Vh pas trouvé, uniquement Dh-Jh
Aurélie LIL-Lille :
I have a question on the results I obtain on the following sample: http://app.vidjil.org/?sample_set_id=23852&config=25
Let's look on the following clones:
IGHD2-202 2/TGA/5 IGHJ502 362 nt, 148 525 reads (10.64%, 53.45% of IGH/IGH+, 2042% of IGH+) GGAGTCGGGGGAGGCTTGGTCCAGCCTGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACCTTCAGTGACTACTACATGAGCTGGGTCCGCCAGGCTCCCGGGAAGGGGCTGGAGTGGGTAGGTTTCATTAGAAACAAAGCTAATGGTGGGACAACAGAATAGACCACGTCTGTGAAAGGCAGATTCACAATCTCAAGAGATGATTCCAAAAGCATCACCTATCTGCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCCGTGTATCAAGGGGCATTTATTGTAGTAGTACCAGCTGCTAT
ATG ATGGTTCGACCCCTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCCTCAGGTAAG
Bonjour,
Ce clone est mal nommé, il ne reconnaît pas le VH, bien présent puisque nous avons pu merger des clones qui étaient VDJ. Cela m’embête car ce clone étant majoritaire, le merge ne permet pas de corriger la séquence.
Pourriez-vous y regarder et me dire pourquoi le VH n’a pas été reconnu ?
Merci
Aurélie