Attention une mise à jour du service Gitlab va être effectuée le mardi 18 janvier (et non lundi 17 comme annoncé précédemment) entre 18h00 et 18h30. Cette mise à jour va générer une interruption du service dont nous ne maîtrisons pas complètement la durée mais qui ne devrait pas excéder quelques minutes.

Commit 152f5db4 authored by COULAUD Olivier's avatar COULAUD Olivier
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parent 015740c3
#!/bin/bash
#
#PBS -N MG_water
#
# preciser le temps en heures, minutes, secondes
#PBS -l walltime=01:59:00
# nombre de noeuds et de coeurs
#PBS -l nodes=1:ppn=12
#PBS -l naccesspolicy=singlejob
#
# PlaFRIM environment
w
source $HOME/.bashrc
#
FMMPER_EXE="Tests/Release/testSphericalEwalAlgorithm"
FILE="../Data/forceNacl_2000_dlpolyPer.txt"
FILE="../Data/forceNacl_128_dlpolyPer.txt"
cd ~/Dev/src/ScalFMM/scalfmmT/BuildGCC
#
# RUN 1 influence de la taille de la boite sur la precision des calculs
# Regarde size, Nx ny nz energie total, dipole et le temps de calcul
#
PER_SIZE="-1 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18"
#
rm -f FMM_PER.out
echo "# PerSize DOMAIN_SIZE ENERGY"> FMM_PER.out
pwd
for l in $PER_SIZE
do
echo "Running per = " ${l}
echo "$FMMPER_EXE -f $FILE -h 4 -sh 2 -per $l > $FILE.out "
$FMMPER_EXE -f $FILE -h 4 -sh 2 -per $l > $FILE.out
DOMAINSIZE=`grep "Simulated box:" $FILE.out | awk '{print $3}'`
ENERGY=`grep "Energy FMM=" $FILE.out |awk '{ print $3 }'`
echo " " $l $DOMAINSIZE " " $ENERGY " " >> FMM_PER.out
done
#set terminal postscript enhanced color
#set output FMMEnergy.ps'
set key left
szt encoding iso_8859_1
set title "FMM Energy"
set xlabel "per size (per)"
set ylabel "Energy (kcal/mol)"
plot "FMM_PER.out" u ($1,$3) w l t "FMM Energy"
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