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Created Apr 01, 2021 by Mathieu Giraud@magiraudOwner

Nouvel aligneur et tests supprimés

  1. !836 (comment 499889) :

On avait des tests qui vérifiaient les positions des features. Y en a-t-il ?

  1. !836 (comment 499891) :

Il y avait des tests sur les fonctions addSegFeatureFromSeq ou getSegFeature. Ces fonctions existent toujours, plus les tests. Il n'y a plus la fonction get_positionned_highlight, ok. Mais il y a maintenant la fonction highlightToString, pour laquelle je ne vois pas de test. Je ne vois pas non plus de tests pour les fonctions segment_start, segment_stop, par exemple.

  1. !836 (comment 499892) :

toFasta existe toujours, tout comme isDNA, isAA, isPos, findPotentialField.

Pour le premier point, je pense avoir compris que les nouveaux tests vérifient la même chose mais avec un découpage différent, mais j'ai peut-être mal compris. Pour les deux seconds, je ne sais pas, j'avais cru que c'était pareil.

À discuter au retour de Marc.

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