Avoir une interface pour le FineSegmenter d'un petit nombre de clones
Est-ce que cela serait utile d'avoir un serveur public permettant, sans aucun compte ni enregistrement, de lancer un FineSegmenter sur < 100 séquences ? Pas d'upload obligé, juste un textarea POST/GET où on met ses séquences, éventuellement avec une API.
(Uniquement la segmentation, sans le browser derrière, ou même avec le browser ?)
Cela pourrait aider les gens qui ont juste une séquence ou deux à tester (de la même manière qu'on se sert nous d'IgBlast ou IMGT/V-QUEST).
Et à côté de chaque segmentation on pourrait avoir une petit icone pour demander aux utilisateurs s'ils sont satisfaits de la segmentation proposée. Dans le cas contraire on leur demande ce qu'ils s'attendaient à avoir et on génère un should-vdj automatiquement :)
Yeah.
C'est donc Marc qui s'y colle, en lien avec ce qu'il fait dans task.py pour supprimer fuse_server et avoir quelque chose de plus robuste avec les workers. Merci !
Mentionné au cours d'un échange de mail avec Nikos
Hier, Michaela demande exactement cela, et souvent elle crée un fichier .fa juste pour une séquence venant de Sanger, l'uploade... voir aussi "Créer un nouveau clone artificiel"
Rando 2016 : ébauche faite par Marc. Tu peux pousser ?
Marc, peux-tu pousser ce que tu as fait ? merci.
ping. Mentionné par Aurélie/Nathalie, leur envoyer l'adresse
Voir aussi "Le -c segment devrait sortir un .vidjil"
https://app.vidjil.org/vidjil/segmenter
ok. Tâche décomposée en plusieurs tâches pour les améliorations futures.