Coûts du FineSegmenter et documentation de -f
@flothoni, à propos d'une réponse à Aurélie :
Par contre je ne comprend pas a quoi correspondent les valeurs
9999
dans les paramètres. rappel sur le scoring :-f <string> use custom Cost for fine segmenter : format "match, subst, indels, homo, del_end" (default (4, -6/-10/-10, -9999-9999/-9999-9999, -1, -2) 0.05/0.346574 )
algo/core/dynprog.cpp: 91
: Le -9999
est un « moins l’infini », et ce n’est pas très propre. Ici, ce sont les valeurs pour des indels avec gap open/extend (pas utilisé pour le FineSegmenter, mais utilisé pour le « align » depuis le browser (align.cgi
))
- le message d'aide en ligne devrait être plus cohérent avec ce que prend
-f
- Le
-9999
ne devrait pas être affiché comme tel.