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Issue created Aug 29, 2017 by Mikaël Salson@mikael-sOwner

# Custom dans certaines séquences germinales

Dans le script split-from-imgt.py on a un bout de code qui ajoute # Custom à la fin des séquences. Cela pose problème pour l'export FASTA, pour l'affichage des séquences germinales dans le segmenteur et éventuellement pour les logiciels d'analyse qu'on utilise.

→ à mettre dans le header (les commentaires ne sont pas standards dans le FASTA)

    if seqs in CUSTOM_118:
        print "# Custom 118 position in %s" % seq
        pos = CUSTOM_118[seqs]
        seq =  seq.replace('\n', " # Custom\n")
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