Ne pas relancer filterBioReaderWithACAutomaton() dans vidjil.cpp

Pour la sortie clone_file_name (ping #3269), e01870a4 (puis fe6f5c6f, 9e26c749) ré-utilisent filterBioReaderWithACAutomaton() au moment de la sortie du clone déjà segmenté. C'est dommage, on appelle au total filterBioReaderWithACAutomaton()... deux fois.

Pour enlever cela,

soit stocker filtered dans le FineSegmenter (le plus simple ?)
soit stocker directement filtered.read(box_V->ref_nb) dans box_V

cc @boreec

To upload designs, you'll need to enable LFS and have an admin enable hashed storage. More information