Vidjil ne fonctionne pas lorsque lancé depuis le contrôleur segmenter.py
Je n'arrive plus à faire fonctionner le ~"segmenter-app" : quand j'envoie une séquence Vidjil échoue avec le message :
terminate called after throwing an instance of 'std::bad_alloc'
what(): std::bad_alloc
Aborted (core dumped)Il y a d'ailleurs un étrange (using a MapKmer to fit into memory) au milieu du chargement des germlines.
Ok il peut y avoir un bug dans Vidjil, mais ça me le fait avec plusieurs séquences et le bug ne se produit pas lorsque je lance Vidjil avec la même ligne de commandes, en tant que www-data. Avez-vous une idée de ce qui pourrait y avoir d'autre qui change entre un lancement via os.system et un lancement directement en ligne de commande ?