Issues · vidjil / vidjil

New issue

Champ de recherche sur la page d'un sample set : utiliser l'autocomplétion

#3687 · created Jan 17, 2019 by Mikaël Salson !-easy *-go client-autocomplete server server-ergonomy
- 0
updated Feb 28, 2019
conf.js : Si le message d'alerte est trop long, il n'est pas visible

#3690 · created Jan 28, 2019 by Mikaël Salson !-easy *-go client-ergonomy client-notifications
- 0
updated Jan 28, 2019
Se passer de web2py : py4web, autres ?

#3691 · created Jan 29, 2019 by Mathieu Giraud !-hard !-reflexion server-speed
- 3
updated Jan 27, 2021
Message d'avertissement si la version du browser n'est pas officiellement supportée

#3696 · created Jan 31, 2019 by Mathieu Giraud #-quality *-go client com-first-time-user
- 9
updated Sep 30, 2020
Chrome : l'export du rapport en offline ne fonctionne pas

#3699 · created Feb 04, 2019 by Mikaël Salson !!-bug client client-rapport
- 1
- 6
updated Feb 13, 2020
Documenter les variables d'environnement

#3703 · created Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud *-go dev-gitlab doc
- 0
updated Feb 05, 2019
css et règles -{moz,webkit}-*

#3704 · created Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud client-less-css
- 4
updated Feb 05, 2019
Stocker les tickets à / Accéder aux tickets depuis l'extérieur du Dock

#3707 · created Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud *-go server-docker server-monitor
- 1
updated Oct 20, 2020
Tester une version récente de Firefox, dont au moins FF 78 ESR

#3709 · created Feb 05, 2019 by Mikaël Salson Tests-Dev-2021-05 !-important dev-ci dev-tests dev-tests-watir
- 11
updated Apr 19, 2021
Ascenseur de la liste des clones curieux sous FF

#3710 · created Feb 05, 2019 by Mathieu Giraud client-cloneList client-less-css priority-1-low
- 0
updated Feb 05, 2019
Test fonctionnel en echec pourtant validé

#3711 · created Feb 06, 2019 by Thonier Florian !!-bug dev-ci
- 0
updated Feb 06, 2019
Débordement en dehors des div sur les listes patients/runs

#3712 · created Feb 07, 2019 by Thonier Florian client client-design server-ergonomy
- 0
updated Feb 28, 2019
Champs ajout patient/run/sample bloqué lors de l'ajout d'échantillon

#3713 · created Feb 08, 2019 by Thonier Florian !!-bug client client-tags
- 3
updated Feb 08, 2019
Pouvoir supprimer les primers des séquences

#3714 · created Feb 08, 2019 by Thonier Florian LIL-Lille REN-Rennes bio-CLL bio-primers client client-filter feature user-request
- 9
updated Feb 05, 2021
CloneDB : afficher les tags

#3716 · created Feb 11, 2019 by Mikaël Salson +-deploy LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
- 1
- 2
updated Dec 03, 2019
CloneDB : les sample sets peuvent être redondants

#3717 · created Feb 11, 2019 by Mikaël Salson LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
- 1
updated Feb 11, 2019
CloneDB : lien pour lancer un compare sample

#3720 · created Feb 11, 2019 by Mikaël Salson app-clonedb feature
- 0
updated Feb 11, 2019
Mécanisme plus souple d'affichage dans getHtmlInfo de clone.js

#3721 · created Feb 11, 2019 by Mikaël Salson !-reflexion client client-cloneList client-info
- 1
updated Dec 04, 2020
Releases algo sur page gitlab ?

#3723 · created Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud com cpp
- 0
updated Feb 12, 2019
Supprimer KMER_INDEX ?

#3724 · created Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp cpp-aho wont-fix
- 2
updated Feb 12, 2019
Savoir si une germline est incomplète ou pas ?

#3725 · created Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud !-easy bio-germlines-pseudo cpp dev-refactor priority-1-low
- 0
updated Feb 12, 2019
AFFECT_UNKNOWN à la fin des affectations avec Aho et probas

#3726 · created Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud bio-e-value cpp-heuristic math-stats
- 0
updated Feb 12, 2019
Utilisation de getS() ou de la graîne avec Aho-Corasick

#3727 · created Feb 12, 2019 by Mikaël Salson Heuristique 2.0 cpp cpp-aho cpp-heuristic dev-refactor
- 4
updated Feb 28, 2019
Aho : ne le mettre par défaut qu'à partir d'une certaine taille ?

#3730 · created Feb 12, 2019 by Mathieu Giraud com-first-time-user cpp-speed
- 4
updated May 07, 2020
Add germlines genes pour tous

#3731 · created Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud CLL-2018-septembre client-aligner com-vw-vidjil-workshop user-request
- 2
updated Oct 14, 2020
Output files depuis client ?

#3732 · created Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion priority-1-low
- 0
updated Feb 13, 2019
Réflexion sur chart.js

#3734 · created Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud Feb 13, 2020 !-hard !-reflexion client
- 0
updated Feb 13, 2019
Affichage des différents niveaux de warning

#3735 · created Feb 13, 2019 by Mikaël Salson client client-ergonomy client-warning warning-meta
- 2
updated Feb 03, 2021
FineSegmenter et séquences revcomp ?

#3736 · created Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion cpp-finesegmenter dev-refactor priority-1-low
- 1
updated May 28, 2020
Afficher dans la grid des clones en carrés ou autre

#3737 · created Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion *-go bikeshedding client-design client-grid client-ugly
- 6
updated Feb 14, 2019
Analyse statique du code C++

#3738 · created Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud #-quality cpp dev-code-quality
- 6
updated Aug 27, 2020
Retirer les `using namespace std`

#3739 · created Feb 14, 2019 by Mathieu Giraud !-easy *-go cpp dev-refactor
- 0
updated Feb 14, 2019
Identifier quel est le test should-vdj loupé au milieu d'un lancement groupé

#3740 · created Feb 16, 2019 by Mathieu Giraud dev-ci dev-tests-curated-vdj
- 1
- 1
updated May 20, 2020
redéployer la doc

#3741 · created Feb 18, 2019 by Mathieu Giraud com-first-time-user doc ⟳-recurring-issue
- 3
updated Mar 14, 2019
Des clones ne sont pas rendu sur le graphiques

#3742 · created Feb 22, 2019 by Thonier Florian client client-graph doc
- 5
updated Jul 24, 2020
Pouvoir colorer suivant l'evolution d'un clone

#3743 · created Feb 22, 2019 by Thonier Florian client client-ergonomy client-graph feature
- 2
updated Feb 22, 2019
Avoir un bouton pour generer un mot de passe aléatoire

#3744 · created Feb 22, 2019 by Thonier Florian client client-ergonomy feature server-auth
- 1
updated Nov 13, 2020
Gestion des erreurs client (et serveur ?)

#3745 · created Feb 22, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion #-ethics #-privacy dev-gitlab server-monitor
- 4
updated May 23, 2020
Option to keep only productive recombinations

#3747 · created Feb 26, 2019 by Mathieu Giraud Paris-Pitié THE-Thessaloniki bio-AA
- 0
updated Feb 26, 2019
Read merger: INAB tool ?

#3749 · created Feb 26, 2019 by Mathieu Giraud Paris-Pitié THE-Thessaloniki server-pre-process
- 0
updated Feb 26, 2019
Mettre à jour web2py (tests unitaires serveurs échouent)

#3751 · created Feb 27, 2019 by Mikaël Salson dev-tests server
- 7
updated Oct 20, 2020
Affichage du lien vers l'analyse d'un sample réassocié à un patient/run/set

#3753 · created Feb 28, 2019 by Anne de Septenville Paris-Pitié server server-ergonomy server-sample-sets
- 5
updated Mar 11, 2019
Accès local à db.vidjil.org par conf.js

#3754 · created Feb 28, 2019 by Mathieu Giraud !-important server-hosting
- 21
updated Oct 08, 2019
Plus de tests should-vdj sur des séquences unexpected

#3760 · created Feb 28, 2019 by Mathieu Giraud *-go bio-germlines-pseudo dev-tests dev-tests-curated-vdj
- 0
updated Feb 28, 2019
Extraire des tests 'a' des tests 'f' dans un stage gitlab

#3763 · created Feb 28, 2019 by Mathieu Giraud !-easy *-go dev-ci dev-policy dev-tests-should-get
- 3
updated Apr 01, 2019
Documenter les besoins mémoire de vidjil-algo

#3770 · created Mar 01, 2019 by Mathieu Giraud cpp-mem cpp-speed dev-ci doc
- 0
updated Mar 01, 2019
Vidjil-algo / CLI11: mieux utiliser et homogénéiser le mécanisme d'erreurs

#3775 · created Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud cpp priority-1-low
- 1
updated Mar 14, 2019
app/analyze: info sur ligne de commande, version vidjil-algo, log...

#3776 · created Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud *-go app-analyze priority-1-low
- 1
updated Mar 15, 2019
app/analyze: séquences de démo

#3777 · created Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud *-go app-analyze com-first-time-user
- 0
updated Mar 06, 2019
FineSegmenter donne Unexpected +TRBV/+TRBJ+down au lieu de VJ

#3780 · created Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud LIL-Immuno bio-e-value bio-germlines-unexpected cpp cpp-finesegmenter
- 7
updated Mar 06, 2019
Association de samples à sample sets : documenter, mieux indiquer

#3781 · created Mar 06, 2019 by Mathieu Giraud *-go doc server-sample-sets
- 0
updated Jan 23, 2020
Options courtes -x/-X/-y/-z : supprimer, renommer ?

#3782 · created Mar 07, 2019 by Mathieu Giraud bikeshedding cpp-options
- 1
updated Mar 20, 2019
Une séquence vide peut générer un bad_alloc ?

#3783 · created Mar 07, 2019 by Mathieu Giraud *-too-vague cpp priority-1-low
- 1
updated Mar 07, 2019
Combos ?

#3786 · created Mar 08, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion bikeshedding com-first-time-user cpp-options
- 2
updated Mar 11, 2019
Avoir plus de jeux de données réels complets, montrant différentes situations bio

#3788 · created Mar 10, 2019 by Mathieu Giraud *-go com-first-time-user
- 10
updated Dec 09, 2020
Tester les configs par défaut de modules/vidjil_utils.py

#3790 · created Mar 12, 2019 by Mathieu Giraud *-go com-first-time-user dev-tests server-config
- 0
updated Mar 12, 2019
Tester les configs d'un serveur

#3791 · created Mar 12, 2019 by Mathieu Giraud *-go dev-tests server-config
- 2
updated Mar 15, 2019
Comment modifier le owner d'un sample/patient/run ?

#3794 · created Mar 13, 2019 by Thonier Florian client client-ergonomy server-database
- 2
updated Mar 13, 2019
Les icones du IGH n'apparaissent pas sur ce sample/patient

#3796 · created Mar 14, 2019 by Thonier Florian !!-bug client client-design
- 2
updated Mar 14, 2019
Que se passe-t-il si on supprime une config ?

#3799 · created Mar 14, 2019 by Mikaël Salson !-important !-reflexion doc server-config
- 0
updated Mar 14, 2019
Tutorial : traduire les nouveautés en français

#3801 · created Mar 14, 2019 by Mathieu Giraud com-mail-template doc-tutorial
- 2
updated Dec 04, 2020
Quelques problèmes de CSS - div tronquée/cachée

#3802 · created Mar 15, 2019 by Thonier Florian client client-design client-ergonomy client-less-css client-ugly
- 0
updated Mar 15, 2019
Passer en HTML5

#3803 · created Mar 15, 2019 by Thonier Florian !-reflexion client
- 3
updated Mar 15, 2019
Docker : rendre les sessions persistantes ?

#3804 · created Mar 15, 2019 by Mikaël Salson server server-docker
- 0
updated Nov 22, 2019
Timeout plus long : affiner, allonger encore ?

#3806 · created Mar 15, 2019 by Mathieu Giraud client client-ergonomy
- 2
updated Nov 07, 2019
CloneDB : hover sur warning bleu

#3807 · created Mar 17, 2019 by Mathieu Giraud app-clonedb client
- 0
updated Mar 17, 2019
get reads : sortie moins intrusive

#3809 · created Mar 18, 2019 by Mathieu Giraud client-ergonomy
- 4
updated Mar 21, 2019
Séléction multiple en compare sample sur des clones avec zéro reads

#3813 · created Mar 18, 2019 by Thonier Florian !!-bug client client-grid
- 6
updated Mar 21, 2019
Surligner dans le segmenteur la séquence que l'on a rentrée dans le search.

#3814 · created Mar 18, 2019 by Thonier Florian Amiens-Nordine client client-aligner client-ergonomy feature
- 8
updated Feb 04, 2021
Mauvais alignement entre une séquence et ses séquences germinales

#3815 · created Mar 18, 2019 by Thonier Florian !!-bug client-aligner
- 3
updated Mar 18, 2019
Commande pour filtrer les reads sur la taille, pour les dimers

#3816 · created Mar 18, 2019 by Thonier Florian LIL-Immuno server-pre-process user-request
- 2
updated Mar 18, 2019
Erreur client sur une séquence particulière

#3817 · created Mar 18, 2019 by Mikaël Salson !!-bug Paris-Pitié client client-aligner
- 0
updated Mar 18, 2019
Concaténation de jeux de données, cat

#3818 · created Mar 18, 2019 by Mathieu Giraud *-go com-vw-vidjil-workshop server-pre-process user-request
- 0
updated Mar 18, 2019
Problème à la séléction des locus

#3819 · created Mar 18, 2019 by Thonier Florian !!-bug client client-aligner
- 1
updated Mar 18, 2019
Tooltip sur les clones

#3821 · created Mar 18, 2019 by Mathieu Giraud client-ergonomy client-graph client-grid feature
- 2
updated Oct 31, 2019
CAR-T; permettre de labelliser une séquence dans l'interface

#3822 · created Mar 18, 2019 by Thonier Florian LON-Jack bio-external-data client client-virtual-clone feature patho-CAR-T
- 3
updated Mar 21, 2019
Avoir un petit triangle « from IgBlast » de la même manière que pour IMGT

#3824 · created Mar 18, 2019 by Mikaël Salson client-aligner feature repseq-community
- 0
updated Mar 18, 2019
Heuristique du FineSegmenter : compter plus finement les occurrences

#3825 · created Mar 18, 2019 by Mikaël Salson cpp cpp-filter-fine
- 0
updated Mar 18, 2019
Événements pour un patient : vue dans le client

#3826 · created Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion LON-Jack client user-request
- 1
updated Mar 19, 2019
Avoir une bouton pour lancer une analyse sur tous les samples

#3827 · created Mar 19, 2019 by Thonier Florian Web 2021.11 Paris-Pitié feature server server-ergonomy server-sample-sets
- 1
- 3
updated Apr 08, 2021
Soustraire les clones communs à deux échantillons / comparaison de répertoires

#3828 · created Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud Amiens-Nordine client client-filter server-compare-samples server-fuse user-request
- 2
updated Jul 09, 2020
get support : avoir quelque chose qui ne repose pas forcément sur un mailer

#3829 · created Mar 19, 2019 by Mikaël Salson client client-ergonomy com-mail-template
- 6
updated Mar 20, 2019
Upload puis lancement multiple via .csv

#3832 · created Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud !-hard !-reflexion TOU-Toulouse priority-1-low server server-task.py
- 2
updated Mar 19, 2019
Demander plusieurs alignement successifs fait planter le segmenteur

#3835 · created Mar 19, 2019 by Mikaël Salson !!-bug LIL-Lille client client-aligner
- 6
updated Apr 08, 2021
pouvoir composer les preprocess à la carte

#3836 · created Mar 19, 2019 by Thonier Florian !-reflexion server-pre-process
- 1
updated Jul 28, 2020
Demander confirmation avant la sauvegarde d'analyse en tant qu'admin

#3840 · created Mar 19, 2019 by Thonier Florian !-security #-quality *-go server-admin
- 1
- 1
updated Mar 19, 2019
User interface for entering spikes

#3846 · created Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion bio-mrd bio-spikes client priority-1-low
- 0
updated Jan 19, 2021
Server error au multi-upload

#3849 · created Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud !!-bug com-vw-vidjil-workshop server server-upload
- 1
updated Mar 20, 2019
Pouvoir exporter des clones au format AIRR depuis l'interface

#3850 · created Mar 20, 2019 by Thonier Florian client client-export feature
- 1
updated Feb 25, 2020
Pouvoir montrer quelques stats de répertoires depuis l'interface

#3851 · created Mar 20, 2019 by Thonier Florian bio-diversity client client-ergonomy client-menu feature
- 2
updated Jan 27, 2021
Grep reads et vidjil-algo : le fichier résultant peut mélanger FASTA et FASTQ

#3852 · created Mar 20, 2019 by Mikaël Salson cpp cpp-export repseq-formats
- 6
updated Mar 21, 2019
Comment calculer les informations à stocker pour des données pairées ou single-cell ?

#3853 · created Mar 20, 2019 by Mikaël Salson !-reflexion bio-paired-chains server-fuse
- 0
updated Mar 20, 2019
CLI11 : level() / advanced help et upstream

#3854 · created Mar 21, 2019 by Mathieu Giraud *-go cpp-options
- 0
updated Mar 21, 2019
Comparaison / overlap de répertoires : combien de clones ?

#3855 · created Mar 21, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion LIL-Immuno bio-immuno cpp-filter-fine essen-uk math-stats server-fuse user-request
- 8
updated Apr 08, 2019
Comparaison / overlap de répertoires via le client vidjil

#3857 · created Mar 21, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion Amiens-Nordine LIL-Immuno bio-immuno client client-log-log essen-uk feature user-request
- 3
updated Jul 29, 2020
Boîte search et focus/hide

#3859 · created Mar 21, 2019 by Mathieu Giraud client client-ergonomy client-filter
- 3
updated Oct 24, 2019
Tailles des clones uniquement sur les clones focus ?

#3860 · created Mar 21, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion client-filter
- 0
updated Mar 21, 2019
Analyse FAILED avec un résultat

#3862 · created Mar 22, 2019 by Anne de Septenville !!-bug Paris-Pitié server server-fuse server-task.py
- 6
updated Mar 25, 2019
Pouvoir supprimer la première ligne d'un formulaire de création d'un sample set (patient/run/set)

#3865 · created Mar 22, 2019 by Thonier Florian *-go server server-ergonomy server-sample-sets
- 5
updated Mar 28, 2019
Avoir les noms des patients dans la timeline lorsque l'on ouvre un run

#3868 · created Mar 25, 2019 by Thonier Florian REN-Rennes client client-ergonomy client-graph feature user-request
- 1
updated Jun 19, 2019