Skip to content

GitLab

  • Menu
Projects Groups Snippets
    • Loading...
  • Help
    • Help
    • Support
    • Community forum
    • Submit feedback
    • Contribute to GitLab
  • Sign in
  • vidjil vidjil
  • Project information
    • Project information
    • Activity
    • Labels
    • Members
  • Repository
    • Repository
    • Files
    • Commits
    • Branches
    • Tags
    • Contributors
    • Graph
    • Compare
  • Issues 1,697
    • Issues 1,697
    • List
    • Boards
    • Service Desk
    • Milestones
  • Merge requests 91
    • Merge requests 91
  • CI/CD
    • CI/CD
    • Pipelines
    • Jobs
    • Schedules
  • Deployments
    • Deployments
    • Environments
    • Releases
  • Monitor
    • Monitor
    • Incidents
  • Packages & Registries
    • Packages & Registries
    • Container Registry
  • Analytics
    • Analytics
    • Value stream
    • CI/CD
    • Repository
  • Snippets
    • Snippets
  • Activity
  • Graph
  • Create a new issue
  • Jobs
  • Commits
  • Issue Boards
Collapse sidebar
  • vidjil
  • vidjilvidjil
  • Issues
  • #1800

Closed
Open
Created Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

should-vdj-to-tap.py: meilleur diff, détailler l'échec

Ce serait sympa d'avoir un meilleur diff (pourquoi pas coloré) entre le .should-vdj et ce que donne Vidjil (ou un autre programme). Et éventuellement des résultats à la fin du type "errors in V gene / V allele / N / ...". Et des calculs plus rigolos sur le N (taille conservée...)

Mais tout cela demanderait de changer le principe actuel de should-vdj-to-tap.py: pour l'instant, on compile une regexp, c'est tout. Pour être plus flexible, on ferait tout à la main (ou bien une suite de regexps).


@nobody

To upload designs, you'll need to enable LFS and have an admin enable hashed storage. More information
Assignee
Assign to
Time tracking