align colore parfois les mauvaises bases comme étant des mutations
Aller sur http://rbx.vidjil.org/browser/?patient=291&config=11, monter le nombre de clones au max et sélectionner tous les clones TRGV8/TRGJ1. Faire un align dessus. Constater qu'un A est allumé dans toutes les séquences (sauf une qui a un G), à l'intérieur du J. Est-ce que ce n'est pas censé être la première séquence qui détermine la référence ? Colorer le A partout ajoute du bruit. Normalement seul le G devrait être coloré.
J'ai essayé... et j'ai abandonné. segmenter.js : 614 .diff(json.seq[0]), il ne faut pas qu'il y ait 0 mais autre chose. Mais pas first_clone.
Mais je ne suis pas sûr de comprendre l'interaction entre le diff() (qui décore la séquence) et le .toString() (qui repart de la séquence).
Est-ce que cette décoration avec des ne devrait pas plutôt avoir lieu dans le .toString(), vers la ligne 890 ?
Au passage, l'exemple que tu as donné a changé... un utilisateur a fait du merge depuis ce matin :-)
@nobody