Permettre de ne lancer que certains germlines d'un fichier .germlines
Actuellement on a la possibilité de préciser soit un fichier .germlines dont tous les locus spécifiés seront analysés (sauf les incomplets si on n'a pas l'option -i), soit l'ensemble des fichiers « V » et l'ensemble des fichiers « J » (et éventuellement D) sur la ligne de commande. Dans ce dernier cas, il s'agit d'un germline « custom » qui n'est donc pas assimilé à un germline reconnu et n'a pas d'espèces.
Il serait pratique de ne pouvoir sélectionner que quelques germlines au sein d'un fichier .germlines. Par exemple si je veux analyser les kappa avec les incomplets je pourrais faire -g germline/homo-sapiens.germlines -? IGK,IGK+ (où le ? est à remplacer par une lettre adéquate). Si je voulais préciser les fichiers V et J sur la ligne de commande, je perdrais la possibilité de séparer les complets des « inhabituels »