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Décalage de la séquence du CDR3 et de la jonction dans la fenêtre info
Dans #3333 (closed) j'avais un doute sur le fait que le CDR3 était souligné correctement. Et je viens d'être encore pris du même doute. En fait c'est à cause de la fenêtre info qui indique un cdr3 et une junction dont la séquence me semble décalée d'un nucléotide (elle commence un nucléotide trop tôt).
Par exemple ici : http://app.vidjil.org/?set=3241&config=32&clone=1,33 La jonction commence à TGTGCA (d'après IMGT et d'après notre soulignement) mais notre séquence, dans la fenêtre info, débute à CTGTGCA.
Dans le JSON on a les séquences en AA mais pas en nt. Donc ces séquences doivent être extraites avec une erreur de positionnement.