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Mise à jour terminée. Pour connaître les apports de la version 13.8.4 par rapport à notre ancienne version vous pouvez lire les "Release Notes" suivantes :
https://about.gitlab.com/releases/2021/02/11/security-release-gitlab-13-8-4-released/
https://about.gitlab.com/releases/2021/02/05/gitlab-13-8-3-released/

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  • vidjilvidjil
  • Issues
  • #1760

Closed
Open
Opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

Une séquence ambiguë à tort ? -4

Hier, tu as dit à un moment "c'est bizarre que cette séquence soit ambigüe". Tu te souviens de laquelle c'était ?


C'est quand tu faisais un -4 (sur les données de Florian ?), en xxx la séquence passait en unknown alors qu'il y avait pas mal de delta à la fin qui était bien reconnu


Ah, ok, si c'est -4 c'est expérimental :-)


Euh… pourquoi le calcul de l'ambigu différerait entre le -4 et le reste ?


C'est une bonne question.


J’ai comparé 0ce12ff5 et 783d0b19 (diff: changements de la semaine dernière, plus de reads en ambiguous)

/vidjil -g germline/ -i -K ~/notable/data_translocation.fasta Une séquence passe de only V en too few V/J, et c’est mieux ainsi. Bref, pas de soucis avec les dernières modifs.

Avec -4, pas encore tout compris ce qu’il se passe, mais rien d’urgent de ce côté, on verra cela en janvier.


@magiraud

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Reference: vidjil/vidjil#1760