Isotypes IGH
J'essaie de mettre au point un protocole permettant d'amplifier le clone de mes patients LLC sur le cDNA, quelques soit l'isotype, donc avec 4 amorces reverse (Cmu, Cga, Cde, Cal). L'amorce forward est située dans L-PART-1. Jusque là nous utilisions en routine la combinaison Cmu + Cga qui fonctionne pour la majorité des cas. J'essaie d'utiliser l'analyse "IGH/isotypes" pour essayer de caractériser au mieux mes échantillons mais le fait que Vidjil affiche une combinaison JH / isotype ne rend pas la lecture facile quand le patient a plusieurs clonotypes.
Exemple d'un patient avec 2 clonotypes J4:
https://app.vidjil.org/54306-2?
https://app.vidjil.org/54306-37?
Serait-il possible d'avoir un graphique VH / Isotype ? (avec idéalement un regroupement sur le CDR3 comme habituellement)