Documenter le format should-vdj
Garry (?) était prêt à nous faire du .should-vdj. garry.wright@ nhs (?)
Stabiliser le format (peut-être en rediscuter avant avec Yann), et lui envoyer une doc.
Yann met des - devant le nombre de délétions et ne spécifie pas la séquence nucléotidique des insertions du coup plutôt que d'avoir >TRDV202_14/TCCCGGCCT/0_TRDD301_3/CCACGGC/4_TRAJ2901__VdJa (should-vdj), Yann donnerait >TRDV202 -14/9/-0_TRDD301_-3/7/-4_TRAJ2901__VdJa
Pfff, c'est pas très beau, les "-"... mais bon, on peut être souple et les enlever si besoin. Idem pour transformer les " " en "_".
Les deux espaces " " ou "__" sont un peu limite, on devrait être indépendant par rapport à cela. Mettre un symbole en plus, type @TRB ? (Ce qui permet vraiment de virer les "_" et de mettre un nombre quelconque de " ").
Ou rien du tout et on se débrouille pour parser derrière ?
On devrait aussi être flexible et accepter aussi bien 3/CCACGGC/4 (forme préférée) que 3/7/4.
On a un beau format, on pourrait le documenter. Cela irait parfaitement avec la release 2015.10.