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Central region : couper en deux pour ne pas pénaliser deux fois
Dans 2e23e720, j'avais écrit :
A more exact option could have been to use something like (first_pos_max + last_pos_max / 2) + getS()/2, but it would raise symmetry problems. The selected option should anyway improve the estimation in most of the cases.
Je pense que ce qui me chiffonait pour la symétrie, c'était qu'doit être invariant aux reads rev-compés. Prendre la position (first_pos_max + last_pos_max) / 2 n'est pas reproductible. Mais il suffit de dépasser d'un nucléotide quand c'est impair, et plus de soucis. On comptera dans ce cas une position deux fois, mais ce sera mieux que toute la zone centrale comptée deux fois.
Voir aussi #1878.