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Remplacer les presets avec « clone consensus length » par « clone average length » ?
La longueur de la séquence consensus est peu interprétable et difficile à expliquer, on devrait se contenter d'afficher la longueur des reads moyenne d'un clone.
Un exemple où cela serait nettement mieux (ne pas se mettre en mode bar pour tester, à cause de #2703 (closed)) : http://app.vidjil.org/index.html?sample_set_id=25317&config=2 Quand on regarde la longueur de la séquence consensus, on voit que le clone principal a une longueur un peu inférieure à ses sous-clones, ce qui pourrait donner l'impression d'une sous-population différente. Mais en fait quand on passe en « clone average read length », on se rend compte que tous ont bien la même taille moyenne de reads.
La différence de longueur de séquence consensus est juste due à l'heuristique de calcul de la consensus et apporte plus de bruit que d'information.
Pour l'instant bloqué par #2703 (closed), mais à faire juste après.
cc @flothoni