CD et autres choses utiles pour l'immuno en RNA-Seq

(splité depuis "Classes des Ig en RNA-Seq" #2261 (closed) ?)

On ne va pas devenir un outil générique de mapping...

... néanmoins, est-ce que cela ne vaudrait pas le coup de détecter qui pourraient arriver en RNA-Seq ? (voire en capture, cela dépend du protocole)

Par exemple au moins les CD3, CD4, CD8, CD19, CD45RA/CD45RO... ou d'autres...

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Cela est fortement tentant d'avoir une méthode de segmentation qui fait... uniquement du mapping sur des gènes connus #1724 (closed). Hum, c'est interdit par la doxa de Vidjil (recombinaisons)... mais l'intérêt serait toujours de suivre des populations et des ratios (par exemple, un pseudo-germline avec tous les CDx, et les ratios seraient intéressants).