import_reactions_from_ode --> infer_crn_from_ode
Il faut revoir l'algorithme d'inférence de CRN à partir d'ODE notamment vis à vis des termes ODE mal formés non strict pour une réaction dx/dt = - f(pas x) + .... dans biocham-3: on mettait un warning et on essayait d'inférer une molécule cachée dans biocham-4: on en fait moins mais on pourrait au contraire en faire plus !
- introduire xp, x= et x=xp-xm pour régler le problème des termes ODE non stricts
- reste à comprendre comment le dual-rail se compare exactement à l'inférence de molécule cachée
C'est intéressant ! L'exemple à faire marcher c'est ball.bc avec export_ode et un nouveau infer_crn_from_ode bien compris.
Ensuite seulement nous pourrons appliquer nos analyses graphiques des systèmes de réactions (search_conservations, check_multistability, rate_independence etc.) aux vieilles ODEs poussiéreuses et créer la nouvelle physique du XXIième siècle qui sera structurelle ! ou ne sera pas.
Que la lumière soit !