GitLab

Je pense qu'il y avait déjà eu une issue à ce sujet mais je ne l'ai pas retrouvée :
Ce matin la technicienne ne s'est pas aperçu que l'upload des fastq s'était interrompu ou a eu un problème, pour je ne sais quelle raison.

• Il n'y a qu'un patient sur les 48 qui semble avoir eu R1 + R2
• Une majorité de patient semble n'avoir qu'un des 2 fichiers, il est écrit "waiting file" dans le pre-process mais l'analyse IGH s'est quand même lancé, donnant des résultats aberrants (une poignée de reads analysés seulement)
• une dizaine de patients pour lesquels aucun fastq n'a été reçu : le pre-process indique "queued" et l'analyse indique "PREPROCESS"