Issues · vidjil / vidjil · GitLab

--show-junction : afficher les aligments avec 3-5 gènes V/J les plus proches, et pas seulement le premeir

#4646 · opened Jan 14, 2021 by Mathieu Giraud cpp-dynprog cpp-export
- 0
updated Jan 14, 2021
Afficher un vrai alignement avec --show-junction

#4645 · opened Jan 14, 2021 by Mathieu Giraud cpp-dynprog cpp-export
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updated Jan 14, 2021
vidjil-algo: Avoir un meilleur suffixe pour l'export des reads des clones

#4546 · opened Nov 02, 2020 by Mathieu Giraud *-go LIL-Lille cpp-export priority-1-low
- 0
updated Nov 02, 2020
Blancs dans .vidjil ?

#4343 · opened Jun 12, 2020 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-export priority-1-low
- 3
updated Jul 28, 2020
Chiffres significatifs : average_read_length, e-value

#4338 · opened Jun 11, 2020 by Mathieu Giraud bikeshedding bio-e-value cpp-export priority-1-low
- 1
updated Jun 11, 2020
Avoir des statistiques globales de détection dans le .vidjil sous forme parsable

#4335 · opened Jun 11, 2020 by Mathieu Giraud cpp-export priority-1-low
- 0
updated Jun 11, 2020
0-based / 1-based

#4327 · opened Jun 10, 2020 by Mathieu Giraud cpp-export doc repseq-formats
- 1
updated Jun 16, 2020
Even running or killed, should vidjil-algo output some data?

#4190 · opened Feb 18, 2020 by Mathieu Giraud cpp-export cpp-speed repseq-formats-airr
- 2
updated Feb 19, 2020
Taille des .vidjil en -y all

#4036 · opened Nov 06, 2019 by Mathieu Giraud Algo 2021.01 !-reflexion *-go cpp cpp-export server-fuse
- 7
updated Aug 22, 2020
Grep reads et vidjil-algo : le fichier résultant peut mélanger FASTA et FASTQ

#3852 · opened Mar 20, 2019 by Mikaël Salson cpp cpp-export repseq-formats
- 6
updated Mar 21, 2019
Qualité sur la fenêtre en sortie de vidjil-algo sans passer par `quality` de toutes les séquences

#3390 · opened Jul 17, 2018 by Mathieu Giraud bio-control cpp-export feature
- 6
updated Jul 17, 2018
top par système dans vidjil-algo

#3381 · opened Jul 13, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important *-go cpp cpp-export dev-refactor
- 0
updated Jun 25, 2020
-z 10000 depuis vidjil-algo

#3278 · opened Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud cpp-export cpp-speed
- 1
updated Jul 02, 2018
vidjil.cpp ne devrait pas, par défaut, sortir un fichier par clone segmenté

#3269 · opened Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp cpp-export cpp-filter-fine cpp-options
- 0
updated Jun 22, 2018
Option pour afficher le json bien formaté sur stdout et/ou format_json plus intéressant

#3000 · opened Jan 19, 2018 by Mathieu Giraud cpp-export dev-tests priority-1-low repseq-formats
- 1
updated Jan 19, 2018
SEG_METHOD_543C : afficher le gène C dans le client 0 of 2 tasks completed

#2995 · opened Jan 18, 2018 by Mathieu Giraud client-axis cpp-export
- 0
updated Jan 27, 2018
Stocker la config dans le .vidjil ?

#2938 · opened Dec 06, 2017 by Mathieu Giraud cpp-export repseq-formats wont-fix
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updated Dec 06, 2017
Statistiques sur le sens de la segmentation de chaque clone

#1700 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team bio-control client-info cpp cpp-export feature priority-2
- 1
updated Nov 29, 2017
Afficher les 3 ou 5 meilleurs V/D/J dans les infos de chaque clone

#1408 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team client client-aligner cpp cpp-dynprog cpp-export cpp-finesegmenter priority-2 user-request
- 3
updated Oct 14, 2020
Exporter un .fastq pour la représentative / qualité pour la consensus (ensemble de la séquence)

#1148 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-hard !-reflexion Paris-Pitié com-vw-vidjil-workshop cpp cpp-export cpp-representative feature priority-2
- 4
updated Mar 20, 2019