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Mise à jour terminée. Pour connaître les apports de la version 13.8.4 par rapport à notre ancienne version vous pouvez lire les "Release Notes" suivantes :
https://about.gitlab.com/releases/2021/02/11/security-release-gitlab-13-8-4-released/
https://about.gitlab.com/releases/2021/02/05/gitlab-13-8-3-released/

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  • #1936

Closed
Open
Opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

Véracité des causes de non segmentation (et implications du -t ou -2)

Les causes de non segmentation varient grandement en fonction des paramètres utilisés, ce qui induit en erreur. Par exemple sur des données de LLC, ajouter un -t 0 (par défaut -t 100), conduit à considérer le V dans toute sa longueur et donc le UNSEG too few V/J passe de ~10^5 à ~10^3, les séquences passant en fait en « UNSEG only V/5' ». Cela amène d'ailleurs à se poser la question de la pertinence de -t 100 : il y a des séquences qui contiennent vraiment du V mais dont on pense qu'elles n'en ont pas à cause du -t 100.

Par ailleurs sur ces mêmes données, utiliser un -2 fait passer une très grosse partie des séquences de « UNSEG only V/5' » à « UNSEG only J/3' » pour une raison que je n'explique pas.

Les données en question : patient 1803 et 1806 (Lille).


@magiraud @mikael-s

To upload designs, you'll need to enable LFS and have an admin enable hashed storage. More information
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None
Milestone
None
Assign milestone
Time tracking
None
Due date
None
Reference: vidjil/vidjil#1936