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Tailles de fenêtres différentes selon les locus
Mikaël : "pourquoi ne pas mettre la taille de la fenêtre dans Germline et avoir des tailles différentes selon les germlines ? Je ne vois pas pourquoi TRG et IGH (par exemple) devraient nécessairement avoir la même taille de fenêtre."
Ce serait un rétro-pédalage depuis le -w 50 (mais c'est possible, et plus pertinent de changer selon la germline que selon l'option multi ou pas)
Les raisons (peut-être mauvaises) qui avaient poussé à un -w unique :
- on souhaite pouvoir comparer IGH et IGH+
- et TRD avec TRD+, avec VdJa, avec TRA -> par transitivité TRA avec TRD, alors que VJ et VDJ mais est-ce vraiment important ? deux fenêtres IGH et IGH+ n'ont de toute façon rien à voir ensemble...
... et si on resplite un clone, on aura des tailles de fenêtres encore différentes à l'intérieur d'un même locus...