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Created Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

Les identifiants de clones ne sont pas uniques pour MiXCR

Pour l'instant on a CDR3, gène V, gène J. Si je me souviens bien ce que nous avait dit Shugay, il manque les hypermutations. Est-ce que cela suffira ? Ou alors faut-il fusionner les ID identiques dans fuse.py (et non pas en prendre aléatoirement un) ?


J'ai enlevé MiXCR des configs publiques puisqu'en l'état les résultats risquent d'être incorrects : ce qui est le cas pour notre fichier de démo où MiXCR ne voyait pas la rechute… en fait il semblerait plutôt que ce soit de notre faute.


ping : normalement tout est bon ?


Ces clones sont maintenant fusionnés par la sortie au format Vidjil.


merci


@magiraud @RyanHerb @mikael-s

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