client client-aligner client-ergonomy cpp cpp-finesegmenter
- 1
updated Nov 13, 2020
Plusieurs configurations pour les coûts

#2856 · created Nov 22, 2017 by Mathieu Giraud cpp-costs cpp-finesegmenter cpp-finesegmenter-D cpp-options server-config
- 0
updated Nov 27, 2017
Différencier les réarrangements incomplets et pseudo-incomplets

#2853 · created Nov 22, 2017 by Mikaël Salson !-reflexion NAG-Nagoya bio-capture bio-e-value cpp cpp-finesegmenter feature user-request
- 3
updated Dec 12, 2018
Permutation entre nombres de délétions ?

#2829 · created Nov 21, 2017 by Mathieu Giraud cpp cpp-finesegmenter dev-tests-should-get
- 2
updated Nov 21, 2017
Coût du FineSegmenter : est-on trop généreux avec les mismatches ?

#2825 · created Nov 21, 2017 by Mikaël Salson Algo -- Important !!-bug !-important BRU-Bruxelles PAR-Debré cpp-costs cpp-finesegmenter dev-tests-should-get
- 3
updated Jun 26, 2018
Gaps affines pour le FineSegmenter

#2768 · created Oct 31, 2017 by Mathieu Giraud cpp cpp-costs cpp-finesegmenter
- 2
updated Mar 16, 2021
Calcul de la jonction AA quand c'est non productif

#2434 · created May 11, 2017 by Mathieu Giraud bio-AA cpp cpp-finesegmenter repseq-IMGT repseq-standardization
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updated Nov 06, 2019
Lever un warning si on utilise -3 avec des séquences non gappées

#2189 · created Feb 16, 2017 by Mathieu Giraud bio-AA cpp cpp-finesegmenter cpp-options doc priority-1-low
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updated Feb 16, 2017
Avoir une meilleure modélisation des délétions à la fin du V et au début du J

#2124 · created Jan 24, 2017 by Mathieu Giraud bio-e-value bio-large-deletion cpp cpp-costs cpp-finesegmenter
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updated Jan 26, 2021