Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Représentative : trop courte ? Graine utilisée ? Et en multi-système ?

#1165 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team bio-analyze-more bio-germlines cpp cpp-representative
- 1
updated Dec 11, 2020
La représentative couvre mal certains jeux de clones

#1541 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !!-bug Paris-Pitié bio-control cpp-representative dev-robust priority-3-month
- 3
updated Dec 11, 2020
Nombre de répétitions de TAC différent entre Sanger et NGS

#2908 · opened Nov 29, 2017 by Mathieu Giraud !!-bug Paris-Pitié cpp-representative
- 3
updated Mar 25, 2019
Clone avec une séquence consensus trop courte, coverage .56

#2912 · opened Nov 29, 2017 by Anne de Septenville Paris-Pitié bio-control cpp cpp-representative
- 2
updated Nov 29, 2017
Clone chimère

#2967 · opened Dec 22, 2017 by Anne de Septenville Algo -- Important !!-bug cpp cpp-representative
- 3
updated Jun 26, 2018
Sortir un alignement multiple de reads d'un clone

#3305 · opened Jun 25, 2018 by Mikaël Salson bio-analyze-more bio-control cpp-representative feature
- 3
updated Mar 08, 2019
BinReadStorage : Pertinence de 30 bins, tests ?

#3394 · opened Jul 18, 2018 by Mathieu Giraud cpp-representative dev-tests priority-1-low
- 2
updated Mar 15, 2019
Cas particulier d'un clone retrouvé dans une analyse

#3897 · opened Apr 04, 2019 by Thonier Florian PAN-Necker bio-e-value cpp cpp-cluster cpp-representative
- 2
updated Apr 04, 2019
Erreur dans le calcul de certain coverage

#3898 · opened Apr 05, 2019 by Thonier Florian !!-bug cpp cpp-representative
- 1
updated Apr 05, 2019
fuse.py: quelle séquence conserver ? plus grande, meilleur top, plus de reads ?

#3970 · opened Aug 20, 2019 by Thonier Florian !-reflexion Lausanne Paris-Pitié cpp-representative feature server-fuse
- 18
updated Dec 11, 2020
Séquence consensus incomplète analyse comparée

#4427 · opened Jul 28, 2020 by Anne de Septenville Paris-Pitié cpp cpp-representative server-fuse
- 2
updated Jul 29, 2020
Exporter un .fastq pour la représentative / qualité pour la consensus (ensemble de la séquence)

#1148 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-hard !-reflexion Paris-Pitié com-vw-vidjil-workshop cpp cpp-export cpp-representative feature priority-2
- 4
updated Mar 20, 2019
RNA-seq, representative, coverage

#1514 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker bio-rnaseq cpp-representative priority-2
- 0
updated Nov 29, 2016
Splitter un clone / ré-analyser un sous-ensemble de reads

#1567 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-reflexion Paris-Pitié REN-Rennes bio-control cpp cpp-cluster cpp-representative
- 4
updated Mar 08, 2019
Sortir la séquence consensus complète en donnant un histogramme de la représentativité (à la JalView)

#1972 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker !-reflexion Paris-Pitié cpp-representative feature priority-2
- 0
updated Jun 25, 2018
Le résultat de la segmentation change selon le contexte

#2003 · opened Nov 29, 2016 by Vidjil Team Algo -- Important +-working-dead cpp cpp-dynprog cpp-finesegmenter-D cpp-representative
- 10
updated Nov 23, 2019
Longueur des séquences consensus sur S22

#2287 · opened Mar 22, 2017 by Mathieu Giraud cpp cpp-heuristic cpp-representative
- 1
updated Dec 11, 2020