Regex "ou" dans should-to-tap.py
Depuis !1412 et le passage en python3 :
python should-vdj-to-tap.py -v should-vdj-tests/0000-nck-TRD.should-vdj.fa
Le TRDV1 (5/AC/0 TRDD2 3/CGTGT/0, 5/AC/0 TRDD2 5/TCCCGTGT/0, 5/14/0) TRDJ1*01
ne passe plus. La manière dont on construit les regex me semble obscure.
a0b75bf3 dans !1412 contourne cela en simplifiant le test, mais ce serait mieux de comprendre ce qu'il se passe et d'avoir un traitement robuste de ces regex, bref de refaire marcher cela en revertant a0b75bf3.