Merge reads et .fasta
Échange entre Shun et Mikaël :
The read merging failed because you provided FASTA files. When merging reads, you should provide FASTQ files only. We should specify that limitation more clearly. You cannot provide FASTA files if you want to merge the reads.
On devrait pouvoir utiliser le merge même avec des .fasta (quitte à faire un .fastq bidon). En attendant, j'ai renommé la config pre-process en "Merge paired-end reads (+R2) [only .fastq / .fastq.gz files]".