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Mise à jour terminée. Pour connaître les apports de la version 13.10.3 par rapport à notre ancienne version vous pouvez lire les "Release Notes" suivantes :
https://about.gitlab.com/releases/2021/03/22/gitlab-13-10-released/
https://about.gitlab.com/releases/2021/03/31/security-release-gitlab-13-10-1-released/
https://about.gitlab.com/releases/2021/04/01/gitlab-13-10-2-released/
https://about.gitlab.com/releases/2021/04/14/security-release-gitlab-13-10-3-released/

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  • Issues

  • Open 201
  • Closed 242
  • All 443
New issue
  • Priority Created date Last updated Milestone due date Due date Popularity Label priority Manual
  • sample_set.delete() ne devrait généralement pas supprimer les samples et les résultats
    #2591 · created Aug 25, 2017 by Mathieu Giraud   !-important !-security *-go server
    • CLOSED
    • 1
    • 6
    updated Mar 30, 2021
  • Mettre à disposition les reads segmentés
    #1671 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   Web 2017.05   *-go +-deploy client client-export feature priority-3-month server server-config
    • CLOSED
    • 6
    updated May 23, 2017
  • Ne pas lancer fuse quand le nombre de samples est trop important ?
    #2011 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   Web 2017.05   !-reflexion +-deploy KIE-Kiel LIL-Lille priority-3-month server server-fuse server-sample-sets server-speed
    • CLOSED
    • 16
    updated May 22, 2017
  • Interdire la suppression d'une config qui a servi
    #2302 · created Mar 31, 2017 by Mikaël Salson   +-merge dev-robust server server-database
    • CLOSED
    • 1
    • 8
    updated Jul 12, 2017
  • Avoir un retour à l'utilisateur lorsqu'on choisit un fichier "network"
    #2522 · created Jun 09, 2017 by Mathieu Giraud   prod-server-lil   +-merge LIL-Lille server server-mounted-files user-request
    • CLOSED
    • 1
    • 1
    updated Jul 12, 2017
  • Téléchargement des fichiers produits par les logiciels : le lien arrive trop tôt
    #2481 · created May 22, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug client-export server
    • CLOSED
    • 0
    updated Jul 05, 2017
  • Fichiers "network": 404 avec le lien "dl" dans sample_set/index.html
    #2524 · created Jun 09, 2017 by Mathieu Giraud   prod-server-lil   LIL-Lille server server-mounted-files user-request
    • CLOSED
    • 1
    updated Jul 05, 2017
  • Fichiers "network": affichage de leur taille et de leur état dans sample_set/index.html
    #2523 · created Jun 09, 2017 by Mathieu Giraud   prod-server-lil   LIL-Lille server server-mounted-files user-request
    • CLOSED
    • 4
    updated Mar 06, 2018
  • La suppression des résultats et fichier de séquence provoque une erreur serveur
    #2478 · created May 22, 2017 by Mikaël Salson   Web 2017.05   !!-bug +-merge server
    • CLOSED
    • 1
    • 2
    updated May 23, 2017
  • Rechercher dans les runs, recherche dans les patients
    #2216 · created Mar 02, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug +-working server
    • CLOSED
    • 2
    updated Nov 22, 2017
  • SampleSets: SET_TYPE_SEQUENCE_FILE
    #2284 · created Mar 22, 2017 by Mathieu Giraud   +-deploy dev-dead-code server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 5
    updated Jun 08, 2017
  • Incident 2017-04-04: Tous les jobs sont en FAILED
    #2321 · created Apr 04, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug !!-crisis server
    • CLOSED (MOVED)
    • 1
    updated May 22, 2017
  • Serveur anormalement lent
    #2086 · created Dec 29, 2016 by Thonier Florian   !!-bug !!-crisis priority-5-today server server-hosting server-speed
    • CLOSED (MOVED)
    • 1
    updated May 22, 2017
  • Le compare samples ne fonctionne pas avec les sets
    #2466 · created May 16, 2017 by Ryan Herbert   Web 2017.05   !!-bug +-merge priority-5-today server server-compare-samples
    • CLOSED
    • 1
    • 0
    updated May 22, 2017
  • Compare samples sans association des samples à un patient
    #2406 · created May 05, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug +-working server server-compare-samples
    • CLOSED
    • 0
    updated May 22, 2017
  • La page de modification d'un utilisateur n'existe plus
    #2381 · created Apr 18, 2017 by Mikaël Salson   Web 2017.05   !!-bug +-deploy server server-auth
    • CLOSED
    • 1
    updated May 22, 2017
  • Les groupes vides ne s'affichent pas dans la liste des groupes
    #2371 · created Apr 13, 2017 by Ryan Herbert   Web 2017.05   !!-bug +-deploy server
    • CLOSED
    • 1
    updated May 22, 2017
  • Pas d'accès aux permissions d'un sample set/patient
    #2350 · created Apr 10, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug *-go server server-auth
    • CLOSED
    • 1
    updated May 22, 2017
  • Le status du pre-process n'est pas retiré après avoir désélectionné le pre-process en éditant le sample.
    #2343 · created Apr 06, 2017 by Ryan Herbert   !!-bug server
    • CLOSED
    • 0
    updated May 22, 2017
  • La suppression d'un sample set ramène sur une « None » list
    #2325 · created Apr 04, 2017 by Mikaël Salson   Web 2017.05   !!-bug +-deploy server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 2
    updated May 22, 2017
  • Le contrôleur run redirige sur l'ancien contrôleur run/index
    #2293 · created Mar 24, 2017 by Ryan Herbert   !!-bug dev-refactor server
    • CLOSED
    • 0
    updated May 22, 2017
  • Un run/patient n'a plus de sample_set associé suite à une suppression
    #2290 · created Mar 24, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug *-go priority-4-week server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 7
    updated May 22, 2017
  • Les permissions ne sont pas vérifiées dans lors d'une édition de sequence_file
    #2122 · created Jan 23, 2017 by Ryan Herbert   !!-bug !-security +-deploy server
    • CLOSED
    • 2
    updated May 22, 2017
  • Vérifier qu'un élément existe avant d'y accéder
    #2112 · created Jan 18, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug server
    • CLOSED
    • 2
    updated May 22, 2017
  • AttributeError: 'NoneType' object has no attribute id
    #2111 · created Jan 17, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug server
    • CLOSED
    • 2
    updated May 22, 2017
  • Sur dev.vidjil.org le patient édité n'est pas celui attendu
    #2105 · created Jan 12, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug server
    • CLOSED
    • 1
    updated May 22, 2017
  • Liste de patients affiche <type 'type'> à la place de patients
    #2104 · created Jan 12, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug server
    • CLOSED
    • 1
    updated May 22, 2017
  • Forcer la mise à jour des fichiers en cache.
    #2498 · created May 24, 2017 by Ryan Herbert   server
    • CLOSED
    • 1
    • 0
    updated Oct 19, 2017
  • "compare samples for this patient" pour les sample sets
    #2512 · created Jun 07, 2017 by Mathieu Giraud   server
    • CLOSED
    • 1
    updated Jun 07, 2017
  • Erreur de permission dans l'utilisation du compare samples
    #2518 · created Jun 07, 2017 by Mikaël Salson   !!-bug PAR-Debré priority-4-week server server-compare-samples server-groups
    • CLOSED
    • 8
    updated Sep 12, 2017
  • Mettre les noms de famille dans les logs
    #2521 · created Jun 08, 2017 by Mikaël Salson   Web 2017.09   +-merge bio-control server
    • CLOSED
    • 1
    • 0
    updated Jul 07, 2017
  • Restes de "patient" pour les sample sets
    #2519 · created Jun 07, 2017 by Mathieu Giraud   +-merge dev-policy doc server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 4
    updated Sep 12, 2017
  • CORS: Le lien logout ne fonctionne pas quand le client et le serveur ne sont pas au même endroit
    #2477 · created May 22, 2017 by Mikaël Salson   Web 2021.05   !!-bug +-merge dev-dead-code server
    • CLOSED
    • 3
    • 28
    updated Apr 15, 2021
  • Les URL avec le paramètre patient fonctionnent-elles encore ?
    #3062 · created Feb 23, 2018 by Mikaël Salson   Web 2018.01   !!-bug +-merge client-api server server-database
    • CLOSED
    • 2
    updated Mar 13, 2018
  • Erreur sur l'upload de fichiers "doublons"
    #2855 · created Nov 22, 2017 by Ryan Herbert   !!-bug +-merge server
    • CLOSED
    • 1
    • 0
    updated Nov 30, 2017
  • Charger les permissions en une fois dans SampleSetList
    #2476 · created May 19, 2017 by Mikaël Salson   +-merge server server-database server-speed
    • CLOSED
    • 1
    • 5
    updated Jul 12, 2017
  • "Vidjil is loading": Le bouton login fonctionne-t-il du premier coup ?
    #2525 · created Jun 09, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Lille client-ergonomy server server-auth user-request
    • CLOSED
    • 1
    • 8
    updated Apr 13, 2018
  • Faut-il maintenir un groupe vide
    #2536 · created Jun 15, 2017 by Thonier Florian   !-reflexion LIL-Lille server server-groups
    • CLOSED
    • 4
    updated Jun 15, 2017
  • Sauvegarde de l'analyse ne fonctionne pas
    #2021 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker !!-bug priority-5-today server
    • CLOSED
    • 0
    updated Jul 05, 2017
  • Lorsque le run est mal renseigné, ne pas permettre la soumission du formulaire
    #2000 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker !!-bug priority-2 server
    • CLOSED
    • 0
    updated Jul 05, 2017
  • Base de données remplie avec des scheduler_task et scheduler_run
    #1948 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker !!-bug *-go priority-5-today server server-database server-pre-process
    • CLOSED
    • 0
    updated Jul 05, 2017
  • Pre-process is still pending, re-schedule
    #1931 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker !!-bug priority-4-week server server-pre-process server-uwsgi
    • CLOSED
    • 0
    updated Jul 05, 2017
  • Export/import d'un patient/run/sample_set ou d'un ensemble de samples
    #2063 · created Dec 13, 2016 by Thonier Florian   prod-server-lil   !-reflexion #-privacy client-database server server-admin server-database server-sample-sets
    • CLOSED
    • 5
    updated Oct 27, 2017
  • Quatre fichiers de résultats (sur une même config) mais seulement deux fichiers fusés
    #1523 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker !!-bug *-go priority-4-week server server-fuse
    • CLOSED
    • 0
    updated Jul 10, 2017
  • Pagination de la requête patient/sample_set
    #2037 · created Dec 02, 2016 by Ryan Herbert   Web 2017.03   client-ergonomy server server-sample-sets server-speed
    • CLOSED
    • 3
    updated Jul 10, 2017
  • Tip of the day : implémentation
    #2582 · created Aug 23, 2017 by Mathieu Giraud   Nov 10, 2017   *-go com com-first-time-user doc server
    • CLOSED
    • 8
    updated Nov 17, 2017
  • Admin: Liste des jobs en attente, en cours depuis l'interface admin
    #2605 · created Sep 01, 2017 by Thonier Florian   LIL-Lille feature server server-admin server-task.py
    • CLOSED
    • 1
    • 3
    updated Nov 18, 2020
  • My Account : liste des derniers jobs depuis l'interface d'un utilisateur
    #2606 · created Sep 01, 2017 by Thonier Florian   *-go Paris-Pitié client-database client-menu server server-auth server-ergonomy server-my-account user-request
    • CLOSED
    • 1
    • 7
    updated Nov 18, 2020
  • Déployer manuellement le serveur (feature-s) via Docker
    #2637 · created Sep 15, 2017 by Mathieu Giraud   dev-cd server server-docker
    • CLOSED
    • 5
    updated Jun 25, 2020
  • pear : resultat afficher en success malgré un fail.
    #2677 · created Sep 28, 2017 by Thonier Florian   !!-bug com com-first-time-user server server-pre-process
    • CLOSED
    • 6
    updated Apr 22, 2020
  • Bug au remplissage du champ patient d'un sample
    #2702 · created Oct 10, 2017 by Mikaël Salson   Web 2017.11   !!-bug *-go server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 1
    • 4
    updated Nov 17, 2017
  • Faire un "compare" sur un seul sample
    #2726 · created Oct 13, 2017 by Ryan Herbert   +-deploy Paris-Pitié server server-compare-samples server-fuse user-request
    • CLOSED
    • 2
    • 15
    updated Nov 20, 2020
  • Erreur serveur Demo L4 / multi-inc-xxx, fused file not found
    #2765 · created Oct 31, 2017 by Ghost User   !!-bug com-first-time-user server
    • CLOSED
    • 3
    updated Oct 31, 2017
  • Incident 2017-11-22 : Upload impossible ?
    #2849 · created Nov 22, 2017 by Mathieu Giraud   !!-crisis PAN-Necker server server-upload
    • CLOSED
    • 1
    • 16
    updated Feb 16, 2018
  • Augmenter le nombre de CPU pouvant être utilisés sur le serveur
    #1146 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker *-go priority-5-today server server-hosting
    • CLOSED
    • 0
    updated Nov 22, 2017
  • Web application - Server
    #4 · created Nov 24, 2016 by Mathieu Giraud   !-security +-roadmap server server-api server-database server-hosting server-monitor
    • CLOSED
    • 1
    updated Apr 03, 2019
  • makefile global
    #1027 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker !-important priority-2 server server-hosting sub
    • CLOSED
    • 0
    updated Nov 22, 2017
  • makefile server
    #1026 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker !-important priority-2 server server-hosting sub
    • CLOSED
    • 0
    updated Nov 22, 2017
  • Script de déploiement / packages utilisés
    #1025 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker !-important priority-2 server server-hosting
    • CLOSED
    • 1
    updated Nov 22, 2017
  • Récupérer des données par FTP/HTTP/NFS ou autre
    #1588 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   Web 2017.03   !-reflexion LIL-Lille priority-2 server server-database server-hosting server-integration server-mounted-files
    • CLOSED
    • 7
    updated Nov 22, 2017
  • Séparation serveurs : app (html/js) // vda
    #1448 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-reflexion priority-1-low server server-hosting server-upload
    • CLOSED (MOVED)
    • 0
    updated Nov 22, 2017
  • Empêcher l'upload ou de lancer des jobs lorsqu'il ne reste plus assez d'espace disque
    #2007 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker dev-robust priority-3-month server server-hosting
    • CLOSED
    • 1
    updated Jan 08, 2020
  • Récupérer des données par FTP/HTTP ou autre
    #1475 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   priority-1-low server server-hosting server-integration server-upload
    • CLOSED
    • 1
    updated Nov 22, 2017
  • Création batch de plusieurs patients/runs/sets
    #2878 · created Nov 22, 2017 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié server server-sample-sets user-request
    • CLOSED
    • 15
    updated Oct 21, 2020
  • Doit-on cacher ou inactiver les boutons cliqués dans l'interface ?
    #2894 · created Nov 24, 2017 by Ryan Herbert   client-ergonomy server
    • CLOSED
    • 12
    updated Sep 24, 2018
  • Admin / My Account : controleur et vue pour connaître son nombre d'échantillons/patients/runs/sets
    #2951 · created Dec 13, 2017 by Mathieu Giraud   #-vidjilnet server server-auth server-my-account
    • CLOSED
    • 1
    • 2
    updated Nov 18, 2020
  • My Account: informations sur les groupes
    #2952 · created Dec 13, 2017 by Mathieu Giraud   LIL-Lille server server-auth server-my-account user-request user-traceability
    • CLOSED
    • 1
    • 1
    updated Nov 18, 2020
  • Choix du dernier set/run lors de l'import d'un nouvel échantillon
    #2961 · created Dec 20, 2017 by Anne de Septenville   Paris-Pitié client-autocomplete feature server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 5
    updated Dec 20, 2017
  • Auto-complétion au clic avec les derniers set modifiés
    #2963 · created Dec 20, 2017 by Mikaël Salson   Paris-Pitié client-autocomplete feature server server-sample-sets user-request
    • CLOSED
    • 1
    • 2
    updated Mar 21, 2018
  • Pas d'avertissement lorsque la date rentrée pour un sample est incorrecte
    #2997 · created Jan 18, 2018 by Mikaël Salson   Web 2018.01   !!-bug LIL-Lille client-ergonomy server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 1
    • 2
    updated Mar 21, 2018
  • Rajouter "real info" pour les permissions par défaut lors de la création des utilisateurs
    #3001 · created Jan 19, 2018 by Mathieu Giraud   *-go server server-auth server-groups server-permissions support-policy
    • CLOSED
    • 1
    • 3
    updated Mar 30, 2021
  • Compléter la documentation sur Docker
    #3037 · created Feb 06, 2018 by Mikaël Salson   doc server server-docker
    • CLOSED
    • 1
    updated Oct 16, 2018
  • Stats sur un ensemble de samples : contrôleur
    #3041 · created Feb 09, 2018 by Mathieu Giraud   *-go feature priority-4-week server server-qc-stats
    • CLOSED
    • 15
    updated Sep 14, 2018
  • avoir dans le mail "new sequences" le nom de l'utilisateur
    #3051 · created Feb 15, 2018 by Thonier Florian   *-go com-mail-template feature server
    • CLOSED
    • 1
    • 2
    updated Feb 20, 2018
  • Nommer plus clairement les groupes utilisateurs
    #2024 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   *-go priority-2 server server-auth server-groups
    • CLOSED
    • 3
    updated Jul 01, 2020
  • Problème d'encodage des noms accentués dans les logs
    #3055 · created Feb 20, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug *-go server
    • CLOSED
    • 1
    • 0
    updated Mar 22, 2018
  • Tests unitaires serveur sur gitlab CI
    #3061 · created Feb 21, 2018 by Mathieu Giraud   dev-ci dev-tests server
    • CLOSED
    • 1
    • 1
    updated Mar 06, 2018
  • Avoir une méthode non bloquante pour 'compare patient'
    #1508 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker !!-bug !-reflexion priority-3-month server server-compare-samples
    • CLOSED
    • 0
    updated Feb 23, 2018
  • conserver le path lors du chargement de plusieurs fichiers
    #3063 · created Feb 27, 2018 by Thonier Florian   !-reflexion LIL-Lille client client-accessibility feature server
    • CLOSED
    • 1
    updated Mar 05, 2018
  • Réparer les tests unit-server
    #3065 · created Feb 27, 2018 by Mathieu Giraud   dev-ci dev-tests server
    • CLOSED
    • 1
    • 2
    updated May 30, 2018
  • Multi-upload : les pre-process ne sont pas lancés
    #3073 · created Mar 06, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug *-go server server-sample-sets server-upload
    • CLOSED
    • 1
    • 0
    updated Mar 21, 2018
  • Les vues patient/index.html et run/index.html sont-elles encore utiles ?
    #3076 · created Mar 06, 2018 by Mikaël Salson   dev-dead-code server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 1
    • 1
    updated Nov 21, 2018
  • Erreur serveur en visualisant des résultats sur la branche feature-w/multi_upload
    #3077 · created Mar 06, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug *-go server server-sample-sets shell-log
    • CLOSED
    • 4
    updated Apr 05, 2018
  • Parfois un job server-unit ne termine pas
    #3085 · created Mar 15, 2018 by Mathieu Giraud   dev-build dev-tests server
    • CLOSED
    • 2
    updated Mar 20, 2018
  • Add set : erreur serveur si unicode dans le nom
    #3097 · created Mar 22, 2018 by Mathieu Giraud   !!-bug client-i18n server
    • CLOSED
    • 3
    updated Mar 22, 2018
  • Les utilisateurs ne peuvent pas supprimer ou éditer les nouveaux sample sets créés
    #3138 · created Apr 05, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug !-important server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 4
    updated Apr 05, 2018
  • Récupérer les patients à partir d'un run ou d'un set
    #3150 · created Apr 09, 2018 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié server server-sample-sets user-request
    • CLOSED
    • 2
    updated Mar 25, 2019
  • Plusieurs configs ne sont plus visibles
    #3157 · created Apr 10, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug !-important server server-admin server-config
    • CLOSED
    • 9
    updated May 28, 2020
  • La liste patients met beaucoup trop de temps à se charger
    #3169 · created Apr 13, 2018 by Mikaël Salson   !-important server server-database server-speed
    • CLOSED
    • 3
    • 33
    updated Feb 11, 2021
  • Ajout de samples : « specific set » est peu clair
    #3178 · created Apr 16, 2018 by Mikaël Salson   !-reflexion bikeshedding client-ergonomy server
    • CLOSED
    • 1
    updated Apr 17, 2018
  • Bug lors de l'ajout de samples à plusieurs patients
    #3199 · created Apr 19, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug !!-crisis !-important *-go LIL-Lille server server-sample-sets
    • CLOSED
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    • 2
    updated Jun 13, 2018
  • Supprimer un sample set supprime forcément les fichiers de séquence : laisser le choix
    #3200 · created Apr 19, 2018 by Mikaël Salson   feature server server-sample-sets
    • CLOSED
    • 0
    updated Jun 24, 2020
  • Plus d'enregistrement du first login/last login
    #3202 · created Apr 20, 2018 by Thonier Florian   !!-bug client client-database server server-admin
    • CLOSED
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    • 3
    updated Oct 02, 2018
  • Éditer un sample qui possède un pre-process empêche de relancer une analyse dessus
    #3213 · created May 03, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug server server-pre-process server-task.py
    • CLOSED
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    • 1
    updated Sep 24, 2019
  • Un process peut se lancer avant son pre-process si R2 n'a pas fini d'être téléchargé
    #3289 · created Jun 15, 2018 by Mikaël Salson   !!-bug !!-crisis !-important priority-4-week server server-pre-process server-task.py
    • CLOSED
    • 1
    • 2
    updated Jul 03, 2018
  • Optimiser la page des groupes
    #3352 · created Jul 10, 2018 by Ryan Herbert   !-important server server-admin
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    • 8
    updated Oct 05, 2018
  • Le tri de la liste sample_set ne fonctionne pas correctement
    #3359 · created Jul 11, 2018 by Ryan Herbert   !!-bug server
    • CLOSED
    • 1
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    updated Jul 13, 2018
  • Statistiques : tester, mettre en production pour tous
    #3436 · created Aug 10, 2018 by Mathieu Giraud   feature server
    • CLOSED
    • 1
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    updated Oct 02, 2018
  • Environnement de review pour les feature-s
    #3442 · created Aug 30, 2018 by Mathieu Giraud   dev-gitlab dev-tests server server-docker
    • CLOSED
    • 0
    updated Oct 26, 2018
  • serveur delocalisé; problème à l'installation; job coincés en queue
    #3445 · created Aug 31, 2018 by Thonier Florian   doc repseq-community server server-admin user-request
    • CLOSED
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    updated Feb 09, 2021
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