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  • Compare samples : mettre en avant les process les plus récents ?
    #4537 · opened Oct 21, 2020 by Mathieu Giraud   priority-1-low server-compare-samples server-qc-stats
    • 0
    updated Oct 21, 2020
  • Devrait-on toujours lancer le fuse quand il y a de très nombreux échantillons ?
    #4538 · opened Oct 21, 2020 by Mathieu Giraud   !-reflexion doc
    • 2
    updated Oct 21, 2020
  • stats-qc : Pouvoir afficher d'un coup tous les échantillons d'un set
    #4539 · opened Oct 21, 2020 by Mathieu Giraud   Web 2021.03   Paris-Pitié feature server-ergonomy server-qc-stats
    • 8
    updated Dec 02, 2020
  • Récupérer les positions FR1/2/3/4 et CDR1/2/3 via IMGT
    #4540 · opened Oct 29, 2020 by Mathieu Giraud   bio-analyze-more client-aligner
    • 0
    updated Oct 29, 2020
  • Tester la partie serveur du tutorial (en ci, ou sur un serveur live)
    #4542 · opened Oct 31, 2020 by Mathieu Giraud   Web 2021.03   doc-tutorial server server-monitor
    • 1
    updated Jan 08, 2021
  • tests tutorial : extraire .tex à partir d'un/plusieurs .rb
    #4543 · opened Oct 31, 2020 by Mathieu Giraud   dev-build doc-tutorial
    • 1
    updated Nov 20, 2020
  • .gitlab-ci.yml : est-ce possible de factoriser les navigateurs ?
    #4544 · opened Oct 31, 2020 by Mathieu Giraud   dev-ci dev-gitlab
    • 0
    updated Oct 31, 2020
  • org-babel-tangle.py et fichiers inclus
    #4545 · opened Oct 31, 2020 by Mathieu Giraud
    • 0
    updated Nov 20, 2020
  • vidjil-algo: Avoir un meilleur suffixe pour l'export des reads des clones
    #4546 · opened Nov 02, 2020 by Mathieu Giraud   *-go LIL-Lille cpp-export priority-1-low
    • 0
    updated Nov 02, 2020
  • Pouvoir modifier par le client des features de séqueces / des recombinaisons particulières
    #4548 · opened Nov 03, 2020 by Mathieu Giraud   bio-analyze-more bio-germlines-unexpected client-aligner feature
    • 0
    updated Nov 03, 2020
  • Nouvelles variables / variables non-existentes dans defs.py
    #4549 · opened Nov 03, 2020 by Mathieu Giraud
    • 4
    updated Nov 13, 2020
  • task.py devrait accéder à un dictionnaire pour les (pre-, post-)process, voire pour les process ?
    #4550 · opened Nov 03, 2020 by Mathieu Giraud   !-reflexion dev-refactor server-pre-process server-task.py
    • 1
    updated Nov 13, 2020
  • Avoir une confirmation utilisateur pour créer/uploader des données sur un serveur non-HDS
    #4551 · opened Nov 03, 2020 by Mathieu Giraud   #-healthcare #-legal server-sample-sets server-upload
    • 0
    updated Dec 04, 2020
  • Computation of MRD value upon clustering
    #4553 · opened Nov 05, 2020 by Joao Meidanis
    • 2
    updated Nov 26, 2020
  • Fuse de fichier avec des windows mix de 50 et 60 nt
    #4554 · opened Nov 06, 2020 by Thonier Florian   !!-bug feature server-fuse
    • 3
    updated Nov 06, 2020
  • Fenêtre info ne s'ouvre pas sur d'anciens samples (avec un custom)
    #4555 · opened Nov 06, 2020 by Mikaël Salson   !!-bug *-go client client-info priority-3-month
    • 0
    updated Nov 06, 2020
  • Avoir un warning spécifique si un clone a plusieurs dénominatio npossible lors d'un fuse
    #4556 · opened Nov 06, 2020 by Thonier Florian   client feature
    • 0
    updated Nov 06, 2020
  • Avoir un champ type "created/uploaded_time" pour les sets, les samples ?
    #4557 · opened Nov 06, 2020 by Mathieu Giraud   !-reflexion feature server-admin server-database
    • 0
    updated Nov 23, 2020
  • Avoir un meilleur retour utilisateur quand il y a une requête "bloquante" à la db
    #4558 · opened Nov 06, 2020 by Mathieu Giraud   client-database server-ergonomy
    • 1
    updated Dec 11, 2020
  • Simplifier voir limiter/interdire la requête SampleSet pour les admins ?
    #4559 · opened Nov 10, 2020 by Mathieu Giraud   priority-1-low server-admin server-speed
    • 1
    updated Nov 10, 2020
  • Avoir le nom de l'échantillon lors de l'envoi d'un clone vers un service tiers
    #4561 · opened Nov 17, 2020 by Thonier Florian   !-reflexion LYON-Sarah bio-analyze-more bio-external-data feature
    • 0
    updated Nov 17, 2020
  • Ouvrir "My Account" lorsqu'on clique sur son nom
    #4563 · opened Nov 19, 2020 by Mathieu Giraud   !-easy *-go client-database server-auth server-my-account
    • 0
    updated Dec 10, 2020
  • pourvoir faire une recherche sur les runs/individus par le numero de set
    #4565 · opened Nov 20, 2020 by Thonier Florian   *-go feature server server-database server-ergonomy
    • 3
    updated Nov 20, 2020
  • Stocker 'color_by' dans les préférences
    #4568 · opened Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   !-easy *-go Paris-Pitié client-color-by
    • 1
    updated Jan 06, 2021
  • Pouvoir associer d'un coup plusieurs samples à un set / créer un nouveau set avec des samples existants
    #4569 · opened Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié server-sample-sets user-request
    • 1
    updated Dec 11, 2020
  • Documenter comment travailler sur un format .vidjil
    #4570 · opened Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   !-easy *-go Paris-Pitié doc repseq-formats
    • 0
    updated Nov 20, 2020
  • API / URL serveur : arriver sur une page d'un set
    #4571 · opened Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié server-api server-sample-sets
    • 0
    updated Nov 20, 2020
  • Pouvoir cliquer avec le bouton droit sur des liens sample sets
    #4572 · opened Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié client-ergonomy server-sample-sets
    • 1
    updated Nov 20, 2020
  • Page principale du serveur : trier les sets par ordre de mise à jour ?
    #4573 · opened Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié bio-mrd client-database client-ergonomy
    • 5
    updated Dec 04, 2020
  • Déploiement Web 2020.12 🎄   10 of 13 tasks completed
    #4574 · opened Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Web 2020.12
    • 7
    updated Dec 10, 2020
  • Faire un template de release/déploiement web
    #4575 · opened Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Web 2020.12   Dec 11, 2020   dev-policy
    • 1
    • 0
    updated Dec 10, 2020
  • qc-stats : Un même échantillon est présent plusieurs fois
    #4577 · opened Nov 23, 2020 by Mikaël Salson   !!-bug *-go server-qc-stats
    • 0
    updated Nov 23, 2020
  • Comment relancer les fuse sur un serveur
    #4579 · opened Nov 23, 2020 by Thonier Florian   !-reflexion feature server server-api server-fuse
    • 1
    updated Nov 23, 2020
  • Follow-up from "Feature ct/mrd brasil tool and client"   0 of 1 task completed
    #4580 · opened Dec 02, 2020 by Thonier Florian
    • 0
    updated Dec 02, 2020
  • My Account: réécrire certains liens avec les URLs courtes
    #4583 · opened Dec 02, 2020 by Mathieu Giraud   !-easy *-go server-api server-my-account
    • 1
    updated Dec 10, 2020
  • My Account/Usage: inclure les tags des sets ?
    #4584 · opened Dec 02, 2020 by Mathieu Giraud   !-reflexion server-my-account server-sample-sets
    • 0
    updated Dec 10, 2020
  • My Account : corriger le compte des samples et le remettre en prod
    #4585 · opened Dec 02, 2020 by Mathieu Giraud   !!-bug server-my-account server-sample-sets
    • 2
    updated Dec 10, 2020
  • My Account : améliorer la css
    #4586 · opened Dec 02, 2020 by Mathieu Giraud   bikeshedding client-less-css server server-ergonomy server-my-account
    • 2
    updated Dec 03, 2020
  • My Account/Usage : remplacer "Group user_XX" par quelque chose comme "Personal group user_XX"
    #4589 · opened Dec 02, 2020 by Mathieu Giraud   *-go priority-1-low server-ergonomy server-my-account
    • 0
    updated Dec 10, 2020
  • My Account/Usage : enlever le 's' quand il n'y a qu'un seul patient/run/set
    #4590 · opened Dec 02, 2020 by Mathieu Giraud   *-go bikeshedding priority-1-low server-my-account
    • 0
    updated Dec 10, 2020
  • Tests server-fonctionnal peu reproductibles
    #4591 · opened Dec 02, 2020 by Mathieu Giraud   dev-tests-watir
    • 7
    updated Jan 05, 2021
  • Évaluer la reproductibilité des pipelines
    #4592 · opened Dec 02, 2020 by Mathieu Giraud   Feb 9, 2021   dev-gitlab dev-tests
    • 1
    updated Dec 09, 2020
  • My Account /Usage : search box
    #4593 · opened Dec 02, 2020 by Mathieu Giraud   server-admin server-my-account
    • 3
    updated Dec 10, 2020
  • Que devrait contenir une page My Account ?
    #4594 · opened Dec 02, 2020 by Mathieu Giraud   !-reflexion bikeshedding server-my-account
    • 1
    updated Dec 03, 2020
  • processes: un process apparaît autant de fois qu'il est dans un sample set
    #4596 · opened Dec 03, 2020 by Mikaël Salson   *-go server server-ergonomy server-my-account
    • 1
    • 2
    updated Dec 03, 2020
  • Genescan / Biomed-2 sur distributions
    #4597 · opened Dec 04, 2020 by Mathieu Giraud   !-hard
    • 0
    updated Dec 04, 2020
  • getHTMLInfo: afficher la productivité du clone
    #4598 · opened Dec 04, 2020 by Thonier Florian   !-easy client client-ergonomy client-info feature
    • 1
    • 1
    updated Dec 04, 2020
  • Réflexion sur l'ensemble du client, page blanche, nouvelles vues
    #4600 · opened Dec 04, 2020 by Mathieu Giraud   Mar 4, 2021   !-reflexion +-roadmap client-ergonomy client-views
    • 0
    updated Dec 04, 2020
  • task.py et ailleurs: Utiliser des constantes pour les status des process
    #4602 · opened Dec 08, 2020 by Mathieu Giraud   !-easy *-go dev-robust server-task.py
    • 0
    updated Dec 08, 2020
  • Propriétaires vus dans le volume `results` sur Docker
    #4603 · opened Dec 09, 2020 by Mathieu Giraud   BRU-Bruxelles server-docker
    • 3
    updated Jan 06, 2021
  • Test germline de dev : les remettre dans les schedules en allow_failure ?
    #4604 · opened Dec 09, 2020 by Mathieu Giraud   priority-1-low
    • 1
    updated Dec 09, 2020
  • Scatterplot : les légendes des locus sont sous les icônes
    #4605 · opened Dec 09, 2020 by Mikaël Salson   Web 2021.03   !!-bug *-go client-ergonomy client-grid client-less-css client-ugly
    • 2
    updated Dec 11, 2020
  • IMGt, update paramètres de la requête (V_REGIONsearchIndel, subset)
    #4606 · opened Dec 09, 2020 by Thonier Florian   bio-analyze-more feature repseq-IMGT
    • 1
    • 1
    updated Dec 23, 2020
  • Améliorer la récupération des tests loupés dans les artefacts Watir
    #4607 · opened Dec 09, 2020 by Mathieu Giraud   dev-gitlab dev-tests-watir
    • 0
    updated Dec 09, 2020
  • My Account/Usage : pouvoir accéder aux sets
    #4608 · opened Dec 10, 2020 by Mathieu Giraud   server-ergonomy server-my-account server-sample-sets
    • 0
    updated Dec 10, 2020
  • MyAccount / Usage pour admin
    #4610 · opened Dec 10, 2020 by Mathieu Giraud   priority-1-low server-admin server-my-account
    • 0
    updated Dec 10, 2020
  • Implement --post for fuse
    #4612 · opened Dec 11, 2020 by Mathieu Giraud   !-reflexion server-fuse server-pre-process
    • 0
    updated Dec 11, 2020
  • API Server: pouvoir spécifier l'id de l'analyse
    #4613 · opened Dec 11, 2020 by Mathieu Giraud   *-go server-api
    • 0
    updated Dec 11, 2020
  • Comparer automatiquement les résultats sur certains fichiers récents ?
    #4614 · opened Dec 11, 2020 by Mikaël Salson   #-quality cpp server
    • 1
    updated Dec 18, 2020
  • tools/diff.py : différence entre deux .vidjil
    #4616 · opened Dec 18, 2020 by Mathieu Giraud
    • 0
    updated Dec 18, 2020
  • Message d'alerte : revoir la CSS
    #4617 · opened Dec 18, 2020 by Mikaël Salson   Jan 15, 2021   !-important #-crisis-prevention *-go client-less-css next-audio priority-3-month
    • 4
    updated Jan 08, 2021
  • Configuration apparaissant plusieurs fois dans les résultats
    #4618 · opened Dec 19, 2020 by Thonier Florian   !!-bug server server-sample-sets
    • 1
    updated Dec 19, 2020
  • Sous-espèces et germlines (quasi-)dupliquées
    #4620 · opened Dec 23, 2020 by Mathieu Giraud   !-reflexion bio-germlines bio-germlines-isotypes bio-species
    • 5
    updated Jan 12, 2021
  • Productivité et codon start et autres éléments
    #4621 · opened Dec 31, 2020 by Mathieu Giraud   !-reflexion bio-AA bio-CLL repseq-IMGT
    • 2
    updated Jan 05, 2021
  • Mettre à jour d3js pour v6 ?
    #4622 · opened Jan 04, 2021 by Mathieu Giraud   client
    • 0
    updated Jan 04, 2021
  • Enlever lessc de js/lib/info.txt ?
    #4623 · opened Jan 04, 2021 by Mathieu Giraud   client-less-css doc priority-1-low server-docker
    • 0
    updated Jan 04, 2021
  • Séquences avec du V-INTRON ou avant
    #4624 · opened Jan 05, 2021 by Mathieu Giraud   bio-analyze-more bio-germlines priority-1-low
    • 0
    updated Jan 05, 2021
  • Notifications : utiliser com.js (refactorer com.js ?)
    #4626 · opened Jan 08, 2021 by Mathieu Giraud   client-notifications dev-refactor
    • 0
    updated Jan 08, 2021
  • alert : utiliser com.js (et refactorer com.js)
    #4627 · opened Jan 08, 2021 by Mathieu Giraud   #-crisis-prevention client-notifications dev-refactor
    • 0
    updated Jan 08, 2021
  • Avoir un test intégration : upload + lancement run + vérification clone majoritaire
    #4628 · opened Jan 08, 2021 by Mathieu Giraud   dev-tests-watir
    • 2
    updated Jan 08, 2021
  • C++20 ?
    #4630 · opened Jan 11, 2021 by Mathieu Giraud   !-reflexion cpp cpp-compiler dev-policy
    • 0
    updated Jan 11, 2021
  • Follow-up from "Resolve "Avoir les données germline du cochon (Sus Scrofa)""   0 of 1 task completed
    #4631 · opened Jan 12, 2021 by Thonier Florian   bio-germlines bio-germlines-isotypes doc
    • 0
    updated Jan 12, 2021
  • Analyse avec MiXCR ne fonctionne pas avec les distributions
    #4632 · opened Jan 12, 2021 by Thonier Florian   !!-bug client-virtual-clone
    • 1
    • 8
    updated Jan 15, 2021
  • Connaître le nom des fichiers uploadés, avant le pre-process
    #4633 · opened Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud   REN-Rennes server-pre-process server-task.py server-upload user-request
    • 6
    updated Jan 13, 2021
  • Doc dev et/ou code : documenter le schéma de la db
    #4634 · opened Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud   dev-policy doc server-database
    • 0
    updated Jan 13, 2021
  • Retirer la vue non-anonymisée dans le mode impersonate
    #4635 · opened Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud   #-ethics server-admin
    • 0
    updated Jan 13, 2021
  • Console : remonter plus d'infos, erreurs et succès
    #4636 · opened Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud   client-notifications
    • 0
    updated Jan 13, 2021
  • Donner accès à l'utilisateur à la console ?
    #4637 · opened Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud   client-notifications
    • 0
    updated Jan 13, 2021
  • Console : doc dev
    #4638 · opened Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud   client-notifications doc
    • 0
    updated Jan 13, 2021
  • Pseudogènes IMGT non assignés à des sous-groupes
    #4639 · opened Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud   bio-germlines
    • 0
    updated Jan 13, 2021
  • Nouveau TRGJ1*02
    #4640 · opened Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud   bio-germlines repseq-IMGT
    • 0
    updated Jan 14, 2021
  • vidjil-algo: analyser stdin
    #4642 · opened Jan 14, 2021 by Mathieu Giraud   Algo 2021.01   cpp cpp-options
    • 1
    • 6
    updated Jan 15, 2021
  • vidjil-algo: option pour afficher l'alignement avec les germlines type vdj_align
    #4643 · opened Jan 14, 2021 by Mathieu Giraud   Algo 2021.01   cpp cpp-options priority-1-low
    • 1
    • 0
    updated Jan 14, 2021
  • Vidjil-algo dans le navigateur
    #4644 · opened Jan 14, 2021 by Mikaël Salson   client cpp
    • 1
    • 0
    updated Jan 14, 2021
  • Afficher un vrai alignement avec --show-junction
    #4645 · opened Jan 14, 2021 by Mathieu Giraud   cpp-dynprog cpp-export
    • 0
    updated Jan 14, 2021
  • --show-junction : afficher les aligments avec 3-5 gènes V/J les plus proches, et pas seulement le premeir
    #4646 · opened Jan 14, 2021 by Mathieu Giraud   cpp-dynprog cpp-export
    • 0
    updated Jan 14, 2021
  • Nouvelles germlines ne détectent pas IGHD7-27/J1, upstream plus grand
    #4647 · opened Jan 15, 2021 by Mathieu Giraud   !!-bug bio-germlines next-audio
    • 0
    updated Jan 15, 2021
  • mulitple-test et json.decoder.JSONDecodeError
    #4649 · opened Jan 15, 2021 by Mathieu Giraud   !!-broken-ci dev-tests-should-get
    • 2
    updated Jan 15, 2021
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