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Created Nov 29, 2016 by Vidjil Team@vidjilteamMaintainer

Changer le germline d'un clone

Cela permettrait de répondre à plusieurs questions :

  • bouger des clones mal affectés, en récupérer (xxx > IGH+)
  • et ignorer vraiment des clones dont on ne veut pas (un locus > xxx)
  1. Si c'est dans le .analysis, est-ce que l'info passe bien ?
  2. Quelle procédure pour changer ? (réfléchir aussi au changement de V / de J, peut-être dans le info)

pour 2), le germline apparait maintenant dans getInfoHtml, ce serait le bon endroit pour avoir un bouton pour éditer


Marc : « en soit c'est facile, mais ça change toutes les stats et il faudrait la sauvegarder ou rejouer le changement »


Marc : « il crée la liste des gènes en fonction des gènes réellement utilisés. C'est fait à chaque fois qu'on change de germline. Il faudrait relancer la fonction qui calcule cela quand on change le germline d'un clone. »


Dépend de « changer les gènes V/D/J d'un clone » : https://www.producteev.com/workspace/t/555b3f53b1fa09245f000000


Vu ensemble : ok, bien, n'afficher les listes déroulantes que lorsqu'on clique sur un bouton "edit" dans la barre de titre "segmentation"


fait.


voir les changments de stats induits


Parfait, merci !


e105a411: Je viens de faire en sorte que le bouton ne soit visible que lorsqu'on est en mode développement (faire Ctrl-A). J'ai en effet besoin de mettre à jour le browser sur rbx et d'utiliser master.


Oups... tu as commité des choses aujourd'hui dans "florian", mais sans récupérer avant ce que j'avais mis dans "master" hier... cela sent le conflit lorsque tu vas devoir merger...


Euh... en fait non, ton dernier commit 9b1ea5b3 est bien une reprise de ce qui est dans master... mais c'est bizarre, ce n'est pas un commit de merge. On en discutera demain.


... en tout cas c'est très joli comme cela !


@flothoni

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