Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Pouvoir exporter toutes les information présentes dans les info de samples

#4914 · created Nov 25, 2021 by Thonier Florian Web 2022.05 client-export cpp-export
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updated Mar 22, 2022
Report non-designated sequence outside of germline ?

#4880 · created Oct 15, 2021 by Mathieu Giraud bio-germlines-pseudo client cpp cpp-export
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updated Oct 16, 2021
"not analyzed" depuis le cpp

#4846 · created Sep 17, 2021 by Mathieu Giraud bikeshedding cpp-export repseq-formats
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updated Sep 17, 2021
Sortir dans le .vidjil des informations quand problème critique

#4661 · created Jan 22, 2021 by Mathieu Giraud cpp-export
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updated Jan 22, 2021
--show-junction : afficher les aligments avec 3-5 gènes V/J les plus proches, et pas seulement le premeir

#4646 · created Jan 14, 2021 by Mathieu Giraud cpp-dynprog cpp-export
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updated Jan 14, 2021
Afficher un vrai alignement avec --show-junction

#4645 · created Jan 14, 2021 by Mathieu Giraud cpp-dynprog cpp-export
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updated Jan 14, 2021
vidjil-algo: Avoir un meilleur suffixe pour l'export des reads des clones

#4546 · created Nov 02, 2020 by Mathieu Giraud *-go LIL-Lille cpp-export priority-1-low
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updated Nov 02, 2020
Blancs dans .vidjil ?

#4343 · created Jun 12, 2020 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-export priority-1-low
- 3
updated Jul 28, 2020
Avoir des statistiques globales de détection dans le .vidjil sous forme parsable

#4335 · created Jun 11, 2020 by Mathieu Giraud cpp-export priority-1-low
- 0
updated Jun 11, 2020
0-based / 1-based

#4327 · created Jun 10, 2020 by Mathieu Giraud cpp-export doc repseq-formats
- 2
updated Dec 07, 2021
Even running or killed, should vidjil-algo output some data?

#4190 · created Feb 18, 2020 by Mathieu Giraud cpp-export cpp-speed repseq-formats-airr
- 2
updated Mar 18, 2021
Taille des .vidjil en -y all

#4036 · created Nov 06, 2019 by Mathieu Giraud Algo -- Important !-reflexion *-go cpp cpp-export server-fuse
- 7
updated Apr 06, 2021
Grep reads et vidjil-algo : le fichier résultant peut mélanger FASTA et FASTQ

#3852 · created Mar 20, 2019 by Mikaël Salson cpp cpp-export repseq-formats
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updated Mar 21, 2019
Qualité sur la fenêtre en sortie de vidjil-algo sans passer par `quality` de toutes les séquences

#3390 · created Jul 17, 2018 by Mathieu Giraud bio-control cpp-export feature
- 6
updated Jul 17, 2018
top par système dans vidjil-algo

#3381 · created Jul 13, 2018 by Mathieu Giraud Algo 2022.04 *-go cpp cpp-export dev-refactor
- 3
updated May 12, 2022
-z 10000 depuis vidjil-algo

#3278 · created Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud cpp-export cpp-speed
- 1
updated Jul 02, 2018
vidjil.cpp ne devrait pas, par défaut, sortir un fichier par clone segmenté

#3269 · created Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp cpp-export cpp-filter-fine cpp-options
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updated Jun 22, 2018
Option pour afficher le json bien formaté sur stdout et/ou format_json plus intéressant

#3000 · created Jan 19, 2018 by Mathieu Giraud cpp-export dev-tests priority-1-low repseq-formats
- 1
updated Jan 19, 2018
SEG_METHOD_543C : afficher le gène C dans le client 0 of 2 tasks completed

#2995 · created Jan 18, 2018 by Mathieu Giraud client-axis cpp-export
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updated Jan 27, 2018
Stocker la config dans le .vidjil ?

#2938 · created Dec 06, 2017 by Mathieu Giraud cpp-export repseq-formats wont-fix
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updated Dec 06, 2017