Skip to content

GitLab

vidjil
vidjil
Open
Opened by Mathieu Giraud@magiraudOwner

SEG_METHOD_543C : ne pas prendre en compte C dans la p-valeur du J

Pour résoudre #2964 (closed), discussion avec @mikael-s

  • stocker dans les index les gènes constants (36 KB en IGH)
  • point central: lorsqu'on a VVV_DD_JJJJ_CCCC, ne pas prendre en compte la zone CCCC pour la p-valeur du J
  • puis éventuellement #2994/#2995

Si les gènes constants sont trop gros, un pis-aller serait de ne pas considérer, dans VVV_DD_JJJJ______, la zone vide à droite du J. Mais c'est potentiellement dangereux.

Fait-on d'un même coup quelque chose SEG_METHOD_C543C, configurable ? Ou on a le temps de voir venir ?

Demande en tout cas d'abord #2968.

Edited by Mathieu Giraud
To upload designs, you'll need to enable LFS and have an admin enable hashed storage. More information