Issues · vidjil / vidjil

New issue

Axe "qualité moyenne"

#3677 · opened Jan 15, 2019 by Mathieu Giraud client client-axis
- 0
updated Jan 15, 2019
axes: pouvoir afficher n'importe quel NumericAxis comme couleur

#3678 · opened Jan 15, 2019 by Mathieu Giraud client client-axis client-color-by client-ergonomy repseq-IMGT
- 3
updated Jun 10, 2020
id des groupes, admin des configs

#3680 · opened Jan 15, 2019 by Mathieu Giraud *-go bikeshedding priority-1-low server-admin
- 2
updated Jan 15, 2019
Avoir des champs search dans certaines dropdown

#3683 · opened Jan 17, 2019 by Thonier Florian !-reflexion client client-accessibility feature server-ergonomy
- 1
updated Feb 28, 2019
algo: sortir {} dans le .vidjil quand il n'y a pas de clones

#3685 · opened Jan 17, 2019 by Mathieu Giraud !-easy cpp priority-1-low
- 0
updated Dec 03, 2019
Bouton droit sur le client

#3686 · opened Jan 17, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion client-ergonomy
- 0
updated Jan 17, 2019
Champ de recherche sur la page d'un sample set : utiliser l'autocomplétion

#3687 · opened Jan 17, 2019 by Mikaël Salson !-easy *-go client-autocomplete server server-ergonomy
- 0
updated Feb 28, 2019
conf.js : Si le message d'alerte est trop long, il n'est pas visible

#3690 · opened Jan 28, 2019 by Mikaël Salson !-easy *-go client-ergonomy client-notifications
- 0
updated Jan 28, 2019
Se passer de web2py : py4web, autres ?

#3691 · opened Jan 29, 2019 by Mathieu Giraud !-hard !-reflexion server-speed
- 2
updated Oct 20, 2020
Message d'avertissement si la version du browser n'est pas officiellement supportée

#3696 · opened Jan 31, 2019 by Mathieu Giraud #-quality *-go client com-first-time-user
- 9
updated Sep 30, 2020
Chrome : l'export du rapport en offline ne fonctionne pas

#3699 · opened Feb 04, 2019 by Mikaël Salson !!-bug client client-rapport
- 1
- 6
updated Feb 13, 2020
Documenter les variables d'environnement

#3703 · opened Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud *-go dev-gitlab doc
- 0
updated Feb 05, 2019
css et règles -{moz,webkit}-*

#3704 · opened Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud client-less-css
- 4
updated Feb 05, 2019
Stocker les tickets à / Accéder aux tickets depuis l'extérieur du Dock

#3707 · opened Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud *-go server-docker server-monitor
- 1
updated Oct 20, 2020
Tester une version récente de Firefox, dont au moins FF 78 ESR

#3709 · opened Feb 05, 2019 by Mikaël Salson !-important dev-ci dev-tests dev-tests-watir
- 10
updated Sep 22, 2020
Ascenseur de la liste des clones curieux sous FF

#3710 · opened Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud client-cloneList client-less-css priority-1-low
- 0
updated Feb 05, 2019
Test fonctionnel en echec pourtant validé

#3711 · opened Feb 06, 2019 by Thonier Florian !!-bug dev-ci
- 0
updated Feb 06, 2019
Débordement en dehors des div sur les listes patients/runs

#3712 · opened Feb 07, 2019 by Thonier Florian client client-design server-ergonomy
- 0
updated Feb 28, 2019
Champs ajout patient/run/sample bloqué lors de l'ajout d'échantillon

#3713 · opened Feb 08, 2019 by Thonier Florian !!-bug client client-tags
- 3
updated Feb 08, 2019
Pouvoir supprimer les primers des séquences

#3714 · opened Feb 08, 2019 by Thonier Florian LIL-Lille REN-Rennes bio-CLL bio-primers client client-filter feature next-audio user-request
- 8
updated Jan 15, 2021
CloneDB : afficher les tags

#3716 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson +-deploy LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
- 1
- 2
updated Dec 03, 2019
CloneDB : les sample sets peuvent être redondants

#3717 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
- 1
updated Feb 11, 2019
CloneDB : lien pour lancer un compare sample

#3720 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson app-clonedb feature
- 0
updated Feb 11, 2019
Mécanisme plus souple d'affichage dans getHtmlInfo de clone.js

#3721 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson !-reflexion client client-cloneList client-info
- 1
updated Dec 04, 2020
Releases algo sur page gitlab ?

#3723 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud com cpp
- 0
updated Feb 12, 2019
Supprimer KMER_INDEX ?

#3724 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp cpp-aho wont-fix
- 2
updated Feb 12, 2019
Savoir si une germline est incomplète ou pas ?

#3725 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud !-easy bio-germlines-pseudo cpp dev-refactor priority-1-low
- 0
updated Feb 12, 2019
AFFECT_UNKNOWN à la fin des affectations avec Aho et probas

#3726 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud bio-e-value cpp-heuristic math-stats
- 0
updated Feb 12, 2019
Utilisation de getS() ou de la graîne avec Aho-Corasick

#3727 · opened Feb 12, 2019 by Mikaël Salson Heuristique 2.0 cpp cpp-aho cpp-heuristic dev-refactor
- 4
updated Feb 28, 2019
Aho : ne le mettre par défaut qu'à partir d'une certaine taille ?

#3730 · opened Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud com-first-time-user cpp-speed
- 4
updated May 07, 2020
Add germlines genes pour tous

#3731 · opened Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud CLL-2018-septembre client-aligner com-vw-vidjil-workshop user-request
- 2
updated Oct 14, 2020
Output files depuis client ?

#3732 · opened Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion priority-1-low
- 0
updated Feb 13, 2019
Réflexion sur chart.js

#3734 · opened Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud Feb 13, 2020 !-hard !-reflexion client
- 0
updated Feb 13, 2019
Affichage des différents niveaux de warning

#3735 · opened Feb 13, 2019 by Mikaël Salson client client-ergonomy client-warning
- 1
updated Feb 14, 2019
FineSegmenter et séquences revcomp ?

#3736 · opened Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-finesegmenter dev-refactor priority-1-low
- 1
updated May 28, 2020
Afficher dans la grid des clones en carrés ou autre

#3737 · opened Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion *-go bikeshedding client-design client-grid client-ugly
- 6
updated Feb 14, 2019
Analyse statique du code C++

#3738 · opened Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud #-quality cpp dev-code-quality
- 6
updated Aug 27, 2020
Retirer les `using namespace std`

#3739 · opened Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-easy *-go cpp dev-refactor
- 0
updated Feb 14, 2019
Identifier quel est le test should-vdj loupé au milieu d'un lancement groupé

#3740 · opened Feb 16, 2019 by Mathieu Giraud dev-ci dev-tests-curated-vdj
- 1
- 1
updated May 20, 2020
redéployer la doc

#3741 · opened Feb 18, 2019 by Mathieu Giraud com-first-time-user doc ⟳-recurring-issue
- 3
updated Mar 14, 2019
Des clones ne sont pas rendu sur le graphiques

#3742 · opened Feb 22, 2019 by Thonier Florian client client-graph doc
- 5
updated Jul 24, 2020
Pouvoir colorer suivant l'evolution d'un clone

#3743 · opened Feb 22, 2019 by Thonier Florian client client-ergonomy client-graph feature
- 2
updated Feb 22, 2019
Avoir un bouton pour generer un mot de passe aléatoire

#3744 · opened Feb 22, 2019 by Thonier Florian client client-ergonomy feature server-auth
- 1
updated Nov 13, 2020
Gestion des erreurs client (et serveur ?)

#3745 · opened Feb 22, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion #-ethics #-privacy dev-gitlab server-monitor
- 4
updated May 23, 2020
Option to keep only productive recombinations

#3747 · opened Feb 26, 2019 by Mathieu Giraud Paris-Pitié THE-Thessaloniki bio-AA
- 0
updated Feb 26, 2019
Read merger: INAB tool ?

#3749 · opened Feb 26, 2019 by Mathieu Giraud Paris-Pitié THE-Thessaloniki server-pre-process
- 0
updated Feb 26, 2019
Mettre à jour web2py (tests unitaires serveurs échouent)

#3751 · opened Feb 27, 2019 by Mikaël Salson dev-tests server
- 7
updated Oct 20, 2020
Affichage du lien vers l'analyse d'un sample réassocié à un patient/run/set

#3753 · opened Feb 28, 2019 by Anne de Septenville Paris-Pitié server server-ergonomy server-sample-sets
- 5
updated Mar 11, 2019
Accès local à db.vidjil.org par conf.js

#3754 · opened Feb 28, 2019 by Mathieu Giraud !-important server-hosting
- 21
updated Oct 08, 2019
Plus de tests should-vdj sur des séquences unexpected

#3760 · opened Feb 28, 2019 by Mathieu Giraud *-go bio-germlines-pseudo dev-tests dev-tests-curated-vdj
- 0
updated Feb 28, 2019
Extraire des tests 'a' des tests 'f' dans un stage gitlab

#3763 · opened Feb 28, 2019 by Mathieu Giraud !-easy *-go dev-ci dev-policy dev-tests-should-get
- 3
updated Apr 01, 2019
Documenter les besoins mémoire de vidjil-algo

#3770 · opened Mar 01, 2019 by Mathieu Giraud cpp-mem cpp-speed dev-ci doc
- 0
updated Mar 01, 2019
Vidjil-algo / CLI11: mieux utiliser et homogénéiser le mécanisme d'erreurs

#3775 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud cpp priority-1-low
- 1
updated Mar 14, 2019
app/analyze: info sur ligne de commande, version vidjil-algo, log...

#3776 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud *-go app-analyze priority-1-low
- 1
updated Mar 15, 2019
app/analyze: séquences de démo

#3777 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud *-go app-analyze com-first-time-user
- 0
updated Mar 06, 2019
FineSegmenter donne Unexpected +TRBV/+TRBJ+down au lieu de VJ

#3780 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud LIL-Immuno bio-e-value bio-germlines-unexpected cpp cpp-finesegmenter
- 7
updated Mar 06, 2019
Association de samples à sample sets : documenter, mieux indiquer

#3781 · opened Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud *-go doc server-sample-sets
- 0
updated Jan 23, 2020
Options courtes -x/-X/-y/-z : supprimer, renommer ?

#3782 · opened Mar 07, 2019 by Mathieu Giraud bikeshedding cpp-options
- 1
updated Mar 20, 2019
Une séquence vide peut générer un bad_alloc ?

#3783 · opened Mar 07, 2019 by Mathieu Giraud *-too-vague cpp priority-1-low
- 1
updated Mar 07, 2019
Combos ?

#3786 · opened Mar 08, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion bikeshedding com-first-time-user cpp-options
- 2
updated Mar 11, 2019
Avoir plus de jeux de données réels complets, montrant différentes situations bio

#3788 · opened Mar 10, 2019 by Mathieu Giraud *-go com-first-time-user
- 10
updated Dec 09, 2020
Tester les configs par défaut de modules/vidjil_utils.py

#3790 · opened Mar 12, 2019 by Mathieu Giraud *-go com-first-time-user dev-tests server-config
- 0
updated Mar 12, 2019
Tester les configs d'un serveur

#3791 · opened Mar 12, 2019 by Mathieu Giraud *-go dev-tests server-config
- 2
updated Mar 15, 2019
Comment modifier le owner d'un sample/patient/run ?

#3794 · opened Mar 13, 2019 by Thonier Florian client client-ergonomy server-database
- 2
updated Mar 13, 2019
Les icones du IGH n'apparaissent pas sur ce sample/patient

#3796 · opened Mar 14, 2019 by Thonier Florian !!-bug client client-design
- 2
updated Mar 14, 2019
Docker vidjil/client : les fichiers de configuration de l'hôte sont-ils pris en compte ?

#3797 · opened Mar 14, 2019 by Mikaël Salson !!-bug server-admin server-docker
- 0
updated Mar 14, 2019
Que se passe-t-il si on supprime une config ?

#3799 · opened Mar 14, 2019 by Mikaël Salson !-important !-reflexion doc server-config
- 0
updated Mar 14, 2019
Tutorial : traduire les nouveautés en français

#3801 · opened Mar 14, 2019 by Mathieu Giraud com-mail-template doc-tutorial
- 2
updated Dec 04, 2020
Quelques problèmes de CSS - div tronquée/cachée

#3802 · opened Mar 15, 2019 by Thonier Florian client client-design client-ergonomy client-less-css client-ugly
- 0
updated Mar 15, 2019
Passer en HTML5

#3803 · opened Mar 15, 2019 by Thonier Florian !-reflexion client
- 3
updated Mar 15, 2019
Docker : rendre les sessions persistantes ?

#3804 · opened Mar 15, 2019 by Mikaël Salson server server-docker
- 0
updated Nov 22, 2019
Timeout plus long : affiner, allonger encore ?

#3806 · opened Mar 15, 2019 by Mathieu Giraud client client-ergonomy
- 2
updated Nov 07, 2019
CloneDB : hover sur warning bleu

#3807 · opened Mar 17, 2019 by Mathieu Giraud app-clonedb client
- 0
updated Mar 17, 2019
get reads : sortie moins intrusive

#3809 · opened Mar 18, 2019 by Mathieu Giraud client-ergonomy
- 4
updated Mar 21, 2019
Séléction multiple en compare sample sur des clones avec zéro reads

#3813 · opened Mar 18, 2019 by Thonier Florian !!-bug client client-grid
- 6
updated Mar 21, 2019
Surligner dans le segmenteur la séquence que l'on a rentrée dans le search.

#3814 · opened Mar 18, 2019 by Thonier Florian Amiens-Nordine client client-aligner client-ergonomy feature
- 6
updated Oct 14, 2020
Mauvais alignement entre une séquence et ses séquences germinales

#3815 · opened Mar 18, 2019 by Thonier Florian !!-bug client-aligner
- 3
updated Mar 18, 2019
Commande pour filtrer les reads sur la taille, pour les dimers

#3816 · opened Mar 18, 2019 by Thonier Florian LIL-Immuno server-pre-process user-request
- 2
updated Mar 18, 2019
Erreur client sur une séquence particulière

#3817 · opened Mar 18, 2019 by Mikaël Salson !!-bug Paris-Pitié client client-aligner
- 0
updated Mar 18, 2019
Concaténation de jeux de données, cat

#3818 · opened Mar 18, 2019 by Mathieu Giraud *-go com-vw-vidjil-workshop server-pre-process user-request
- 0
updated Mar 18, 2019
Problème à la séléction des locus

#3819 · opened Mar 18, 2019 by Thonier Florian !!-bug client client-aligner
- 1
updated Mar 18, 2019
Tooltip sur les clones

#3821 · opened Mar 18, 2019 by Mathieu Giraud client-ergonomy client-graph client-grid feature
- 2
updated Oct 31, 2019
CAR-T; permettre de labelliser une séquence dans l'interface

#3822 · opened Mar 18, 2019 by Thonier Florian LON-Jack bio-external-data client client-virtual-clone feature patho-CAR-T
- 3
updated Mar 21, 2019
Avoir un petit triangle « from IgBlast » de la même manière que pour IMGT

#3824 · opened Mar 18, 2019 by Mikaël Salson client-aligner feature repseq-community
- 0
updated Mar 18, 2019
Heuristique du FineSegmenter : compter plus finement les occurrences

#3825 · opened Mar 18, 2019 by Mikaël Salson cpp cpp-filter-fine
- 0
updated Mar 18, 2019
Événements pour un patient : vue dans le client

#3826 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion LON-Jack client user-request
- 1
updated Mar 19, 2019
Avoir une bouton pour lancer une analyse sur tous les samples

#3827 · opened Mar 19, 2019 by Thonier Florian Paris-Pitié feature server server-ergonomy server-sample-sets
- 1
- 3
updated Nov 20, 2020
Soustraire les clones communs à deux échantillons / comparaison de répertoires

#3828 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud Amiens-Nordine client client-filter server-compare-samples server-fuse user-request
- 2
updated Jul 09, 2020
get support : avoir quelque chose qui ne repose pas forcément sur un mailer

#3829 · opened Mar 19, 2019 by Mikaël Salson client client-ergonomy com-mail-template
- 6
updated Mar 20, 2019
Upload puis lancement multiple via .csv

#3832 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud !-hard !-reflexion TOU-Toulouse priority-1-low server server-task.py
- 2
updated Mar 19, 2019
Demander plusieurs alignement successifs fait planter le segmenteur

#3835 · opened Mar 19, 2019 by Mikaël Salson !!-bug LIL-Lille client client-aligner
- 5
updated Oct 14, 2020
pouvoir composer les preprocess à la carte

#3836 · opened Mar 19, 2019 by Thonier Florian !-reflexion server-pre-process
- 1
updated Jul 28, 2020
Demander confirmation avant la sauvegarde d'analyse en tant qu'admin

#3840 · opened Mar 19, 2019 by Thonier Florian !-security #-quality *-go server-admin
- 1
- 1
updated Mar 19, 2019
User interface for entering spikes

#3846 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion bio-mrd bio-spikes client priority-1-low
- 0
updated Jan 19, 2021
Server error au multi-upload

#3849 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud !!-bug com-vw-vidjil-workshop server server-upload
- 1
updated Mar 20, 2019
Pouvoir exporter des clones au format AIRR depuis l'interface

#3850 · opened Mar 20, 2019 by Thonier Florian client client-export feature
- 1
updated Feb 25, 2020
Pouvoir montrer quelques stats de répertoires depuis l'interface

#3851 · opened Mar 20, 2019 by Thonier Florian bio-diversity client client-ergonomy client-menu feature
- 1
updated Mar 21, 2019
Grep reads et vidjil-algo : le fichier résultant peut mélanger FASTA et FASTQ

#3852 · opened Mar 20, 2019 by Mikaël Salson cpp cpp-export repseq-formats
- 6
updated Mar 21, 2019
Comment calculer les informations à stocker pour des données pairées ou single-cell ?

#3853 · opened Mar 20, 2019 by Mikaël Salson !-reflexion bio-paired-chains server-fuse
- 0
updated Mar 20, 2019
CLI11 : level() / advanced help et upstream

#3854 · opened Mar 21, 2019 by Mathieu Giraud *-go cpp-options
- 0
updated Mar 21, 2019