Envoyer des clones à BLAST : plusieurs clones
Quand on en a plusieurs clones sélectionnés, cela ouvre plusieurs onglets (dangereux si on a 20 ou 50 clones sélectionnés)... et chez moi, seul le premier onglet marche, les autres sont en erreur
Est-ce que l'API permet d'envoyer plusieurs séquences d'un coup, et de garder les choses propres sur un onglet ?
On peut sinon créer un fichier fasta (on a tout ce qu'il faut de notre côté), et l'envoyer d'un coup à Blast ?
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Doc/node68.html Apparement avec QUERY_FILE on peut soumettre un fichier, mais c'est que avec MegaBlast. À voir...
Si, cela doit être possible même pour Blast... en fait l'API a l'air d'être la même que quand on remplit un formulaire (en POST cela pourrait passer, peut-être) via http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch Et cela a l'air d'être simplement un QUERY.
J'avais commencé a regarder ça hier pour le faire par post justement, mais ça me semblait compliqué plus compliqué que l'api. Je vais regarder si on peut fournir le fichier même hors megablast. D'ailleur, une contre indication pour megablast ? Si on a un gros jeu de séquence c'est peut-être préférable