Skip to content

GitLab

  • Projects
  • Groups
  • Snippets
  • Help
    • Loading...
  • Help
    • Help
    • Support
    • Community forum
    • Submit feedback
    • Contribute to GitLab
  • Sign in
vidjil
vidjil
  • Project overview
    • Project overview
    • Details
    • Activity
    • Releases
  • Repository
    • Repository
    • Files
    • Commits
    • Branches
    • Tags
    • Contributors
    • Graph
    • Compare
  • Issues 1,688
    • Issues 1,688
    • List
    • Boards
    • Labels
    • Service Desk
    • Milestones
  • Merge Requests 84
    • Merge Requests 84
  • CI / CD
    • CI / CD
    • Pipelines
    • Jobs
    • Schedules
  • Operations
    • Operations
    • Incidents
    • Environments
  • Packages & Registries
    • Packages & Registries
    • Container Registry
  • Analytics
    • Analytics
    • CI / CD
    • Repository
    • Value Stream
  • Snippets
    • Snippets
  • Members
    • Members
  • Collapse sidebar
  • Activity
  • Graph
  • Create a new issue
  • Jobs
  • Commits
  • Issue Boards
  • vidjil
  • vidjilvidjil
  • Issues

  • Open 20
  • Closed 16
  • All 36
New issue
  • Priority Created date Last updated Milestone due date Due date Popularity Label priority Manual
  • --show-junction : afficher les aligments avec 3-5 gènes V/J les plus proches, et pas seulement le premeir
    #4646 · opened Jan 14, 2021 by Mathieu Giraud   cpp-dynprog cpp-export
    • 0
    updated Jan 14, 2021
  • Afficher un vrai alignement avec --show-junction
    #4645 · opened Jan 14, 2021 by Mathieu Giraud   cpp-dynprog cpp-export
    • 0
    updated Jan 14, 2021
  • vidjil-algo: Avoir un meilleur suffixe pour l'export des reads des clones
    #4546 · opened Nov 02, 2020 by Mathieu Giraud   *-go LIL-Lille cpp-export priority-1-low
    • 0
    updated Nov 02, 2020
  • Blancs dans .vidjil ?
    #4343 · opened Jun 12, 2020 by Mathieu Giraud   !-reflexion cpp-export priority-1-low
    • 3
    updated Jul 28, 2020
  • Chiffres significatifs : average_read_length, e-value
    #4338 · opened Jun 11, 2020 by Mathieu Giraud   bikeshedding bio-e-value cpp-export priority-1-low
    • 1
    updated Jun 11, 2020
  • Avoir des statistiques globales de détection dans le .vidjil sous forme parsable
    #4335 · opened Jun 11, 2020 by Mathieu Giraud   cpp-export priority-1-low
    • 0
    updated Jun 11, 2020
  • 0-based / 1-based
    #4327 · opened Jun 10, 2020 by Mathieu Giraud   cpp-export doc repseq-formats
    • 1
    updated Jun 16, 2020
  • Even running or killed, should vidjil-algo output some data?
    #4190 · opened Feb 18, 2020 by Mathieu Giraud   cpp-export cpp-speed repseq-formats-airr
    • 2
    updated Feb 19, 2020
  • Taille des .vidjil en -y all
    #4036 · opened Nov 06, 2019 by Mathieu Giraud   Algo 2021.01   !-reflexion *-go cpp cpp-export server-fuse
    • 7
    updated Aug 22, 2020
  • Grep reads et vidjil-algo : le fichier résultant peut mélanger FASTA et FASTQ
    #3852 · opened Mar 20, 2019 by Mikaël Salson   cpp cpp-export repseq-formats
    • 6
    updated Mar 21, 2019
  • Qualité sur la fenêtre en sortie de vidjil-algo sans passer par `quality` de toutes les séquences
    #3390 · opened Jul 17, 2018 by Mathieu Giraud   bio-control cpp-export feature
    • 6
    updated Jul 17, 2018
  • top par système dans vidjil-algo
    #3381 · opened Jul 13, 2018 by Mathieu Giraud   Algo -- Important   *-go cpp cpp-export dev-refactor
    • 0
    updated Jun 25, 2020
  • -z 10000 depuis vidjil-algo
    #3278 · opened Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud   cpp-export cpp-speed
    • 1
    updated Jul 02, 2018
  • vidjil.cpp ne devrait pas, par défaut, sortir un fichier par clone segmenté
    #3269 · opened Jun 12, 2018 by Mathieu Giraud   !-reflexion cpp cpp-export cpp-filter-fine cpp-options
    • 0
    updated Jun 22, 2018
  • Option pour afficher le json bien formaté sur stdout et/ou format_json plus intéressant
    #3000 · opened Jan 19, 2018 by Mathieu Giraud   cpp-export dev-tests priority-1-low repseq-formats
    • 1
    updated Jan 19, 2018
  • SEG_METHOD_543C : afficher le gène C dans le client   0 of 2 tasks completed
    #2995 · opened Jan 18, 2018 by Mathieu Giraud   client-axis cpp-export
    • 0
    updated Jan 27, 2018
  • Stocker la config dans le .vidjil ?
    #2938 · opened Dec 06, 2017 by Mathieu Giraud   cpp-export repseq-formats wont-fix
    • 0
    updated Dec 06, 2017
  • Statistiques sur le sens de la segmentation de chaque clone
    #1700 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   bio-control client-info cpp cpp-export feature priority-2
    • 1
    updated Nov 29, 2017
  • Afficher les 3 ou 5 meilleurs V/D/J dans les infos de chaque clone
    #1408 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   client client-aligner cpp cpp-dynprog cpp-export cpp-finesegmenter priority-2 user-request
    • 3
    updated Oct 14, 2020
  • Exporter un .fastq pour la représentative / qualité pour la consensus (ensemble de la séquence)
    #1148 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-hard !-reflexion Paris-Pitié com-vw-vidjil-workshop cpp cpp-export cpp-representative feature priority-2
    • 4
    updated Mar 20, 2019