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Manual
Priority
Created date
Updated date
Milestone due date
Due date
Popularity
Label priority
Manual
Title
Se souvenir des amorces/primers utilisées : comment ?
#1253
· created
Nov 29, 2016
by
Vidjil Team
Web 2022.12
!-hard
!-reflexion
#-aap-ADT-Inria
#-quality
+-roadmap
LIL-Lille
Paris-Pitié
REN-Rennes
bio-primers
client-database
feature
priority-2
server-database
server-qc-stats
user-request
12
updated
May 18, 2022
On a moins de 100 clones avec la config MiXCR
#2520
· created
Jun 08, 2017
by
Mikaël Salson
Paris-Pitié
repseq-mixcr
server-config
0
updated
Jun 08, 2017
La représentative couvre mal certains jeux de clones
#1541
· created
Nov 29, 2016
by
Vidjil Team
!!-bug
Paris-Pitié
bio-control
cpp-representative
dev-robust
priority-3-month
3
updated
Apr 08, 2021
Pre-process: mettre avant le log la correspondance entre noms serveurs et noms des fichiers dans le log
#2725
· created
Oct 13, 2017
by
Ryan Herbert
#-privacy
*-go
Paris-Pitié
server-pre-process
user-request
7
updated
Oct 17, 2017
Détecter les primers dimers
#2820
· created
Nov 21, 2017
by
Mathieu Giraud
!-reflexion
LIL-Immuno
PAR-Debré
Paris-Pitié
REN-Rennes
bio-control
bio-primers
client-warning
cpp
cpp-heuristic
user-request
1
14
updated
May 17, 2022
"Satellites" et clustérisation
#2852
· created
Nov 22, 2017
by
Mathieu Giraud
!-reflexion
Paris-Pitié
bio-control
1
updated
Nov 22, 2017
Qualité de chaque échantillon dans un run, contrôles (vue spécifique)
#2875
· created
Nov 22, 2017
by
Mikaël Salson
LIL-Lille
Paris-Pitié
bio-control
client-warning
server-pre-process
server-qc-stats
server-sample-sets
user-request
12
updated
May 12, 2022
Upload de plusieurs fichiers .fasta via un .zip / .csv
#2891
· created
Nov 23, 2017
by
Mathieu Giraud
Web 2022.12
!-reflexion
+-CST-decision
Amiens-Nordine
KIE-Kiel
NAN - Nantes
PAR-Debré
Paris-Pitié
TOU-Toulouse
server-database
server-upload
user-request
15
updated
May 20, 2022
Clones aux proportions similaires avec des variations mineures de séquences : lequel est le bon ?
#2907
· created
Nov 29, 2017
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
bio-control
client
8
updated
Jun 05, 2018
Nombre de répétitions de TAC différent entre Sanger et NGS
#2908
· created
Nov 29, 2017
by
Mathieu Giraud
!!-bug
Paris-Pitié
cpp-representative
3
updated
Mar 25, 2019
Grands produits de PCR, pas d'overlap entre R1 et R2, pas de CDR3
#2914
· created
Nov 29, 2017
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
bio-control
2
updated
Nov 29, 2017
Absence de reads lors d'une comparaison de 2 échantillons
#3410
· created
Jul 20, 2018
by
Anne de Septenville
Paris-Pitié
server-compare-samples
7
updated
Jul 20, 2018
Améliorer l'ergonomie de l'auto-completion
#3420
· created
Jul 27, 2018
by
Anne de Septenville
Paris-Pitié
client-autocomplete
client-ergonomy
3
updated
Mar 25, 2019
Export CSV de stats / qualité
#3539
· created
Oct 09, 2018
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
server-qc-stats
user-request
0
updated
May 12, 2022
Option to keep only productive recombinations
#3747
· created
Feb 26, 2019
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
THE-Thessaloniki
bio-AA
0
updated
Feb 26, 2019
Read merger: INAB tool ?
#3749
· created
Feb 26, 2019
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
THE-Thessaloniki
server-pre-process
0
updated
Feb 26, 2019
Affichage du lien vers l'analyse d'un sample réassocié à un patient/run/set
#3753
· created
Feb 28, 2019
by
Anne de Septenville
Paris-Pitié
server
server-ergonomy
server-sample-sets
5
updated
Mar 11, 2019
Erreur client sur une séquence particulière
#3817
· created
Mar 18, 2019
by
Mikaël Salson
!!-bug
Paris-Pitié
client
client-aligner
0
updated
Mar 18, 2019
Analyse FAILED avec un résultat
#3862
· created
Mar 22, 2019
by
Anne de Septenville
!!-bug
Paris-Pitié
server
server-fuse
server-task.py
6
updated
Mar 25, 2019
"to CloneDB" fait disparaître l'affichage dans le panneau supérieur
#3888
· created
Apr 02, 2019
by
Anne de Septenville
!!-bug
*-go
Paris-Pitié
app-clonedb
client
client-bar
1
10
updated
Jun 09, 2020
Actualiser régulièrement la CloneDB
#3889
· created
Apr 02, 2019
by
Anne de Septenville
Paris-Pitié
app-clonedb
user-request
6
updated
Dec 13, 2019
fuse.py: quelle séquence conserver ? plus grande, meilleur top, plus de reads ?
#3970
· created
Aug 20, 2019
by
Thonier Florian
!-reflexion
Lausanne
Paris-Pitié
cpp-representative
feature
server-fuse
23
updated
May 20, 2022
Afficher les index de diversité dans le client
#4038
· created
Nov 06, 2019
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
bio-diversity
client-graph
math-stats
user-request
5
updated
Nov 27, 2019
Ajout d'un même set/run sur plusieurs samples déjà importés
#4169
· created
Jan 31, 2020
by
Anne de Septenville
Paris-Pitié
server-ergonomy
server-sample-sets
user-request
0
updated
Feb 03, 2020
API : script d'exemple
#4207
· created
Mar 03, 2020
by
Mathieu Giraud
Web 2022.05
Paris-Pitié
dev-tests
doc
server-api
15
updated
Apr 20, 2022
Problème détection d'un 2e D trop court
#4267
· created
Apr 28, 2020
by
Anne de Septenville
Paris-Pitié
bio-e-value
cpp
cpp-finesegmenter-D
user-request
10
updated
Jun 23, 2020
Séquence consensus incomplète analyse comparée
#4427
· created
Jul 28, 2020
by
Anne de Septenville
Paris-Pitié
cpp
cpp-representative
server-fuse
2
updated
Apr 08, 2021
Exporter des rapports pour de nombreux patients
#4499
· created
Sep 29, 2020
by
Mikaël Salson
Paris-Pitié
patho-LLC
server-qc-stats
2
updated
Oct 27, 2021
Exporter un .fastq pour la représentative / qualité pour la consensus (ensemble de la séquence)
#1148
· created
Nov 29, 2016
by
Vidjil Team
!-hard
!-reflexion
Paris-Pitié
com-vw-vidjil-workshop
cpp
cpp-export
cpp-representative
feature
priority-2
4
updated
Mar 20, 2019
Splitter un clone / ré-analyser un sous-ensemble de reads
#1567
· created
Nov 29, 2016
by
Vidjil Team
!-reflexion
Paris-Pitié
REN-Rennes
bio-control
cpp
cpp-cluster
cpp-representative
4
updated
Jun 23, 2021
Replicats pour gommer des erreurs de PCR/séquençage
#1638
· created
Nov 29, 2016
by
Vidjil Team
old_tracker
Paris-Pitié
bio-control
feature
priority-2
1
updated
Jul 30, 2020
Contrôle de la contamination sur un run
#1744
· created
Nov 29, 2016
by
Vidjil Team
LIL-Lille
MON-Monza
PAN-Necker
Paris-Pitié
bio-control
client
feature
priority-3-month
server-qc-stats
user-request
25
updated
May 17, 2022
Sortir la séquence consensus complète en donnant un histogramme de la représentativité (à la JalView)
#1972
· created
Nov 29, 2016
by
Vidjil Team
old_tracker
!-reflexion
Paris-Pitié
cpp-representative
feature
priority-2
0
updated
Jun 25, 2018
Avoir un rapport plus générique
#2233
· created
Mar 09, 2017
by
Mathieu Giraud
!-important
LIL-Lille
PAR-Debré
Paris-Pitié
bio-control
client
client-rapport
user-request
8
updated
May 12, 2022
Faut-il afficher 1000 clones dans le client sur un échantillon ?
#2236
· created
Mar 09, 2017
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
bio-CLL
bio-analyze-more
client
feature
9
updated
Apr 08, 2019
Titre des samples lors de la comparaison de différentes analyses d'un même fichier (compare samples)
#2241
· created
Mar 09, 2017
by
Mikaël Salson
!-hard
Paris-Pitié
client-ergonomy
server
server-compare-last-results
2
updated
Mar 13, 2017
Avertir lorsque le pourcentage de séquences assemblées est faible
#2243
· created
Mar 09, 2017
by
Mikaël Salson
Paris-Pitié
bio-control
client-warning
server-pre-process
3
updated
Oct 19, 2018
stats-qc : Pouvoir afficher d'un coup tous les échantillons d'un set
#4539
· created
Oct 21, 2020
by
Mathieu Giraud
Web 2022.05
Paris-Pitié
feature
server-ergonomy
server-qc-stats
12
updated
Apr 26, 2022
Pouvoir associer d'un coup plusieurs samples à un set / créer un nouveau set avec des samples existants
#4569
· created
Nov 20, 2020
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
server-sample-sets
user-request
1
updated
Dec 11, 2020
Documenter comment travailler sur un format .vidjil
#4570
· created
Nov 20, 2020
by
Mathieu Giraud
!-easy
*-go
Paris-Pitié
doc
repseq-formats
0
updated
Feb 03, 2021
API / URL serveur : arriver sur une page d'un set
#4571
· created
Nov 20, 2020
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
server-api
server-sample-sets
1
updated
Mar 29, 2021
Pouvoir cliquer avec le bouton droit sur des liens sample sets
#4572
· created
Nov 20, 2020
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
client-ergonomy
server-sample-sets
1
updated
Nov 20, 2020
Page principale du serveur : trier les sets par ordre de mise à jour ?
#4573
· created
Nov 20, 2020
by
Mathieu Giraud
Paris-Pitié
bio-mrd
client-database
client-ergonomy
8
updated
Mar 23, 2022
Identifier le V dans les séquences non mergées
#4723
· created
Mar 17, 2021
by
Anne de Septenville
Paris-Pitié
bio-analyze-more
patho-LLC
user-request
4
updated
Apr 01, 2021
Analyse chaîne légère et mutation R110
#4944
· created
Jan 28, 2022
by
Anne de Septenville
Paris-Pitié
patho-LLC
server-config
user-request
7
updated
Mar 04, 2022