Longueur des reads d'un clone (distribution des longueurs par fenêtre) : Stats/BinReads
- moyenne, médiane ? distribution ?
- pour les représentatives, jeux d'entrées... ?
- objet générique (à la bucket ?)
L'objet existe : c'est core/stats.cpp. On pourrait le compléter (ou, mieux, le sous-classer) pour faire les stats voulues, déjà un histogramme.
Tiens, une vieille tâche qui traînait :)
On aimerait dans Stats récupérer aussi un histogramme... mais c'est une fonctionnalité de BinReadStorage.
Bref, ne faudrait-il pas virer stats.cpp et utiliser directement BinReadStorage pour faire des stats ? (en ayant une sous-classe qui ne stocke pas les reads, mais juste l'info de longueur).
(Attention, stats sert à faire des moyennes de longueur de reads, mais aussi d'autres choses, mais cela devrait être générique)
Je suis pas sûr, mais j'essaie de me lancer dessus…
@nobody