Issues · vidjil / vidjil · GitLab

Pre-process: mettre avant le log la correspondance entre noms serveurs et noms des fichiers dans le log

#2725 · created Oct 13, 2017 by Ryan Herbert #-privacy *-go Paris-Pitié server-pre-process user-request
- 7
updated Oct 17, 2017
My Account : liste des derniers jobs depuis l'interface d'un utilisateur

#2606 · created Sep 01, 2017 by Thonier Florian *-go Paris-Pitié client-database client-menu server server-auth server-ergonomy server-my-account user-request
- CLOSED
- 1
- 7
updated Nov 18, 2020
Donner toute la séquence en acides aminés

#2140 · created Jan 30, 2017 by Mikaël Salson *-go Paris-Pitié bio-AA bio-CLL client client-aligner feature
- CLOSED
- 7
updated Apr 08, 2021
Décalage des informations sous la séquence dans le segmenter

#1982 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team *-go Paris-Pitié client client-aligner client-ergonomy priority-2
- CLOSED
- 9
updated Apr 08, 2021
Clone manqué avec une grosse délétion (read trop court pour la fenêtre)

#2910 · created Nov 29, 2017 by Anne de Septenville Algo 2017.11 !-important +-deploy Paris-Pitié bio-analyze-more cpp cpp-heuristic
- CLOSED
- 8
updated Jan 26, 2021
Avoir un rapport plus générique

#2233 · created Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud !-important LIL-Lille PAR-Debré Paris-Pitié bio-control client client-rapport user-request
- 8
updated Dec 11, 2020
Upload de plusieurs fichiers via des formulaires web

#1362 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team Web 2018.01 !-hard !-important !-reflexion BRI-Bristol BRU-Bruxelles KIE-Kiel LYON-Sarah MON-Monza PAN-Necker PAR-Debré PRA-Prague Paris-Pitié TOU-Toulouse feature priority-2 server-database server-upload user-request
- CLOSED
- 1
- 35
updated Mar 21, 2018
fuse.py: quelle séquence conserver ? plus grande, meilleur top, plus de reads ?

#3970 · created Aug 20, 2019 by Thonier Florian !-reflexion Lausanne Paris-Pitié cpp-representative feature server-fuse
- 19
updated Apr 06, 2021
Genescan gris, sur les smaller clones, et partiellement coloré, dans le client : fuse.py / distributions

#3902 · created Apr 08, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion PAN-Necker Paris-Pitié client-bar client-virtual-clone ec-ngs next-audio user-request
- CLOSED
- 1
- 15
updated Apr 23, 2020
Avoir plus d'informations sur PEAR

#3054 · created Feb 16, 2018 by Thonier Florian !-reflexion MON-Monza Paris-Pitié bio-control client client-info feature server-pre-process server-qc-stats user-request
- CLOSED
- 1
- 6
updated Feb 03, 2021
Upload de plusieurs fichiers .fasta via un .zip / .csv

#2891 · created Nov 23, 2017 by Mathieu Giraud !-hard !-reflexion KIE-Kiel PAR-Debré Paris-Pitié TOU-Toulouse server-database server-upload user-request
- 8
updated Mar 17, 2021
"Satellites" et clustérisation

#2852 · created Nov 22, 2017 by Mathieu Giraud !-reflexion Paris-Pitié bio-control
- 1
updated Nov 22, 2017
Sortir la séquence consensus complète en donnant un histogramme de la représentativité (à la JalView)

#1972 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team old_tracker !-reflexion Paris-Pitié cpp-representative feature priority-2
- 0
updated Jun 25, 2018
Splitter un clone / ré-analyser un sous-ensemble de reads

#1567 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-reflexion Paris-Pitié REN-Rennes bio-control cpp cpp-cluster cpp-representative
- 4
updated Mar 08, 2019
Se souvenir des amorces/primers utilisées : comment ?

#1253 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-hard !-reflexion #-aap-ADT-Inria #-quality LIL-Lille Paris-Pitié REN-Rennes bio-primers client-database feature priority-2 server-database server-qc-stats user-request
- 11
updated Feb 12, 2021
Exporter un .fastq pour la représentative / qualité pour la consensus (ensemble de la séquence)

#1148 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team !-hard !-reflexion Paris-Pitié com-vw-vidjil-workshop cpp cpp-export cpp-representative feature priority-2
- 4
updated Mar 20, 2019
Titre des samples lors de la comparaison de différentes analyses d'un même fichier (compare samples)

#2241 · created Mar 09, 2017 by Mikaël Salson !-hard Paris-Pitié client-ergonomy server server-compare-last-results
- 2
updated Mar 13, 2017
Le FineSegmenter ne donne pas le début du V ou la fin du J

#2138 · created Jan 27, 2017 by Mikaël Salson Algo 2020.06 !-hard Paris-Pitié bio-capture cpp cpp-dynprog cpp-finesegmenter feature sequencers-Nanopore
- CLOSED
- 1
- 11
updated Oct 14, 2020
Contrôle de la contamination sur un run

#1744 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team LIL-Lille MON-Monza PAN-Necker Paris-Pitié bio-control client feature priority-3-month server-qc-stats user-request
- 22
updated Dec 11, 2020
Export csv de la liste des clones en sortie de l'algo

#1727 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team BRU-Bruxelles Paris-Pitié bio-analyze-more client-export com-vw-vidjil-workshop feature priority-3-month repseq-IMGT
- CLOSED
- 8
updated Jun 19, 2020

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