Pas d'assigation VDJ lorsqu'il y a de grosses délétions
Voici un exemple où il y a 2 ou 3 centaines de nucléotides délétés dans le V. Le FIneSegmenter échoue à proposer une solution. Il me semblait qu'on avait déjà une issue sur le sujet, mais je ne l'ai pas retrouvée (lorsqu'à Lille on avait un patient dans une situation comparable). IgBlast trouve sans problème des solutions pour le V (avec 19 nucléotides dans le V c'est un peu juste pour déterminer duquel il s'agit), le D et le J.
Serait-ce dû à des optimisations pour ne chercher que sur la diagonale ? Peut-on la désactiver si on ne trouve pas de segmentation ?