Diminuer ou décaler dynamiquement, par seuil, la taille de la fenêtre

Dans #2910 (closed) on manque un clone car il y a une grosse délétion dans le V, consuisant à une séquence très courte (~129nt) empêchant de bien positionner une fenêtre de 60nt.

C'est très grave puisqu'on peut manquer des clones majoritaires. Une solution est de décaler la fenêtre #1580 (closed) (soit en encodant directement le décalage, dans la config, mais cela signifie que c'est systématique, soit dynamiquement mais c'est compliqué).

Une autre solution simple serait de prendre une fenêtre plus petite si on n'arrive pas à placer la fenêtre de 60nt. On pourrait essayer différentes longueurs, par ordre décroissant, par seuils (60, 50, 40, 30…) et on prend la première qui passe. Cela permet d'avoir quelque chose de reproductible. Et cela éviterait de passer à côté d'un gros clone.