Issues · vidjil / vidjil · GitLab

UNSEG strand sur >5% des reads

#4054 · opened Nov 21, 2019 by Mathieu Giraud bio-analyze-more
- 2
updated Nov 27, 2019
Clones with different analyses at diagnosis and follow-up

#4024 · opened Oct 28, 2019 by Mathieu Giraud Boldrini-Brasil bio-analyze-more doc
- 0
updated Oct 28, 2019
Lymphotrack retourne un IGH que nous ne trouvons pas

#3977 · opened Sep 10, 2019 by Thonier Florian BRU-Bruxelles bio-analyze-more
- 4
updated Sep 10, 2019
Comparer dans le client beaucoup de samples d'un coup

#3895 · opened Apr 03, 2019 by Mathieu Giraud !-reflexion bio-analyze-more bio-barcodes-umi client-speed client-ugly client-views feature
- 8
updated Dec 13, 2019
Clone en R2 perdu en R1+R2 (+R2)

#3833 · opened Mar 19, 2019 by Mathieu Giraud Mar 29, 2019 !-important TOU-Toulouse bio-analyze-more com-vw-vidjil-workshop server-pre-process
- CLOSED
- 1
- 11
updated Mar 28, 2019
IKZF1/ERG : Beaucoup de choses unexpected

#3536 · opened Oct 09, 2018 by Mikaël Salson *-go bio-analyze-more bio-germlines-pseudo
- 2
updated Oct 10, 2018
Sortir un alignement multiple de reads d'un clone

#3305 · opened Jun 25, 2018 by Mikaël Salson bio-analyze-more bio-control cpp-representative feature
- 3
updated Mar 08, 2019
La recherche de recombinaisons inattendues n'utilise pas les version +up et +down des germlines

#3214 · opened May 03, 2018 by Mikaël Salson Algo 2019.05 LIL-Lille bio-analyze-more bio-germlines-pseudo cpp
- 1
- 2
updated Mar 14, 2019
Ikaros : les séquences communiquées sont trop longues, voir ce qu'il faut garder

#3165 · opened Apr 11, 2018 by Mikaël Salson Algo 2019.05 PAR-Debré bio-analyze-more bio-germlines-pseudo
- 12
updated Mar 19, 2019
Comment organiser les recombinaisons vdj mediées

#3104 · opened Mar 23, 2018 by Thonier Florian !-reflexion bio-analyze-more bio-germlines bio-germlines-pseudo client doc
- CLOSED
- 2
updated Aug 07, 2018
Séquence non analysée avec la présence du gène constant

#2964 · opened Dec 20, 2017 by Anne de Septenville Algo -- Important !!-bug !-reflexion bio-analyze-more bio-rnaseq cpp cpp-heuristic
- 9
updated Nov 27, 2019
Diminuer ou décaler dynamiquement, par seuil, la taille de la fenêtre

#2913 · opened Nov 29, 2017 by Mikaël Salson Algo 2017.11 !-important !-reflexion bio-analyze-more cpp cpp-heuristic
- CLOSED
- 1
- 2
updated Apr 09, 2018
Clone manqué avec une grosse délétion (read trop court pour la fenêtre)

#2910 · opened Nov 29, 2017 by Anne de Septenville Algo 2017.11 !-important +-deploy Paris-Pitié bio-analyze-more cpp cpp-heuristic
- CLOSED
- 8
updated Apr 10, 2018
Pouvoir effectuer des analyses de translocations sur des séquences arbitraires

#2818 · opened Nov 21, 2017 by Ryan Herbert PAR-Debré bio-analyze-more bio-germlines com-vw-vidjil-workshop user-request
- 4
updated Apr 03, 2019
Délétions Vleft / Jright : documenter, intégrer, nouvel axe 0 of 3 tasks completed

#2507 · opened Jun 01, 2017 by Mathieu Giraud Web 2017.09 bio-analyze-more client client-axis feature
- CLOSED
- 2
- 3
updated Oct 19, 2017
Pas assez de clones pour des études de répertoire

#2506 · opened Jun 01, 2017 by Mathieu Giraud REN-Rennes bio-analyze-more
- 1
updated Apr 08, 2019
Plusieurs recombinaisons dans une séquence

#2318 · opened Apr 04, 2017 by Mathieu Giraud bio-analyze-more bio-germlines-pseudo bio-paired-chains client cpp cpp-heuristic repseq-IMGT
- 6
updated Apr 09, 2019
Segmenter et MiXCR: on ne voit pas les CDR3, ni les bords V/J précis

#2288 · opened Mar 22, 2017 by Mathieu Giraud bio-AA bio-analyze-more client client-segmenter repseq-Shugay repseq-formats repseq-mixcr
- 2
updated Sep 27, 2017
Fort pourcentage de séquences non assemblées par PEAR

#2242 · opened Mar 09, 2017 by Mikaël Salson Paris-Pitié bio-analyze-more server-pre-process
- 4
updated Jan 21, 2019
Faut-il afficher 1000 clones dans le client sur un échantillon ?

#2236 · opened Mar 09, 2017 by Mathieu Giraud Paris-Pitié bio-CLL bio-analyze-more client feature
- 9
updated Apr 08, 2019

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