Utilisation de getS() ou de la graîne avec Aho-Corasick
Dans plusieurs endroits du code, notamment KmerAffectAnalyser::getMaximum, on utilise le span de la graîne. Or cette graîne peut être différente selon les germlines et selon le gène étudié. Ce n'est pas un problème dans !78 (merged) car on a un automate par germline et les graînes ne sont pas encore différenciées selon le gène. Mais cela pourrait poser problème plus tard (ou à d'autres endroits du code), notamment avec #1169.
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