Issues · vidjil / vidjil

New issue

Intéractions des vues avec VMI 5 of 7 tasks completed

#3596 · opened Oct 30, 2018 by Ryan Herbert client vmi-responsive
- 6
updated Feb 20, 2020
"make demo", LIL-L4 et "make release"

#3597 · opened Oct 30, 2018 by Mathieu Giraud dev-tests
- 1
updated Mar 11, 2020
Séparateur horizontal au bon endroit

#3603 · opened Nov 02, 2018 by Mathieu Giraud *-go vmi-responsive
- 1
updated Nov 02, 2018
vmi et info : X5 sur deux lignes au lieu de trois

#3604 · opened Nov 02, 2018 by Mathieu Giraud client-ugly priority-1-low
- 0
updated Nov 02, 2018
Signaler à l'utilisateur que son fichier FAILED a un soucis

#3611 · opened Nov 07, 2018 by Mathieu Giraud server
- 5
updated Nov 12, 2018
Le bouton CDR3 devrait être 2-3 pixels plus haut, aligné avec "toBlast"

#3612 · opened Nov 07, 2018 by Mathieu Giraud *-go bio-AA client client-ugly priority-1-low
- 0
updated Nov 07, 2018
Rajouter Demo-X5 au menu file des environnements de review

#3613 · opened Nov 07, 2018 by Mathieu Giraud dev-gitlab dev-tests priority-1-low
- 0
updated Nov 07, 2018
Axes 'hide': les faire apparaître à certains moments ?

#3615 · opened Nov 07, 2018 by Mathieu Giraud client-axis repseq-IMGT
- 0
updated Nov 07, 2018
to IMGT quand pas de CDR3

#3616 · opened Nov 08, 2018 by Mathieu Giraud repseq-IMGT
- 0
updated Jun 05, 2019
Coûts environnementaux et économiques d'un serveur Vidjil

#3623 · opened Nov 09, 2018 by Mathieu Giraud #-ethics
- 5
updated Jun 12, 2020
Checksum des fichiers uploadés et autres ?

#3627 · opened Nov 15, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion #-crisis-prevention #-quality server-upload
- 4
updated Jan 28, 2019
Tests dockers : rm: cannot remove '*/S.gpg-agent.browser': No such file or directory

#3628 · opened Nov 16, 2018 by Mikaël Salson dev-tests server server-docker
- 1
updated Nov 16, 2018
gitlab-ci.yml, jobs parallèles pour pipelines plus rapides

#3630 · opened Nov 26, 2018 by Mathieu Giraud dev-ci tests-speed
- 0
updated Nov 26, 2018
Utiliser .gitlab/route-map.yml ?

#3631 · opened Nov 26, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion dev-ci dev-gitlab priority-1-low
- 0
updated Nov 26, 2018
Pouvoir désactiver le lancement de runs dans defs.py

#3633 · opened Nov 27, 2018 by Mathieu Giraud *-go server
- 0
updated Dec 13, 2019
url : liens (bouton central) dans liste des patients et see results

#3634 · opened Nov 27, 2018 by Mathieu Giraud *-go client client-api
- 0
updated Dec 04, 2018
url : `c/` par défaut + règle compatibilité `browser/`

#3635 · opened Nov 27, 2018 by Mathieu Giraud *-go client client-api
- 0
updated Dec 04, 2018
docker: ajouter une segmenter page dans conf.js

#3636 · opened Nov 27, 2018 by Ryan Herbert *-go app-analyze server-docker
- 0
updated Dec 04, 2018
sucess si pear assemble des fichiers de tailles différentes

#3637 · opened Nov 27, 2018 by Thonier Florian !!-bug server server-logs server-pre-process
- 0
updated Nov 27, 2018
vmi: div data en bas à gauche de la liste déborde

#3642 · opened Nov 30, 2018 by Mathieu Giraud *-go client client-ugly vmi-responsive
- 1
updated Dec 21, 2018
Document normalize_reads in doc/vidjil-format.md

#3646 · opened Nov 30, 2018 by Mathieu Giraud *-go Boldrini-Brasil doc
- 0
updated Dec 20, 2018
Docker : ne pas les lancer avec l'utilisateur root

#3649 · opened Nov 30, 2018 by Mikaël Salson !-security #-crisis-prevention server-docker
- 0
updated Nov 30, 2018
How does the user see the normalized_reads field?

#3650 · opened Dec 04, 2018 by Mathieu Giraud Boldrini-Brasil bikeshedding client client-normalization
- 2
updated Jan 10, 2019
Pseudo-gènes non in-frame et tests algos

#3654 · opened Dec 10, 2018 by Mathieu Giraud !-hard bio-germlines bio-germlines-pseudo dev-tests
- 1
updated Dec 12, 2018
Évaluer Cypress

#3655 · opened Dec 11, 2018 by Mathieu Giraud !-reflexion dev-ci dev-gitlab dev-tests
- 12
updated Jul 30, 2020
Pouvoir selectionner le clone support consensus lors d'un merge

#3657 · opened Dec 12, 2018 by Thonier Florian LIL-Lille client client-cluster feature
- 0
updated Dec 12, 2018
Interdire les \n dans les configs

#3658 · opened Dec 12, 2018 by Mathieu Giraud *-go server-admin server-config
- 0
updated Dec 12, 2018
Utilisation d'un web-recorder: puppeteer-recorder

#3659 · opened Dec 17, 2018 by Thonier Florian !-reflexion bikeshedding client dev-ci feature
- 3
updated Dec 21, 2018
Bikeshedding normalisation

#3663 · opened Dec 21, 2018 by Mathieu Giraud Boldrini-Brasil client-normalization
- 3
updated Jan 07, 2019
Deux réglages distincts de normalisation

#3664 · opened Dec 28, 2018 by Mathieu Giraud client client-normalization wont-fix
- 2
updated Jan 08, 2019
Mauvaise position des clones dans le rapport exporté

#3665 · opened Dec 28, 2018 by Mathieu Giraud !!-bug *-go client-grid client-rapport
- 0
updated Jan 10, 2019
Impossible de modifier les permissions d'un groupe

#3669 · opened Jan 02, 2019 by Mikaël Salson !!-bug !-easy *-go server server-admin server-auth server-ergonomy server-groups server-permissions
- 6
updated Feb 11, 2020
QUnit: assert.pushResult

#3671 · opened Jan 10, 2019 by Mathieu Giraud *-go dev-tests
- 0
updated Jan 10, 2019
Documenter dans js/lib/info.txt les librairies manquantes

#3672 · opened Jan 10, 2019 by Mathieu Giraud *-go dev-robust doc
- 0
updated Jan 10, 2019
Avoir un color by par la evalue

#3674 · opened Jan 15, 2019 by Thonier Florian client client-axis client-ergonomy feature
- 1
updated Jan 15, 2019
tools/defs.py : ne plus le versionner (et .sample, docker) 0 of 2 tasks completed

#3676 · opened Jan 15, 2019 by Mikaël Salson *-go server-admin server-docker server-fuse
- 1
updated Jan 15, 2019
Axe "qualité moyenne"

#3677 · opened Jan 15, 2019 by Mathieu Giraud client client-axis
- 0
updated Jan 15, 2019
axes: pouvoir afficher n'importe quel NumericAxis comme couleur

#3678 · opened Jan 15, 2019 by Mathieu Giraud client client-axis client-color-by client-ergonomy repseq-IMGT
- 3
updated Jun 10, 2020
id des groupes, admin des configs

#3680 · opened Jan 15, 2019 by Mathieu Giraud *-go bikeshedding priority-1-low server-admin
- 2
updated Jan 15, 2019
Avoir des champs search dans certaines dropdown

#3683 · opened Jan 17, 2019 by Thonier Florian !-reflexion client client-accessibility feature server-ergonomy
- 1
updated Feb 28, 2019
algo: sortir {} dans le .vidjil quand il n'y a pas de clones

#3685 · opened Jan 17, 2019 by Mathieu Giraud !-easy cpp priority-1-low
- 0
updated Dec 03, 2019
Bouton droit sur le client

#3686 · opened Jan 17, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion client-ergonomy
- 0
updated Jan 17, 2019
Champ de recherche sur la page d'un sample set : utiliser l'autocomplétion

#3687 · opened Jan 17, 2019 by Mikaël Salson !-easy *-go client-autocomplete server server-ergonomy
- 0
updated Feb 28, 2019
conf.js : Si le message d'alerte est trop long, il n'est pas visible

#3690 · opened Jan 28, 2019 by Mikaël Salson !-easy *-go client-ergonomy client-notifications
- 0
updated Jan 28, 2019
Se passer de web2py : py4web, autres ?

#3691 · opened Jan 29, 2019 by Mathieu Giraud !-hard !-reflexion server-speed
- 1
updated Jan 28, 2020
Message d'avertissement si la version du browser n'est pas officiellement supportée

#3696 · opened Jan 31, 2019 by Mathieu Giraud #-quality *-go client com-first-time-user
- 1
updated Feb 01, 2019
Chrome : l'export du rapport en offline ne fonctionne pas

#3699 · opened Feb 04, 2019 by Mikaël Salson !!-bug client client-rapport
- 1
- 6
updated Feb 13, 2020
Documenter les variables d'environnement

#3703 · opened Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud *-go dev-gitlab doc
- 0
updated Feb 05, 2019
css et règles -{moz,webkit}-*

#3704 · opened Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud client-less-css
- 4
updated Feb 05, 2019
Stocker les tickets à l'extérieur du Dock

#3707 · opened Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud *-go server-docker server-monitor
- 0
updated Nov 22, 2019
Tester une version récente de Firefox

#3709 · opened Feb 05, 2019 by Mikaël Salson dev-ci dev-tests dev-tests-watir
- 5
updated Nov 29, 2019
Ascenseur de la liste des clones curieux sous FF

#3710 · opened Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud client-cloneList client-less-css priority-1-low
- 0
updated Feb 05, 2019
Test fonctionnel en echec pourtant validé

#3711 · opened Feb 06, 2019 by Thonier Florian !!-bug dev-ci
- 0
updated Feb 06, 2019
Débordement en dehors des div sur les listes patients/runs

#3712 · opened Feb 07, 2019 by Thonier Florian client client-design server-ergonomy
- 0
updated Feb 28, 2019
Champs ajout patient/run/sample bloqué lors de l'ajout d'échantillon

#3713 · opened Feb 08, 2019 by Thonier Florian !!-bug client client-tags
- 3
updated Feb 08, 2019
Pouvoir supprimer les primers des séquences

#3714 · opened Feb 08, 2019 by Thonier Florian LIL-Lille REN-Rennes bio-CLL bio-primers client client-filter feature user-request
- 6
updated Nov 22, 2019
CloneDB : afficher les tags

#3716 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson +-deploy LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
- 1
- 2
updated Dec 03, 2019
CloneDB : les sample sets peuvent être redondants

#3717 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
- 1
updated Feb 11, 2019
CloneDB : lien pour lancer un compare sample

#3720 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson app-clonedb feature
- 0
updated Feb 11, 2019
Mécanisme plus souple d'affichage dans getHtmlInfo de clone.js

#3721 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson !-reflexion client client-cloneList client-info
- 1
updated Aug 05, 2020
Releases algo sur page gitlab ?

#3723 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud com cpp
- 0
updated Feb 12, 2019
Supprimer KMER_INDEX ?

#3724 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp cpp-aho wont-fix
- 2
updated Feb 12, 2019
Savoir si une germline est incomplète ou pas ?

#3725 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud !-easy bio-germlines-pseudo cpp dev-refactor priority-1-low
- 0
updated Feb 12, 2019
AFFECT_UNKNOWN à la fin des affectations avec Aho et probas

#3726 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud bio-e-value cpp-heuristic math-stats
- 0
updated Feb 12, 2019
Utilisation de getS() ou de la graîne avec Aho-Corasick

#3727 · opened Feb 12, 2019 by Mikaël Salson Heuristique 2.0 cpp cpp-aho cpp-heuristic dev-refactor
- 4
updated Feb 28, 2019
Aho : ne le mettre par défaut qu'à partir d'une certaine taille ?

#3730 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud com-first-time-user cpp-speed
- 4
updated May 07, 2020
Add germlines genes pour tous

#3731 · opened Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud CLL-2018-septembre client-aligner com-vw-vidjil-workshop user-request
- 2
updated Nov 22, 2019
Output files depuis client ?

#3732 · opened Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion priority-1-low
- 0
updated Feb 13, 2019
Réflexion sur chart.js

#3734 · opened Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud Feb 13, 2020 !-hard !-reflexion client
- 0
updated Feb 13, 2019
Affichage des différents niveaux de warning

#3735 · opened Feb 13, 2019 by Mikaël Salson client client-ergonomy client-warning
- 1
updated Feb 14, 2019
FineSegmenter et séquences revcomp ?

#3736 · opened Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-finesegmenter dev-refactor priority-1-low
- 1
updated May 28, 2020
Afficher dans la grid des clones en carrés ou autre

#3737 · opened Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion *-go bikeshedding client-design client-grid client-ugly
- 6
updated Feb 14, 2019
Analyse statique du code C++

#3738 · opened Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud #-quality cpp
- 5
updated Mar 21, 2019
Retirer les `using namespace std`

#3739 · opened Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-easy *-go cpp dev-refactor
- 0
updated Feb 14, 2019
Identifier quel est le test should-vdj loupé au milieu d'un lancement groupé

#3740 · opened Feb 16, 2019 by Mathieu Giraud dev-ci dev-tests-curated-vdj
- 1
- 1
updated May 20, 2020
redéployer la doc

#3741 · opened Feb 18, 2019 by Mathieu Giraud com-first-time-user doc ⟳-recurring-issue
- 3
updated Mar 14, 2019
Des clones ne sont pas rendu sur le graphiques

#3742 · opened Feb 22, 2019 by Thonier Florian client client-graph doc
- 5
updated Jul 24, 2020
Pouvoir colorer suivant l'evolution d'un clone

#3743 · opened Feb 22, 2019 by Thonier Florian client client-ergonomy client-graph feature
- 2
updated Feb 22, 2019
Avoir un bouton pour generer un mot de passe aléatoire

#3744 · opened Feb 22, 2019 by Thonier Florian client client-ergonomy feature
- 1
updated Feb 05, 2020
Gestion des erreurs client (et serveur ?)

#3745 · opened Feb 22, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion #-ethics #-privacy dev-gitlab server-monitor
- 4
updated May 23, 2020
Option to keep only productive recombinations

#3747 · opened Feb 26, 2019 by Mathieu Giraud Paris-Pitié THE-Thessaloniki bio-AA
- 0
updated Feb 26, 2019
Read merger: INAB tool ?

#3749 · opened Feb 26, 2019 by Mathieu Giraud Paris-Pitié THE-Thessaloniki server-pre-process
- 0
updated Feb 26, 2019
Mettre à jour web2py (tests unitaires serveurs échouent)

#3751 · opened Feb 27, 2019 by Mikaël Salson dev-tests server
- 7
updated May 26, 2020
Affichage du lien vers l'analyse d'un sample réassocié à un patient/run/set

#3753 · opened Feb 28, 2019 by Anne de Septenville Paris-Pitié server server-ergonomy server-sample-sets
- 5
updated Mar 11, 2019
Accès local à db.vidjil.org par conf.js

#3754 · opened Feb 28, 2019 by Mathieu Giraud !-important server-hosting
- 21
updated Oct 08, 2019
Plus de tests should-vdj sur des séquences unexpected

#3760 · opened Feb 28, 2019 by Mathieu Giraud *-go bio-germlines-pseudo dev-tests dev-tests-curated-vdj
- 0
updated Feb 28, 2019
Extraire des tests 'a' des tests 'f' dans un stage gitlab

#3763 · opened Feb 28, 2019 by Mathieu Giraud !-easy *-go dev-ci dev-policy dev-tests-should-get
- 3
updated Apr 01, 2019
Mettre Jenkins sur une autre branche que dev ?

#3768 · opened Mar 01, 2019 by Mathieu Giraud dev-ci
- 3
updated Mar 01, 2019
Documenter les besoins mémoire de vidjil-algo

#3770 · opened Mar 01, 2019 by Mathieu Giraud cpp-mem cpp-speed dev-ci doc
- 0
updated Mar 01, 2019
Vidjil-algo / CLI11: mieux utiliser et homogénéiser le mécanisme d'erreurs

#3775 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud cpp priority-1-low
- 1
updated Mar 14, 2019
app/analyze: info sur ligne de commande, version vidjil-algo, log...

#3776 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud *-go app-analyze priority-1-low
- 1
updated Mar 15, 2019
app/analyze: séquences de démo

#3777 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud *-go app-analyze com-first-time-user
- 0
updated Mar 06, 2019
FineSegmenter donne Unexpected +TRBV/+TRBJ+down au lieu de VJ

#3780 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud LIL-Immuno bio-e-value bio-germlines-unexpected cpp cpp-finesegmenter
- 7
updated Mar 06, 2019
Association de samples à sample sets : documenter, mieux indiquer

#3781 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud *-go doc server-sample-sets
- 0
updated Jan 23, 2020
Options courtes -x/-X/-y/-z : supprimer, renommer ?

#3782 · opened Mar 07, 2019 by Mathieu Giraud bikeshedding cpp-options
- 1
updated Mar 20, 2019
Une séquence vide peut générer un bad_alloc ?

#3783 · opened Mar 07, 2019 by Mathieu Giraud *-too-vague cpp priority-1-low
- 1
updated Mar 07, 2019
Combos ?

#3786 · opened Mar 08, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion bikeshedding com-first-time-user cpp-options
- 2
updated Mar 11, 2019
Avoir plus de jeux de données réels complets, montrant différentes situations bio

#3788 · opened Mar 10, 2019 by Mathieu Giraud *-go com-first-time-user
- 9
updated Jul 09, 2020
Tester les configs par défaut de modules/vidjil_utils.py

#3790 · opened Mar 12, 2019 by Mathieu Giraud *-go com-first-time-user dev-tests server-config
- 0
updated Mar 12, 2019
Tester les configs d'un serveur

#3791 · opened Mar 12, 2019 by Mathieu Giraud *-go dev-tests server-config
- 2
updated Mar 15, 2019