GitLab

Je veux ajouter les patients de mon run (dans un run nouvellement créé). Si je supprime un sample, sa ligne disparait, mais les numéro des autres samples ne sont pas mis à jour. En revanche si j'ajoute un nouveau sample par la suite, celui-ci prend en compte la suppression. Pour les 2 samples qui ont le même numéro, je peux leur choisir des fastq différents, mettre des informations différentes, mais pas les associer à des patients/sets/runs différents dans le dernier champ de la ligne. Quand je clique dans le champ du 2e sample, cela fait revenir le pointeur dans la case du 1er sample.

Visiblement si la numérotation n'est pas correcte, une fenêtre "error" s'ouvre et l'import ne se fait pas. (c'est bête vu le temps que j'ai passé à remplir toutes les lignes !!) J'ai supprimé toutes les lignes mal numérotées (à partir du sample 6 pour mon run) et redemandé l'import -> cette fois les fastq sont bien importés. Mais j'ai 5 samples "fantômes" qui sont apparus dans le run. Je les ai supprimé mais le merge des R1 et R2 semble toujours en pause...