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Created Dec 16, 2016 by Mikaël Salson@mikael-sOwner

Recherche des recombinaisons DDH

Mail de @flothoni du 01/12 : le germlines.data actuel ne recherche pas de D dans le cas d'une recombinaison DJ. C'est effectivement le cas :

        "recombinations": [ {
            "5": ["IGHD_upstream.fa"],
            "3": ["IGHJ.fa"]
        }],

Est-on d'accord qu'on voudrait le rajouter ? Ou alors seulement si l'option -d (recherche de D multiples) est passée ? Mais dans ce cas c'est difficile car impose d'avoir un germline qui dépend d'une option.

@magiraud

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