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New issue
  • Priority Created date Updated date Milestone due date Due date Popularity Label priority Manual Title
  • Se souvenir des amorces/primers utilisées : comment ?
    #1253 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   Web 2022.12   !-hard !-reflexion #-aap-ADT-Inria #-quality +-roadmap LIL-Lille Paris-Pitié REN-Rennes bio-primers client-database feature priority-2 server-database server-qc-stats user-request
    • 12
    updated May 18, 2022
  • On a moins de 100 clones avec la config MiXCR
    #2520 · created Jun 08, 2017 by Mikaël Salson   Paris-Pitié repseq-mixcr server-config
    • 0
    updated Jun 08, 2017
  • La représentative couvre mal certains jeux de clones
    #1541 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !!-bug Paris-Pitié bio-control cpp-representative dev-robust priority-3-month
    • 3
    updated Apr 08, 2021
  • Pre-process: mettre avant le log la correspondance entre noms serveurs et noms des fichiers dans le log
    #2725 · created Oct 13, 2017 by Ryan Herbert   #-privacy *-go Paris-Pitié server-pre-process user-request
    • 7
    updated Oct 17, 2017
  • Détecter les primers dimers
    #2820 · created Nov 21, 2017 by Mathieu Giraud   !-reflexion LIL-Immuno PAR-Debré Paris-Pitié REN-Rennes bio-control bio-primers client-warning cpp cpp-heuristic user-request
    • 1
    • 14
    updated May 17, 2022
  • "Satellites" et clustérisation
    #2852 · created Nov 22, 2017 by Mathieu Giraud   !-reflexion Paris-Pitié bio-control
    • 1
    updated Nov 22, 2017
  • Qualité de chaque échantillon dans un run, contrôles (vue spécifique)
    #2875 · created Nov 22, 2017 by Mikaël Salson   LIL-Lille Paris-Pitié bio-control client-warning server-pre-process server-qc-stats server-sample-sets user-request
    • 12
    updated May 12, 2022
  • Upload de plusieurs fichiers .fasta via un .zip / .csv
    #2891 · created Nov 23, 2017 by Mathieu Giraud   Web 2022.12   !-reflexion +-CST-decision Amiens-Nordine KIE-Kiel NAN - Nantes PAR-Debré Paris-Pitié TOU-Toulouse server-database server-upload user-request
    • 15
    updated May 20, 2022
  • Clones aux proportions similaires avec des variations mineures de séquences : lequel est le bon ?
    #2907 · created Nov 29, 2017 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié bio-control client
    • 8
    updated Jun 05, 2018
  • Nombre de répétitions de TAC différent entre Sanger et NGS
    #2908 · created Nov 29, 2017 by Mathieu Giraud   !!-bug Paris-Pitié cpp-representative
    • 3
    updated Mar 25, 2019
  • Grands produits de PCR, pas d'overlap entre R1 et R2, pas de CDR3
    #2914 · created Nov 29, 2017 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié bio-control
    • 2
    updated Nov 29, 2017
  • Absence de reads lors d'une comparaison de 2 échantillons
    #3410 · created Jul 20, 2018 by Anne de Septenville   Paris-Pitié server-compare-samples
    • 7
    updated Jul 20, 2018
  • Améliorer l'ergonomie de l'auto-completion
    #3420 · created Jul 27, 2018 by Anne de Septenville   Paris-Pitié client-autocomplete client-ergonomy
    • 3
    updated Mar 25, 2019
  • Export CSV de stats / qualité
    #3539 · created Oct 09, 2018 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié server-qc-stats user-request
    • 0
    updated May 12, 2022
  • Option to keep only productive recombinations
    #3747 · created Feb 26, 2019 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié THE-Thessaloniki bio-AA
    • 0
    updated Feb 26, 2019
  • Read merger: INAB tool ?
    #3749 · created Feb 26, 2019 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié THE-Thessaloniki server-pre-process
    • 0
    updated Feb 26, 2019
  • Affichage du lien vers l'analyse d'un sample réassocié à un patient/run/set
    #3753 · created Feb 28, 2019 by Anne de Septenville   Paris-Pitié server server-ergonomy server-sample-sets
    • 5
    updated Mar 11, 2019
  • Erreur client sur une séquence particulière
    #3817 · created Mar 18, 2019 by Mikaël Salson   !!-bug Paris-Pitié client client-aligner
    • 0
    updated Mar 18, 2019
  • Analyse FAILED avec un résultat
    #3862 · created Mar 22, 2019 by Anne de Septenville   !!-bug Paris-Pitié server server-fuse server-task.py
    • 6
    updated Mar 25, 2019
  • "to CloneDB" fait disparaître l'affichage dans le panneau supérieur
    #3888 · created Apr 02, 2019 by Anne de Septenville   !!-bug *-go Paris-Pitié app-clonedb client client-bar
    • 1
    • 10
    updated Jun 09, 2020
  • Actualiser régulièrement la CloneDB
    #3889 · created Apr 02, 2019 by Anne de Septenville   Paris-Pitié app-clonedb user-request
    • 6
    updated Dec 13, 2019
  • fuse.py: quelle séquence conserver ? plus grande, meilleur top, plus de reads ?
    #3970 · created Aug 20, 2019 by Thonier Florian   !-reflexion Lausanne Paris-Pitié cpp-representative feature server-fuse
    • 23
    updated May 20, 2022
  • Afficher les index de diversité dans le client
    #4038 · created Nov 06, 2019 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié bio-diversity client-graph math-stats user-request
    • 5
    updated Nov 27, 2019
  • Ajout d'un même set/run sur plusieurs samples déjà importés
    #4169 · created Jan 31, 2020 by Anne de Septenville   Paris-Pitié server-ergonomy server-sample-sets user-request
    • 0
    updated Feb 03, 2020
  • API : script d'exemple
    #4207 · created Mar 03, 2020 by Mathieu Giraud   Web 2022.05   Paris-Pitié dev-tests doc server-api
    • 15
    updated Apr 20, 2022
  • Problème détection d'un 2e D trop court
    #4267 · created Apr 28, 2020 by Anne de Septenville   Paris-Pitié bio-e-value cpp cpp-finesegmenter-D user-request
    • 10
    updated Jun 23, 2020
  • Séquence consensus incomplète analyse comparée
    #4427 · created Jul 28, 2020 by Anne de Septenville   Paris-Pitié cpp cpp-representative server-fuse
    • 2
    updated Apr 08, 2021
  • Exporter des rapports pour de nombreux patients
    #4499 · created Sep 29, 2020 by Mikaël Salson   Paris-Pitié patho-LLC server-qc-stats
    • 2
    updated Oct 27, 2021
  • Exporter un .fastq pour la représentative / qualité pour la consensus (ensemble de la séquence)
    #1148 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-hard !-reflexion Paris-Pitié com-vw-vidjil-workshop cpp cpp-export cpp-representative feature priority-2
    • 4
    updated Mar 20, 2019
  • Splitter un clone / ré-analyser un sous-ensemble de reads
    #1567 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   !-reflexion Paris-Pitié REN-Rennes bio-control cpp cpp-cluster cpp-representative
    • 4
    updated Jun 23, 2021
  • Replicats pour gommer des erreurs de PCR/séquençage
    #1638 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker Paris-Pitié bio-control feature priority-2
    • 1
    updated Jul 30, 2020
  • Contrôle de la contamination sur un run
    #1744 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   LIL-Lille MON-Monza PAN-Necker Paris-Pitié bio-control client feature priority-3-month server-qc-stats user-request
    • 25
    updated May 17, 2022
  • Sortir la séquence consensus complète en donnant un histogramme de la représentativité (à la JalView)
    #1972 · created Nov 29, 2016 by Vidjil Team   old_tracker !-reflexion Paris-Pitié cpp-representative feature priority-2
    • 0
    updated Jun 25, 2018
  • Avoir un rapport plus générique
    #2233 · created Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud   !-important LIL-Lille PAR-Debré Paris-Pitié bio-control client client-rapport user-request
    • 8
    updated May 12, 2022
  • Faut-il afficher 1000 clones dans le client sur un échantillon ?
    #2236 · created Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié bio-CLL bio-analyze-more client feature
    • 9
    updated Apr 08, 2019
  • Titre des samples lors de la comparaison de différentes analyses d'un même fichier (compare samples)
    #2241 · created Mar 09, 2017 by Mikaël Salson   !-hard Paris-Pitié client-ergonomy server server-compare-last-results
    • 2
    updated Mar 13, 2017
  • Avertir lorsque le pourcentage de séquences assemblées est faible
    #2243 · created Mar 09, 2017 by Mikaël Salson   Paris-Pitié bio-control client-warning server-pre-process
    • 3
    updated Oct 19, 2018
  • stats-qc : Pouvoir afficher d'un coup tous les échantillons d'un set
    #4539 · created Oct 21, 2020 by Mathieu Giraud   Web 2022.05   Paris-Pitié feature server-ergonomy server-qc-stats
    • 12
    updated Apr 26, 2022
  • Pouvoir associer d'un coup plusieurs samples à un set / créer un nouveau set avec des samples existants
    #4569 · created Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié server-sample-sets user-request
    • 1
    updated Dec 11, 2020
  • Documenter comment travailler sur un format .vidjil
    #4570 · created Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   !-easy *-go Paris-Pitié doc repseq-formats
    • 0
    updated Feb 03, 2021
  • API / URL serveur : arriver sur une page d'un set
    #4571 · created Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié server-api server-sample-sets
    • 1
    updated Mar 29, 2021
  • Pouvoir cliquer avec le bouton droit sur des liens sample sets
    #4572 · created Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié client-ergonomy server-sample-sets
    • 1
    updated Nov 20, 2020
  • Page principale du serveur : trier les sets par ordre de mise à jour ?
    #4573 · created Nov 20, 2020 by Mathieu Giraud   Paris-Pitié bio-mrd client-database client-ergonomy
    • 8
    updated Mar 23, 2022
  • Identifier le V dans les séquences non mergées
    #4723 · created Mar 17, 2021 by Anne de Septenville   Paris-Pitié bio-analyze-more patho-LLC user-request
    • 4
    updated Apr 01, 2021
  • Analyse chaîne légère et mutation R110
    #4944 · created Jan 28, 2022 by Anne de Septenville   Paris-Pitié patho-LLC server-config user-request
    • 7
    updated Mar 04, 2022