Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Nouvelles germlines, clustérisation S22 et fenêtre décalée : k-mer commun entre V et D

#4665 · created Jan 26, 2021 by Mathieu Giraud bio-germlines cpp-heuristic
- 17
updated Apr 06, 2021
Up/down-streams: étendre bien plus, vers 200bp ?

#4662 · created Jan 23, 2021 by Mathieu Giraud bio-germlines
- 0
updated Jan 23, 2021
Vérification d'overlap : le faire aussi sur non up/down (bref les V) + refactor split-germlines

#4659 · created Jan 20, 2021 by Mathieu Giraud bio-germlines dev-refactor
- 0
updated Jan 20, 2021
Examiner les warnings sur les germlines

#4657 · created Jan 20, 2021 by Mathieu Giraud *-go bio-germlines
- 1
updated Jan 20, 2021
Nouveau TRGJ1*02

#4640 · created Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud bio-germlines repseq-IMGT
- 0
updated Apr 08, 2021
Pseudogènes IMGT non assignés à des sous-groupes

#4639 · created Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud bio-germlines
- 0
updated Jan 13, 2021
Follow-up from "Resolve "Avoir les données germline du cochon (Sus Scrofa)"" 0 of 1 task completed

#4631 · created Jan 12, 2021 by Thonier Florian bio-germlines bio-germlines-isotypes doc
- 1
updated Apr 06, 2021
Séquences avec du V-INTRON ou avant

#4624 · created Jan 05, 2021 by Mathieu Giraud bio-analyze-more bio-germlines priority-1-low
- 0
updated Jan 05, 2021
Sous-espèces et germlines (quasi-)dupliquées

#4620 · created Dec 23, 2020 by Mathieu Giraud !-reflexion bio-germlines bio-germlines-isotypes bio-species
- 6
updated Apr 08, 2021
Graines différentes pour V et J : usage

#4226 · created Mar 26, 2020 by Mathieu Giraud bio-analyze-more bio-germlines cpp-aho cpp-heuristic
- 0
updated Apr 23, 2020
axes: refactor GermlineAxis, et plus généralement refactor des axes

#4114 · created Jan 08, 2020 by Mathieu Giraud !-hard bio-germlines client-axis dev-refactor
- 0
updated Jan 22, 2020
Déploiement de feature-g/, intégration dans feature-a/

#3919 · created May 23, 2019 by Mathieu Giraud +-deploy bio-germlines dev-ci
- 3
updated Oct 20, 2020
Pseudo-gènes non in-frame et tests algos

#3654 · created Dec 10, 2018 by Mathieu Giraud !-hard bio-germlines bio-germlines-pseudo dev-tests
- 1
updated Feb 17, 2021
Export fasta non fonctionnels pour des données hors des germlines par défaut (ex: IKZF1/ERG)

#3561 · created Oct 16, 2018 by Thonier Florian !!-bug !-hard bio-germlines client client-export dev-robust
- 2
updated Oct 16, 2018
Documenter le format utilisé dans les fichiers `.g`

#3363 · created Jul 12, 2018 by Mikaël Salson bio-germlines doc repseq-formats
- 1
updated Sep 07, 2018
À quoi sert le ref dans les fichiers .g / à quoi sert germline_id

#3362 · created Jul 12, 2018 by Mikaël Salson bio-germlines doc repseq-formats
- 6
updated Sep 07, 2018
Sortir IKZF1*fa et ERG*fa du git ?

#3285 · created Jun 13, 2018 by Mathieu Giraud bikeshedding bio-germlines dev-build
- 3
updated Mar 14, 2019
Filtrage par automate et pseudo-germlines

#3237 · created May 30, 2018 by Mathieu Giraud bio-germlines bio-germlines-pseudo cpp-speed
- 0
updated May 30, 2018
Nomenclature ERG

#3229 · created May 25, 2018 by Mathieu Giraud Algo -- Important bikeshedding bio-germlines
- 8
updated May 20, 2020
Avoir un axe "germlines dans l'ordre du locus"

#3192 · created Apr 17, 2018 by Mathieu Giraud *-go bio-control bio-germlines client client-axis
- 3
updated Jan 20, 2021

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