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Created Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

Identifiants des germlines dans germlines.js

Remarqué par @Cyanael : les identifiants des germlines dans germlines.js ne sont pas systématiques : TRGV, TRGJ, IGK-INTRON, IGHD_upstream ... En aval, cela impacte au moins model.js: exportFasta où on a du faire des règles spécifiques.

Cela provient de buildBrowserGermline.py (et donc du nom des fichiers ?). Ces identifiants ne sont pas propres, la seule référence devrait être les infos de germline/homo-sapiens.g

→ faudrait-il utiliser des clés TRG-5, TRG-3, IGK+-5, TRD-4 ? → ou même TRG / IGK+ en vrac ? → ou même... tout en vrac, dans une seule hashmap ? (A-t-on vraiment besoin des séquences séparées par germline ? La description des germlines est déjà faite par ailleurs)

To upload designs, you'll need to enable LFS and have an admin enable hashed storage. More information
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