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  • Open 90
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New issue
  • Priority Created date Last updated Milestone due date Due date Popularity Label priority Manual
  • Segmenter : ordre des germlines/séquences
    #2491 · opened May 23, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Lille client client-aligner user-request
    • 1
    updated Aug 30, 2017
  • Lignes des axes noires/grises
    #2499 · opened May 25, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Lille client client-grid client-ugly user-request
    • 11
    updated Aug 09, 2018
  • Vh pas trouvé, uniquement Dh-Jh
    #2508 · opened Jun 01, 2017 by Mathieu Giraud   Algo -- Important   !!-bug LIL-Lille bio-e-value cpp cpp-heuristic user-request
    • 3
    updated Jun 27, 2018
  • Discordance de productivité
    #2526 · opened Jun 09, 2017 by Mathieu Giraud   Lille-LAL-next   BRU-Bruxelles LIL-Lille bio-AA bio-CLL cpp user-request
    • 1
    • 34
    updated Jan 19, 2021
  • Configuration trop stringeante sur la recherche du D
    #2002 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !!-bug LIL-Lille PAN-Necker bio-e-value cpp-costs cpp-finesegmenter cpp-finesegmenter-D priority-3-month user-request
    • 7
    updated Oct 14, 2020
  • Remettre l'amorce par patient dans le client
    #2558 · opened Jul 13, 2017 by Mathieu Giraud   *-too-vague LIL-Lille bio-primers user-request
    • 0
    updated Jul 13, 2017
  • Ajouter un clone et relance de fuse
    #2602 · opened Aug 30, 2017 by Mathieu Giraud   !-hard !-reflexion LIL-Lille client-virtual-clone server-fuse user-request
    • 0
    updated Aug 30, 2017
  • Ajouter plusieurs clones virtuels d'un coup
    #2604 · opened Aug 30, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Lille client client-virtual-clone user-request
    • 0
    updated Sep 08, 2017
  • Germlines de chien
    #2650 · opened Sep 19, 2017 by Mathieu Giraud   bio-germlines bio-species user-request
    • 0
    updated Nov 29, 2017
  • IgBlast : pas la même chose en direct ?
    #2660 · opened Sep 22, 2017 by Mathieu Giraud   TOU-Toulouse client client-export user-request
    • 0
    updated Jan 10, 2019
  • Pre-process: mettre avant le log la correspondance entre noms serveurs et noms des fichiers dans le log
    #2725 · opened Oct 13, 2017 by Ryan Herbert   #-privacy *-go Paris-Pitié server-pre-process user-request
    • 7
    updated Oct 17, 2017
  • Passer avec la souris sur les séquences du segmenteur supprime la vue des mutations
    #2743 · opened Oct 20, 2017 by Mathieu Giraud   !!-bug LIL-Lille client client-aligner user-request
    • 3
    updated Mar 19, 2019
  • SEG_METHOD_ONE : séquences non recombinées, usages
    #1724 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   Algo -- Important   !-reflexion bio-analyze-more cpp cpp-dynprog cpp-finesegmenter cpp-heuristic dev-policy priority-2 user-request
    • 4
    updated Aug 21, 2020
  • Pouvoir effectuer des analyses de translocations sur des séquences arbitraires
    #2818 · opened Nov 21, 2017 by Ryan Herbert   PAR-Debré bio-analyze-more bio-germlines com-vw-vidjil-workshop user-request
    • 4
    updated Apr 03, 2019
  • Export : donner les informations d'IMGT dans le rapport ?
    #2819 · opened Nov 21, 2017 by Mikaël Salson   LIL-Lille client client-export client-rapport com-vw-vidjil-workshop feature repseq-IMGT user-request
    • 1
    updated Apr 05, 2018
  • Détecter les primers dimers
    #2820 · opened Nov 21, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Immuno PAR-Debré Paris-Pitié bio-control bio-primers client-warning cpp cpp-heuristic user-request
    • 1
    • 9
    updated Jun 18, 2020
  • Faire une médiane sur une normalisation multiple
    #2830 · opened Nov 21, 2017 by Ryan Herbert   BRU-Bruxelles MON-Monza client-normalization ec-ngs math-stats user-request
    • 3
    updated Dec 28, 2018
  • Profils pour divers maladies/usages / Presets for different pathologies/uses
    #2836 · opened Nov 21, 2017 by Thonier Florian   !-reflexion BRU-Bruxelles LIL-Lille TOU-Toulouse client client-menu com-vw-vidjil-workshop user-request
    • 7
    updated Dec 04, 2020
  • Différencier les réarrangements incomplets et pseudo-incomplets
    #2853 · opened Nov 22, 2017 by Mikaël Salson   !-reflexion NAG-Nagoya bio-capture bio-e-value cpp cpp-finesegmenter feature user-request
    • 3
    updated Dec 12, 2018
  • Qualité de chaque échantillon dans un run, contrôles (vue spécifique)
    #2875 · opened Nov 22, 2017 by Mikaël Salson   LIL-Lille Paris-Pitié bio-control client-warning server-pre-process server-qc-stats server-sample-sets user-request
    • 12
    updated Sep 14, 2018
  • Upload de plusieurs fichiers .fasta via un .zip / .csv
    #2891 · opened Nov 23, 2017 by Mathieu Giraud   !-hard !-reflexion KIE-Kiel PAR-Debré Paris-Pitié TOU-Toulouse server-database server-upload user-request
    • 7
    updated Jan 12, 2021
  • Lier à VDJdb
    #1880 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   bio-immuno com-vw-vidjil-workshop essen-uk feature repseq-Shugay repseq-platform user-request
    • 15
    updated Sep 10, 2020
  • Évolution clonale : changement de V (V switch), similarité VDJ-aware
    #1726 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   BRU-Bruxelles Boldrini-Brasil LIL-Lille PAR-Debré bio-analyze-more feature server-fuse user-request
    • 7
    updated Apr 18, 2019
  • Comment creer un groupe de fusion pour faire des partages ou réunion
    #3081 · opened Mar 12, 2018 by Thonier Florian   !-reflexion LIM-Limoges client feature server server-admin server-database user-request
    • 1
    updated Mar 15, 2018
  • Rapport : date de naissance + autres infos du patient (run/set) ?
    #3126 · opened Apr 05, 2018 by Mathieu Giraud   Lille-LAL-next   !-easy *-go LIL-Lille client-rapport user-request
    • 6
    updated Jan 26, 2021
  • Point caché (dans l'épingle) qui apparaît malgré tout dans le graphique
    #3128 · opened Apr 05, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug LIL-Lille client-ergonomy client-graph user-request
    • 0
    updated Apr 05, 2018
  • Informations pour la LLC dans le rapport
    #3130 · opened Apr 05, 2018 by Mikaël Salson   !-reflexion client-export client-rapport patho-LLC user-request
    • 2
    updated Aug 05, 2020
  • Renommer des infos / tags et/ou opérations de maintenance
    #3132 · opened Apr 05, 2018 by Mathieu Giraud   support-policy user-request
    • 0
    updated Apr 05, 2018
  • Plot submenu: une icône .svg disparaît après utilisation
    #3156 · opened Apr 09, 2018 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié client-ugly user-request
    • 2
    updated Aug 09, 2018
  • N'afficher que les nucléotides qui diffèrent quand on aligne les séquences
    #3164 · opened Apr 11, 2018 by Mikaël Salson   Paris-Pitié client-aligner client-ergonomy server-cgi user-request
    • 0
    updated Oct 14, 2020
  • Utilisation des séquences "cibles"
    #3216 · opened May 11, 2018 by Thonier Florian   !-reflexion PAN-Necker app-clonedb client cpp data feature user-request
    • 1
    updated May 11, 2018
  • Une donnée non exportable est... inutile
    #3241 · opened May 31, 2018 by Mathieu Giraud   Jun 30, 2018   !-important client client-export client-rapport user-request
    • 1
    updated Aug 04, 2020
  • Export des informations d'un clone
    #3243 · opened May 31, 2018 by Mikaël Salson   LIL-Lille client client-cloneList client-export user-request
    • 1
    • 7
    updated Jan 16, 2020
  • Coefficient de corrélation (ou autre mesure) lors d'un compare two samples
    #3244 · opened May 31, 2018 by Mikaël Salson   !-important LIL-Immuno bio-diversity client client-grid user-request
    • 1
    updated Jun 04, 2018
  • Ne regarder que certains échantillons d'un même patient
    #3245 · opened May 31, 2018 by Mikaël Salson   LIL-Immuno client client-ergonomy server-compare-samples user-request
    • 0
    updated May 31, 2018
  • Stéréotypie CDR3 à un subset connu
    #3334 · opened Jul 05, 2018 by Mathieu Giraud   CLL-2018-septembre   !-important LIL-Lille bio-AA bio-CLL client-warning feature user-request
    • 8
    updated Sep 25, 2019
  • serveur delocalisé; problème à l'installation; job coincés en queue
    #3445 · opened Aug 31, 2018 by Thonier Florian   doc repseq-community server server-admin user-request
    • 2
    updated Aug 31, 2018
  • Export CSV de stats / qualité
    #3539 · opened Oct 09, 2018 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié server-qc-stats user-request
    • 0
    updated Oct 09, 2018
  • Pouvoir supprimer les primers des séquences
    #3714 · opened Feb 08, 2019 by Thonier Florian   LIL-Lille REN-Rennes bio-CLL bio-primers client client-filter feature next-audio user-request
    • 8
    updated Jan 15, 2021
  • CloneDB : afficher les tags
    #3716 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson   +-deploy LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
    • 1
    • 2
    updated Dec 03, 2019
  • CloneDB : les sample sets peuvent être redondants
    #3717 · opened Feb 11, 2019 by Mikaël Salson   LIL-Lille app-clonedb client client-info user-request
    • 1
    updated Feb 11, 2019
  • Add germlines genes pour tous
    #3731 · opened Feb 13, 2019 by Mathieu Giraud   CLL-2018-septembre   client-aligner com-vw-vidjil-workshop user-request
    • 2
    updated Oct 14, 2020
  • Commande pour filtrer les reads sur la taille, pour les dimers
    #3816 · opened Mar 18, 2019 by Thonier Florian   LIL-Immuno server-pre-process user-request
    • 2
    updated Mar 18, 2019
  • Concaténation de jeux de données, cat
    #3818 · opened Mar 18, 2019 by Mathieu Giraud   *-go com-vw-vidjil-workshop server-pre-process user-request
    • 0
    updated Mar 18, 2019
  • Événements pour un patient : vue dans le client
    #3826 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud   !-reflexion LON-Jack client user-request
    • 1
    updated Mar 19, 2019
  • Soustraire les clones communs à deux échantillons / comparaison de répertoires
    #3828 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud   Amiens-Nordine client client-filter server-compare-samples server-fuse user-request
    • 2
    updated Jul 09, 2020
  • Comparaison / overlap de répertoires : combien de clones ?
    #3855 · opened Mar 21, 2019 by Mathieu Giraud   !-reflexion LIL-Immuno bio-immuno cpp-filter-fine essen-uk math-stats server-fuse user-request
    • 8
    updated Apr 08, 2019
  • Comparaison / overlap de répertoires via le client vidjil
    #3857 · opened Mar 21, 2019 by Mathieu Giraud   !-reflexion Amiens-Nordine LIL-Immuno bio-immuno client client-log-log essen-uk feature user-request
    • 3
    updated Jul 29, 2020
  • Avoir les noms des patients dans la timeline lorsque l'on ouvre un run
    #3868 · opened Mar 25, 2019 by Thonier Florian   REN-Rennes client client-ergonomy client-graph feature user-request
    • 1
    updated Jun 19, 2019
  • Actualiser régulièrement la CloneDB
    #3889 · opened Apr 02, 2019 by Anne de Septenville   Paris-Pitié app-clonedb user-request
    • 6
    updated Dec 13, 2019
  • Compare samples : trier par ordre chronologique
    #3935 · opened Jun 20, 2019 by Mikaël Salson   LIL-Lille client-ergonomy server-compare-samples user-request
    • 0
    updated Jun 20, 2019
  • Rapports monitor : que sont les graphs « normalization » ?
    #3936 · opened Jun 20, 2019 by Mikaël Salson   !!-bug *-go LIL-Lille client client-normalization client-rapport user-request
    • 0
    updated Jun 20, 2019
  • Rapport monitor : mettre les informations de chaque sample
    #3937 · opened Jun 20, 2019 by Mikaël Salson   LIL-Lille bio-mrd client-rapport feature user-request
    • 1
    updated Jun 21, 2019
  • Running MiXCR through Vidjil
    #3964 · opened Aug 05, 2019 by Mathieu Giraud   Dec 20, 2019   Boldrini-Brasil doc repseq-mixcr repseq-platform user-request
    • 8
    updated Sep 28, 2020
  • Savoir quelle est la charge du serveur
    #4037 · opened Nov 06, 2019 by Mathieu Giraud   server-monitor server-speed user-request
    • 6
    updated Sep 23, 2020
  • Afficher les index de diversité dans le client
    #4038 · opened Nov 06, 2019 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié bio-diversity client-graph math-stats user-request
    • 5
    updated Nov 27, 2019
  • Add germline gene : problème lorsqu'on change de clone
    #4062 · opened Nov 22, 2019 by Mikaël Salson   Lille-LAL-next   !!-bug *-go LIL-Lille client client-aligner server-cgi user-request
    • 1
    updated Oct 14, 2020
  • Couleur par nombre de samples
    #4066 · opened Nov 26, 2019 by Mikaël Salson   Paris-Pitié bio-control client client-axis client-color-by client-ergonomy user-request
    • 1
    updated Dec 10, 2019
  • Afficher les index de diversité en statistiques patient/run/set
    #4069 · opened Nov 27, 2019 by Mathieu Giraud   bio-diversity math-stats server-qc-stats user-request
    • 0
    updated Nov 27, 2019
  • Vue des utilisateurs ayant accès à mes données
    #4115 · opened Jan 09, 2020 by Mathieu Giraud   LIL-Lille server-auth user-request user-traceability
    • 1
    updated Nov 18, 2020
  • Avoir plus d'information sur des UNSEG V : quel V ?
    #4137 · opened Jan 17, 2020 by Mathieu Giraud   CRE-Créteil bio-capture cpp user-request
    • 0
    updated Jan 17, 2020
  • segmenter broken apres le chargement d'un second fichier
    #4144 · opened Jan 21, 2020 by marc duez   !!-bug PAN-Necker client client-aligner user-request
    • 1
    updated Oct 14, 2020
  • Ajout d'un même set/run sur plusieurs samples déjà importés
    #4169 · opened Jan 31, 2020 by Anne de Septenville   Paris-Pitié server-ergonomy server-sample-sets user-request
    • 0
    updated Feb 03, 2020
  • Points décalés dans le rapport
    #4182 · opened Feb 13, 2020 by Mathieu Giraud   !!-bug LIL-Lille client-graph client-rapport user-request
    • 7
    updated Feb 26, 2020
  • Avoir l'information in frame/out of frame depuis l'algo
    #4214 · opened Mar 11, 2020 by Thonier Florian   +-deploy PAN-Necker bio-analyze-more bio-productivity cpp cpp-finesegmenter feature user-request
    • 3
    updated Jan 19, 2021
  • Documenter les distributions + export all clones
    #4237 · opened Apr 07, 2020 by Mathieu Giraud   Déploiement 2020.06   Jun 28, 2020   *-go LIL-Lille doc user-request
    • 7
    updated Jul 09, 2020
  • Problème détection d'un 2e D trop court
    #4267 · opened Apr 28, 2020 by Anne de Septenville   Paris-Pitié bio-e-value cpp cpp-finesegmenter-D user-request
    • 10
    updated Jun 23, 2020
  • Erreur productivité - séquence commençant loin avant le début du V
    #4292 · opened May 18, 2020 by Anne de Septenville   Paris-Pitié bio-productivity cpp cpp-finesegmenter user-request
    • 5
    updated May 28, 2020
  • vidjil-algo: Improve documentation on clustering
    #4300 · opened May 26, 2020 by Mathieu Giraud   cpp-cluster doc user-request
    • 0
    updated May 26, 2020
  • Les utilisateurs ne peuvent pas supprimer un set
    #4305 · opened May 26, 2020 by Thonier Florian   Web 2021.03   !!-annoying !!-bug LIL-Lille client priority-3-month server server-sample-sets user-request
    • 13
    updated Dec 11, 2020
  • Représenter différement et/ou pouvoir masquer les clones peu sûrs dans le graphe
    #4451 · opened Aug 04, 2020 by Mathieu Giraud   LIL-Immuno client-graph user-request
    • 0
    updated Aug 04, 2020
  • Affichage de samples en double dans un run/set
    #4461 · opened Aug 24, 2020 by Anne de Septenville   server-sample-sets user-request
    • 1
    updated Dec 10, 2020
  • Nom des fichiers mergés et ressenti du succès du pre-process
    #4493 · opened Sep 28, 2020 by Mathieu Giraud   com-vw-vidjil-workshop doc server-pre-process user-request
    • 8
    updated Sep 30, 2020
  • Avoir un preset locus/size
    #4496 · opened Sep 29, 2020 by Mikaël Salson   !-easy APHP client client-graph feature user-request
    • 0
    updated Sep 29, 2020
  • Dans la table groupe, afficher une colonne `group_id`
    #4508 · opened Oct 06, 2020 by Mathieu Giraud   !-easy *-go BRU-Bruxelles user-request
    • 0
    updated Jan 04, 2021
  • Se souvenir des amorces/primers utilisées : comment ?
    #1253 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-hard !-reflexion #-aap-ADT-Inria #-quality LIL-Lille Paris-Pitié REN-Rennes bio-primers client-database feature next-audio priority-2 server-database server-qc-stats user-request
    • 7
    updated Jan 22, 2021
  • Événements pour un patient : utilité, modèle
    #1361 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-reflexion LON-Jack bio-control client feature priority-2 user-request
    • 4
    updated Mar 19, 2019
  • Afficher les 3 ou 5 meilleurs V/D/J dans les infos de chaque clone
    #1408 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   client client-aligner cpp cpp-dynprog cpp-export cpp-finesegmenter priority-2 user-request
    • 3
    updated Oct 14, 2020
  • Mettre plus de tags (couleurs) sur les clones
    #1547 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-reflexion LIL-Immuno REN-Rennes client client-color-by client-custom client-design client-ergonomy client-filter client-ugly priority-2 user-request
    • 3
    updated Dec 10, 2019
  • Jeu de couleurs visibles par tous (ou presque)
    #1739 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-reflexion client-accessibility client-design client-ergonomy priority-2 user-request
    • 4
    updated Nov 07, 2019
  • Contrôle de la contamination sur un run
    #1744 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   LIL-Lille MON-Monza PAN-Necker Paris-Pitié bio-control client feature priority-3-month server-qc-stats user-request
    • 22
    updated Dec 11, 2020
  • Upload fichier : lorsqu'on rentre un fichier de même nom, peu clair
    #1896 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   server-database user-request
    • 1
    updated Jan 18, 2019
  • Cluster par courbes ayant même dynamique temporelle
    #1943 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   LIL-Immuno client client-cluster client-graph feature user-request
    • 8
    updated Jul 09, 2020
  • Plusieurs J à la suite : prendre le premier J
    #1971 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   PAR-Debré cpp cpp-costs cpp-finesegmenter dev-tests-should-get user-request
    • 4
    updated Feb 23, 2018
  • Couleurs dans le rapport exporté : conserver le color_by()
    #1976 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team   Lille-LAL-next   !!-annoying LIL-Lille client-color-by client-ergonomy client-rapport priority-3-month user-request
    • 2
    • 12
    updated Jan 06, 2021
  • Avoir un rapport plus générique
    #2233 · opened Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud   !-important LIL-Lille PAR-Debré Paris-Pitié bio-control client client-rapport user-request
    • 8
    updated Dec 11, 2020
  • Afficher un échantillon sans l'impact des autres échantillons
    #2442 · opened May 15, 2017 by Mathieu Giraud   !-reflexion Amiens-Nordine LIL-Lille Paris-Pitié bio-control client server-fuse user-request
    • 21
    updated Dec 11, 2020
  • Customisation du client pour certains utilisateurs ou groupes
    #2444 · opened May 15, 2017 by Mathieu Giraud   !-reflexion #-vodooj Boldrini-Brasil client client-axis dev-packaging dev-policy server-auth server-groups user-request
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    updated Mar 23, 2020
  • Pouvoir associer d'un coup plusieurs samples à un set / créer un nouveau set avec des samples existants
    #4569 · opened Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié server-sample-sets user-request
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    updated Dec 11, 2020
  • Connaître le nom des fichiers uploadés, avant le pre-process
    #4633 · opened Jan 13, 2021 by Mathieu Giraud   REN-Rennes server-pre-process server-task.py server-upload user-request
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    updated Jan 13, 2021